济南市章丘区鸭甲肝病毒的流行病学调查

发布时间：2020-03-20 05:34

【摘要】：鸭病毒性肝炎(Duck viral hepatitis,DVH)是一种由鸭的肝炎病毒引起的感染雏鸭的急性高度致死性的疾病。其中,导致该病发生流行的主要的原因之一为鸭甲肝病毒(Duck hepatitis A virus,DHAV)。它主要感染1-3周龄的雏鸭,死亡率高达90%。DHAV被国际上分为三个主要的血清型:DHAV-1、DHAV-2和DHAV-3,而三种血清型之间几乎没有交叉反应。DHAV有两个非编码区,位于两端,一个开放型阅读框(ORF区)位于两个非编码区的中间,最终能够形成12个成熟的不同类型的蛋白,依次为VP0-VP3-VP1-2A1-2A2-2A3-2B-2C-3A-3B-3C-3D。其中,VP1是衣壳蛋白的主要成分,可刺激机体产生保护性抗体。VP1基因的核苷酸序列是DHAV基因组中的高度可变区,可作为DHAV基因型研究的标记,并可以此序列来区分病毒的血清型。为了更好地了解山东省济南市章丘区DHAV流行情况,自2018年以来,从章丘地区明水、双山等8个章丘区镇街采集疑似DHAV病料26批次,进行了发病的情况调查、病毒的分离鉴定、DHAV VP1基因的研究分析等工作。通过对章丘不同地区采集的疑似DHAV病例发病情况调查显示,发病主要集中在4周龄以下的雏鸭,且没有明显的季节性,一年四季均可发生,其中秋冬两个季节发病率较高。临床的主要症状为:有神经症状、精神沉郁、头震颤、站立不稳、瘫痪等,死亡的鸭子也会呈现角弓反张症状;剖检发现肝脏肿大,表面有斑点样或者针尖状出血,其他器官也有不同程度地出血。将这26批病料进行病毒检测,检测到15批次DHAV病毒为阳性,DHAV的阳性检出率达到57.7%,其中感染DHAV-1的为5批次,感染DHAV-3的为6批次,DHAV-1和DHAV-3混合感染的为4批次。济南市章丘区7个主要养鸭区域均存在DHAV的流行,多数区域存在DHAV-1和DHAV-3的共流行。通过对结果分析得知,DVH的发病日龄趋于上升态势,且28日龄以上发病鸭均为DHAV-1和DHAV-3的混合感染。本研究对济南市章丘区分离的DHAV阳性毒株进行VP1基因扩增并测序,共得到9株DHAV-1VP1基因核苷酸序列,10株DAHV-3VP1基因核苷酸序列,与NCBI上已经登录的17株DHAV的VP1基因核苷酸序列进行比较,构建了相应的进化树进行基因遗传分析,对DHAV-1和DHAV-3的同源性进行分析比较。结果显示,进化树上DHAV-1和DHAV-3分为两个明显的分支。其中9株DHAV-1 VP1基因之间的核苷酸同源性为90.6%-99.9%,与NCBI上登录的8株DHAV-1毒株的同源性为94.6%-99.9%;10株DHAV-3 VP1基因之间的核苷酸同源性为93.1%-99.9%,与NCBI登录的9株毒株的同源性为89.3%-99.4%,而且DHAV-3分离株的VP1基因存在明显的地域性特点。此研究对济南市章丘区鸭甲肝病毒流行病学的发展提供了有效的科学防控措施,同时对治疗也提供了理论依据。
【图文】：

济南市章丘区鸭甲肝病毒的流行病学调查文库，但均未能成功。直到 2006 年，台湾学者根据小 RNA 病毒的保守区域设计多对引物分段扩增，成功得出了多组全基因组序列。随后研究中发现对于 DHAV 来说，DHAV-1和 DHAV-3 基因组长度相似，都约为 7700bp 大小，是一条不分节段的单股正链 RNA，结构模式图如 1-1 所示：

图 1-1 DHAV 病毒基因组结构示意图Fig. 1-1 DHAVgenome structure conceptual diagram如图所示，，DHAV 由四部分组成，5’非编码区（untranslated region, UTR），一个的开放阅读框（open-reading frame, ORF），3’非编码区和 poly(A)尾。5’UTR 长约 626没有帽子结构，含有病毒翻译起始所必需的内部核糖体进入位点。3’UTR 长约 314可形成发夹结构，poly(A)尾巴在 15～23nt 之间，3’UTR 在 RNA 的复制过程中起要作用，3’UTR 与病毒的复制过程相关这是小 RNA 病毒共同的特征（Rohll et 1995）。一般来说 3’UTR 含有专门负责整个 RNA 复制起始的顺式作用信号（ori Rori R 是一个多区域、大范围的结构域，体现在保守的二级结构和三级结构上（Beardal., 2000）。1.2.4.2 DHAV 蛋白的功能DHAV 多聚蛋白具有 11 个可以自行切割的位点，多聚蛋白在翻译过程中经过 3裂解，如图 1-2 所示：
【学位授予单位】：山东农业大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2019
【分类号】：S858.32

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本文编号：2591336