荷斯坦奶牛炎症相关基因多态性及其与DHI生产性能的关联分析

发布时间：2020-10-22 06:08

　　 奶牛乳房炎是奶牛常见的一种疾病,对奶牛生产影响极大,会导致奶源产量和质量下降,进而影响养殖场收益,同时还会危害消费者的身体健康。而药物的使用不仅影响牛奶品质,也会导致细菌产生耐药性,因此需要通过对抗病基因的研究来降低奶牛乳房炎的发病率,降低奶牛饲养的经济成本,提高奶牛的生产性能。本试验通过对牛群炎症相关基因的SNP研究及其与奶牛牛群改良(DHI)生产性能的关联分析,在基因水平上寻求有效的奶牛分子标记位点,为降低牛群乳房炎发病率奠定基础。本研究以某牛场645头荷斯坦奶牛血液DNA为研究材料,用直接测序法、PCR-RFLP法、SSCP法对调控奶牛乳房炎相关的候选基因白细胞介素8(IL-8)、趋化因子受体1(CXCR1)、趋化因子受体2(CXCR2)、Toll样受体2(TLR2)和Toll样受体4(TLR4)的基因多态性(SNP)进行检测,计算SNP位点的遗传参数,并用SPSS22.0软件进行SNP位点与奶牛生产性能的的关联分析。结果如下:IL-8研究发现g.202 CT、g.264 CT、g 1892 AC、g.1939 GA、g.2103 CT、g.2209 TG、g.2222 GA这7个连锁突变SNP位点。以g.202 CT位点进行关联分析,发现CC型的305天产奶量和乳蛋白率显著高于TC型和TT型(P0.05);CXCR1研究发现g.295 CT、g.337 TC、g.341 GA、g.369 TC、g.646 GA、g.652 GT、g.739 CG、g.823 GA这8个SNP位点。对测序结果分析后,g.646 GA和g.823 GA位点进行关联分析,发现g.646 GA位点AA型的305天乳脂量、产奶量、乳蛋白量和乳蛋白率极显著高于AG型和GG型(P0.01);g.823 GA位点AG型的305天产奶量和乳蛋白量极显著高于GG型(P0.01),AG型的305天乳脂量显著高于GG型(P0.05)。CXCR2研究发现g.13783 GA、g.13895.GA、g.14444 AG和g.14476 TC这4个突变位点。对其进行关联分析后,g.13783 GA、g.14444 AG和g.14476 TC位点进行关联分析,发现g.13783 GA位点GG型的305天乳脂量、产奶量和乳蛋白量极显著高于AG型(P0.01),而AG型的乳蛋白率极显著高于GG型(P0.01);g.14444AG位点AG型的305天产奶量和乳蛋白量极显著高于GG型(P0.01),AG型的305天乳脂量显著高于GG型(P0.05);g.14476 TC位点TT型的305天乳脂量、产奶量和乳蛋白量极显著高于TC型(P0.01),而TC型的乳蛋白率极显著高于TT型(P0.01)。TLR2研究发现g.10508 GA这1个突变位点。对其进行关联分析,发现AA型的乳脂率显著高于AG和GG(P0.05),AA型和AG型乳蛋白率显著高于GG型(P0.05)。TLR4研究发现g.245 GC、g.5987 AG和g.9422 CT这3个突变位点。对其进行关联分析,发现g.245 GC位点CC型的乳脂率极显著高于GC型和GG型(P0.01),GC型的乳脂率极显著高于GG型(P0.01)。g.5987 AG位点AA型和AG型的体细胞数极显著高于GG型(P0.01)。g.9422 CT位点CC型和CT型的305天产奶量显著高于TT型(P0.05);TT型的乳脂率极显著高于CC型和CT型(P0.01)。通过对IL-8、CXCR1、CXCR2、TLR2和TLR4基因多态性的检测及其与DHI生产性能关联分析,检测到突变位点有10个:IL-8基因的g.202 CT位点、CXCR1基因的g.646 GA和g.823 GA位点、CXCR2基因的g.13783 GA、g.14444 AG和g.14476 TC位点、TLR2基因的g.10508 GA位点、TLR4基因的g.245 GC、g.5987AG和g.9422 CT位点。其中新发现的可用于分子标记位点来选育抗乳房炎的奶牛的位点有3个:IL-8基因的g.202 CT位点、CXCR2基因的g.14476 TC位点和TLR4基因的g.245 GC位点。
【学位单位】：安徽农业大学
【学位级别】：硕士
【学位年份】：2018
【中图分类】：S858.23
【部分图文】：

