青海牦牛内阿米巴原虫和芽囊原虫的种类分布及其种群结构分析

发布时间：2020-10-23 15:31

　　 内阿米巴原虫(Entamoeba)和芽囊原虫(Blastocystis)是两种常见的人兽共患肠道寄生性原虫病的病原,均有广泛的宿主范围,并可在多个国家和地区造成大范围的流行,威胁社会公共卫生安全,一定程度上影响了畜牧业的正常发展。牦牛是一种罕见的可在高原地区冷酷环境中生存的动物物种,是青海广大农牧民主要的经济来源,与当地居民的衣、食、住、行都有着密不可分的联系。因此,了解青海省牦牛源Entamoeba及Blastocystis的种类分布及种群结构,对青海省牦牛中这两种病原的流行情况及针对性地防控有重要参考意义。利用普通PCR及套式PCR技术对青海省牦牛Entamoeba及Blastocystis的感染情况进行调查,获得测序结果后分别对这两种病原进行种系发育关系分析,得到以下结果:1.在对青海省7个市及自治州所采集的1 027份牦牛粪便样品进行Entamoeba的18S rRNA基因位点的扩增与测序结果表明,在青海采样地区的牦牛中检出阿米巴原虫的总感染率为36.32%(373/1027),其中,感染率最高的为果洛藏族自治州(56.58%),感染率最低的为海北藏族自治州(16.84%),这7个采样点之间的感染率差异显著(P0.05);在不同季节,感染率最高为夏季(45.63%),最低为冬季(21.67%),四个季节之间的感染率差异显著(P0.05);而在两个不同年龄段的宿主之间,感染率分别为39.58%(6月龄的牦牛)和36.16%(6月龄的牦牛),差异不显著(P0.05)。测序及种系发育关系分析结果显示,在373份阳性样品中,共有284份样品为Entamoeba bovis阳性,79份为Entamoeba sp.MG107/BEL阳性,8份为Entamoeba sp.RL2阳性,及2份Entamoeba sp.RL9阳性。其中,E.bovis为青海省牦牛感染Entamoeba的优势虫种。2.在对青海省7个市及自治州所采集的1 027份牦牛粪便样品进行Blastocystis的SSU rRNA基因位点的扩增与测序结果表明,在青海采样地区的牦牛中检出芽囊原虫的总感染率为27.07%(278/1027),其中,感染率最高的为海西藏族自治州(48.94%),最低的为海南藏族自治州(19.75%),这7个采样点之间的感染率差异显著(P0.05);在不同季节,感染率最高为夏季(32.68%),最低为春季(22.33%),四个季节之间的感染率无显著性差异(P0.05);而在两个不同年龄段的宿主之间,感染率分别为27.08%(6月龄的牦牛)及27.07%(6月龄的牦牛),差异不显著(P0.05)。测序及种系发育关系分析结果显示,在278份阳性样品中,共有170份样品为Blastocystis sp.subtype ST10亚型阳性,70份为ST14亚型阳性,38份为ST12亚型阳性。其中,Blastocystis sp.subtype ST10亚型为青海牦牛感染Blastocystis的优势亚型。
【学位单位】：西北农林科技大学
【学位级别】：硕士
【学位年份】：2019
【中图分类】：S852.7
【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
文献综述
    第一章 内阿米巴原虫和芽囊原虫的研究进展
        1.1 内阿米巴原虫的研究进展
            1.1.1 内阿米巴原虫的分类学及形态学
            1.1.2 内阿米巴原虫的生活史
            1.1.3 内阿米巴原虫的感染情况
            1.1.4 实验室检测阿米巴原虫的方法
        1.2 芽囊原虫的研究进展
            1.2.1 芽囊原虫的形态学及分类学
            1.2.2 芽囊原虫的生活史
            1.2.3 芽囊原虫的感染情况
            1.2.4 芽囊原虫的实验室检测方法
        1.3 本研究的目的和意义
试验研究
    第二章 青海省牦牛内阿米巴原虫种类分布及其种群结构分析
        2.1 材料
            2.1.1 样品来源
            2.1.2 主要试剂
            2.1.3 溶液配制
            2.1.4 主要仪器设备
        2.2 方法
            2.2.1 粪便基因组DNA提取
            2.2.2 内阿米巴原虫18S r RNA基因扩增
            2.2.3 PCR检测及序列测定
            2.2.4 序列校正与比对
            2.2.5 统计学分析
            2.2.6 种系发育分析
        2.3 结果
            2.3.1 内阿米巴原虫18S r RNA位点PCR扩增结果
            2.3.2 牦牛内阿米巴原虫感染率及分布情况
            2.3.3 牦牛内阿米巴原虫的种群结构分析
        2.4 讨论
        2.5 小结
    第三章 青海省牦牛芽囊原虫种类分布及其种群结构分析
        3.1 材料
            3.1.1 样品来源
            3.1.2 主要试剂
            3.1.3 溶液配制
            3.1.4 主要仪器设备
        3.2 方法
            3.2.1 粪便基因组DNA提取
            3.2.2 芽囊原虫SSU r RNA基因扩增
            3.2.3 PCR检测及序列测定
            3.2.4 序列校正与比对
            3.2.5 测序重叠峰样品的克隆及序列测定
            3.2.6 统计学分析
            3.2.7 种系发育分析
        3.3 结果
            3.3.1 芽囊原虫SSU rRNA位点PCR扩增结果
            3.3.3 牦牛芽囊原虫的感染率及分布情况
            3.3.3 牦牛芽囊原虫及内阿米巴原虫的混合感染情况
            3.3.4 牦牛芽囊原虫的种群结构分析
        3.4 讨论
        3.5 小结
结论
参考文献
致谢
作者简介

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本文编号：2853212