2013年广西分离株H9N2亚型禽流感病毒全基因组特性分析

发布时间：2018-03-28 18:49

  本文选题：HN禽流感病毒　切入点：HN禽流感病毒　出处：《中国病原生物学杂志》2017年01期

【摘要】：目的对2013年从广西分离的H9N2亚型禽流感病毒进行全基因测序,并分析其基因组和遗传进化特性,为进一步研究H9N2禽流感病毒的致病机制提供科学依据。方法运用RT-PCR方法克隆广西分离株H9N2亚型禽流感病毒8个基因片段,进行全基因测序,对测序结果进行序列比对和遗传进化分析。结果序列比对分析表明,H9N2亚型分离株的HA序列裂解位点为RSSR↓GLF,受体结合位点为YWTNKLY且发生Q226G和G228R双重位点突变,NA耐药相关位点发生3处突变(E119V,R292W和R294G),M2蛋白跨膜区存在S31N变异;编码内部蛋白的6个基因与同年H7N9亚型分离株相似度为90.9%~97.6%。其分子遗传进化关系属于欧亚种系,其中HA基因属于Y280亚系,M基因属于G1亚系,PB2基因属于Korea亚系,PB1、PA、NA、NP和NS属于SH/F/98亚系。结论2013年广西分离株是由4种不同H9N2亚型禽流感病毒亚系发生自然重排的产物,属于低致病性禽流感病毒,但对抗流感药物存在一定耐药性,故应加强对禽农场中H9N2病毒流行株变异趋势和传播风险的监测。
[Abstract]:Objective to sequence the whole gene of H9N2 subtype avian influenza virus isolated from Guangxi in 2013 and analyze its genome and genetic evolution characteristics. Methods eight gene fragments of H9N2 subtype avian influenza virus isolated from Guangxi were cloned by RT-PCR method and sequenced. Sequence alignment and genetic evolution analysis showed that the HA cleavage site of H9N2 subtype isolate was RSSR. 鈫揋LF, the receptor binding site was YWTNKLY and the Q226G and G228R double loci mutation and na resistance-related sites were found. There were S31N mutations in the transmembrane region of E119V, R292W and R294GUM 2 protein. The similarity between the six genes encoding the internal protein and the H7N9 subtype isolates of the same year is 90.90.97. 6. The molecular genetic evolution of these genes belongs to Eurasian lineage. Among them, HA gene belongs to Y280 subline, M gene belongs to G 1 subline, PB2 gene belongs to Korea subline PNA NP and NS belongs to SH/F/98 subline. Conclusion the isolated strain of Guangxi in 2013 is the product of natural rearrangement by four different H9N2 subtypes of avian influenza virus sublines. It is a low pathogenic avian influenza virus, but there is a certain drug resistance against influenza drugs, so it is necessary to strengthen the surveillance of the variation trend and transmission risk of H9N2 virus in poultry farms.
【作者单位】： 长春中医药大学;军事医学科学院军事兽医研究所;广西动物疫病预防控制中心;
【基金】：国家自然科学基金项目(No.31402175) 吉林省科技发展计划项目(No.20130522090JH)
【分类号】：S852.65

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