鸭坦布苏病毒病病原学特性及其防治研究
【学位单位】:江西农业大学
【学位级别】:硕士
【学位年份】:2018
【中图分类】:S852.65
【部分图文】:
预测基本相符,结果见图 1。将扩增的片段纯化进行回收(1%琼脂凝胶纯化),克隆到 pEASY-B 载体中,对每个扩增的片段,挑选 3 个阳性克隆送生物技术公司测序。图1病毒YF 株基因组的扩增Figure 1 genome amplification of YF strain of virusM:DNA分子量标尺;1-8:YF毒株基因组各扩增片段3.1.2 序列比对结果序列分析表明,该株病毒全基因组全长 10990nt,未出现核苷酸插入或缺失及基因重组的变异情况,与已报道的 DTMUV 分离株的核苷酸同源性均在 98.5%以上,且亲缘关系与当前鸭群中优势病毒亚群非常近。
表3 坦布苏病毒信息及序列同源性比对结果Table 3 Tembusu virus information and sequence homology comp毒株GenBankID宿主YF 株 (%)毒株GenBankID核苷酸氨基酸ZD/2010 JQ595407鸭 99.2 99.0JXSP JQ920423andong1 JX965381鸭 99.3 99.4Du/CH/LSD/110128KC136210MH220 JQ928189鸭 99.3 98.6ZJ-6 JF459991J-407 JQ314464鸭 99.3 99.0byd1 JQ920420YY5 JF270480鸭 99.2 99.1TA JQ289550JS JQ920422鸭 99.4 99.2WR JX196334JS804 JF895923鹅 99.3 98.7JX2 JQ920426goose JQ920424鹅 99.4 99.6duan JQ920421J GH-2 JQ314465鹅 99.1 99.0JS/2010 JX273153S-PT-7 JQ627864鹅 99.4 99.8WJ-1 JX549382itiawan JX477686肉鸡 87.2 96.2MM 1775 JX477685
鸭坦布苏病毒病病原学特性及其防治研究16图3 基于病毒E蛋白(A)和NS5基因(B)的分子进化分析FIG. 3 molecular evolution analysis based on virus E protein (A) and NS5 gene (B)黑三角(▲)标注的毒株为本试验分离的毒株,图中树结处的阿拉伯数字为自举检验置信值(1,000次重复)以上果表明,在宜丰发病场采集的病料中分离到了鸭坦布苏病毒。鸭群中流行的鸭坦布苏病毒存在 2 个病毒群,但主要以 II 群的病毒为主,其中 II-C 亚群的毒株为流行的优势病毒群。本研究分离获得的江西分离株(YF 株)基因组与已报道的高度同源,遗传稳定,没有出现核苷酸的缺失或插入,未发生基因重组现象。基于 YF 株全基因组的系统进化分析表明,YF 株与鸭群中流行的 II-C 谱系病毒群亲缘关系最近,这与基于 YF 株病毒 E 蛋白及 NS5 蛋白编码基因的遗传进化分析结果一致
【参考文献】
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本文编号:2812667
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