2 结果 质量检测量紫外分光光度计检测μL 的 DNA 样品在超微量紫外分光光度计上检测 OD260/OD280值，比间，表明所提的 DNA 纯度较高，符合要求，可进行后续试验。糖凝胶电泳检测的琼脂糖凝胶电泳法检测所提的基因组 DNA 条带，所提基因组 DNA合要求，可以进行后续试验。如图 2-1。

图 2-2 IL-8 基因引物 P1的 PCR 产物琼脂糖凝胶电泳检测Fig. 2-2 Detection of PCR products of primer P1of IL-8 gene using agarose electrophoresis注：M：DNA Marker; 1-9:PCR 扩增产物Note: M：DNA Marker; 1-9:PCR amplified products图 2-3 IL-8 基因引物 P2的 PCR 产物琼脂糖凝胶电泳检测Fig. 2-3 Detection of PCR products of primer P2of IL-8 gene using agarose electrophoresis

性扩增良好且没有明显的非特异性条带，故符合要求，可以进行后续试验。图 2-2 IL-8 基因引物 P1的 PCR 产物琼脂糖凝胶电泳检测Fig. 2-2 Detection of PCR products of primer P1of IL-8 gene using agarose electrophoresis注：M：DNA Marker; 1-9:PCR 扩增产物Note: M：DNA Marker; 1-9:PCR amplified products
【参考文献】

相关期刊论文 前10条

1 王雅春;孙飞舟;张胜利;刘海良;张沅;;奶牛良种补贴项目实施10年 遗传改良工作长足发展[J];中国畜牧杂志;2015年14期

2 黄红丽;姜艳华;谢琴;;TLR4和TNF-α在妊娠期糖尿病胎盘中的表达及意义[J];中国医学工程;2015年04期

3 邹佳芮;李墨林;李连宏;;IL-8与乳腺癌关系的研究进展[J];临床与实验病理学杂志;2014年03期

4 李瑶;吕德官;陈临溪;;IL-8及其受体药物与疾病的研究进展[J];中国药理学通报;2014年03期

5 张美荣;廖想想;陈丹;毛永江;刘坤;陈亮;王杏龙;杨章平;杨利国;;澳系进口荷斯坦奶牛CXCR1基因遗传多态性与泌乳性状及体细胞评分的关联性分析[J];中国兽医学报;2014年01期

6 韩忠燕;王健;;中性粒细胞CXCR1、CXCR2活化及其信号传导[J];中国微生态学杂志;2013年08期

7 张沅;;奶牛遗传改良——牧场效益的重要基础[J];中国乳业;2013年01期

8 李宏俊;高小玉;裴爱君;;海洋生物单核苷酸多态性基因分型技术的研究进展[J];生物技术通报;2012年08期

9 赵书强;;奶牛乳房炎的临床防治[J];河南畜牧兽医(综合版);2012年06期

10 张莉;李太山;;奶牛乳房炎及子宫内膜炎诊治[J];山东畜牧兽医;2012年05期

相关博士学位论文 前4条

1 牟瑞营;植物乳杆菌对奶牛乳腺炎的预防作用的研究[D];吉林大学;2017年

2 高雪娇;硒对金黄色葡萄球菌性乳腺炎发生的影响及调控机制研究[D];吉林大学;2017年

3 刘钢;奶牛乳房炎源性浅绿气球菌的表型、基因型和致病机制研究[D];中国农业大学;2017年

4 王兴平;奶牛TLR4及其信号转导基因的克隆、SNPs检测与乳房炎的关联分析[D];西北农林科技大学;2007年

相关硕士学位论文 前9条

1 熊文斌;奶牛乳房炎对血液相关指标和乳汁性状的影响及致病菌的调查[D];扬州大学;2017年

2 王雪;CXCR1/2拮抗剂iP10联合顺铂对小鼠H22肿瘤的作用研究[D];大连医科大学;2017年

3 吴肖肖;荷斯坦奶牛CXCL8基因SNPs检测及其与乳房炎和产奶性状的关联分析[D];西北农林科技大学;2016年

4 齐宏亮;正常奶牛和临床型乳腺炎患牛乳腺间质成纤维细胞生物学特性对比研究[D];西北农林科技大学;2015年

5 张亚琴;运用多座位外显方差法分析荷斯坦牛候选基因与乳房炎易感性的关系[D];扬州大学;2012年

6 马永升;鸭TLR2基因多态性及其与免疫性能的相关研究[D];南京农业大学;2009年

7 田璐;LPS对小鼠乳腺组织中功能受体TLR4表达的影响[D];南京农业大学;2009年

8 平富强;CXCR2基因多态性及其与奶牛乳房炎和乳品质的关联研究[D];四川农业大学;2007年

9 罗冰;小鼠肿瘤细胞TLR2的表达及其生物学意义[D];第一军医大学;2006年

本文编号：2851211