秦川肉牛脂肪组织高表达长链非编码RNA的筛选鉴定及其表达特异性的探究

发布时间：2020-04-13 22:56

【摘要】：牛肉以其高蛋白低胆固醇的特点受到消费者的欢迎,其中影响牛肉的适口性的牛肉嫩度是决定消费者选择的关键因素。牛肉的嫩度很大程度上受肌内脂肪含量影响,促进肌间脂肪生成可以增加大理石花纹,减少肌纤维含量,从而提高牛肉嫩度。牛的脂肪生成是个比较复杂的过程,受到各种调控因子、作用通路的作用。近来许多研究发现长链非编码RNA(lncRNA)在调节脂肪细胞发育中也起着关键作用,但目前此类研究主要集中在临床医学上,在肉牛脂肪发育方面对于长链非编码RNA的研究并不多,这便突出了此方向研究的必要性。本试验利用转录组测序技术,以西北农林科技大学国家肉牛改良中心选育的秦川牛肉用新品系(简称“秦川肉牛”)为研究对象,分析并筛选了在秦川肉牛背最长肌、皮下脂肪、心脏、肝脏、脾脏、肾脏、肺、皱胃八个组织中,只在脂肪组织中特异性表达的长链非编码RNA,并利用实时荧光定量PCR技术在秦川肉牛初生犊牛脂肪、肌肉、心脏、肝脏、脾脏、肾脏、肺、大肠、小肠、瘤胃、网胃、瓣胃、皱胃、睾丸共14个组织中进行验证。在经过鉴定的长链非编码RNA中,我们选择在脂肪组织中表达量最高,特异性最强的长链非编码RNA39520进行下一步研究,即探究长链非编码RNA39520在秦川牛初生犊牛以及6月龄、12月龄、18月龄、24月龄、60月龄秦川肉牛脂肪组织中表达情况,以及在诱导分化的秦川肉牛前体脂肪细胞中0d、3d、6d、9d、12d的表达情况。本研究有如下结果:1.对秦川肉牛初生犊牛背最长肌、皮下脂肪、心脏、肝脏、脾脏、肾脏、肺、皱胃八个组织进行采样,进行转录组测序并对测序数据进行质量分析,结果表示约90%的reads可以比对到参考基因组上,99%的数据为高质量数据,所以我们可以肯定所得测序数据真实可靠,可以用于下一步的研究。2.经测序得到这些reads在基因组位置、在染色体上分布情况以及表达水平和表达差异性。3.得到了在各个组织中表达的长链非编码RNA。通过对长链非编码RNA表达差异性以及表达水平的研究,发现了在脂肪组织中特异性表达的17个长链非编码RNA。4.长链非编码RNA39520在秦川肉牛初生犊牛、6月龄、12月龄的脂肪组织中表达量逐渐升高,在12月龄秦川肉牛脂肪组织中表达量达到最高,此后有所波动,在秦川肉牛初生犊牛脂肪组织中表达量最低。5.长链非编码RNA39520在诱导分化的秦川肉牛前体脂肪细胞的第0至3天表达量逐渐升高,在第三天达到最高,并且与第0天、第12天成绩显著差异,此后表达量逐渐降低。综上,本研究成功筛选并鉴定了在秦川肉牛脂肪组织中特异性表达的长链非编码RNA,并揭示了长链非编码RNA39520在不同时期秦川肉牛脂肪组织及诱导分化的秦川肉牛前体脂肪细胞中的表达特点,为下一步研究其功能奠定基础。
【学位授予单位】：西北农林科技大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2018
【分类号】：S823.5

【参考文献】