IL-1β对奶牛乳腺上皮细胞紧密连接的影响及作用机制
【学位单位】:西北农林科技大学
【学位级别】:硕士
【学位年份】:2018
【中图分类】:S858.23
【部分图文】:
LTA1、 2、3 和 LPS1、 2、3 分别代表正常对照组、LTA 处理组和 LPS 处理组的三个生物学重复。Fig 2-1. Clustering analysis of DEGs(A)LPS vs Control(.B)LTAvs Control(.C)LPS vs LTA. The red color represents the up-regulatedexpression of genes, while the green color represents down-regulated expression of genes. Gradient colorbarcode at the right top indicates log2(FPKM) value. Each row represents a gene and each columnrepresents a sample. Genes with similar expression value are clustered both at row and column level.Control 1, 2 and 3, LPS1, 2, and 3, LTA1, 2, and 3 mean three different biological repeats for each group.在热图中,LPS 处理组和 LTA 处理组和对照组相比有 10 个基因发生差异表达。其中两个差异表达基因LOC100297121 和LOC788523在LPS和LTA处理组均上调表达,没有共同下调表达的基因。另外,与对照组相比,其中有 8 个基因 CCL2, CCL20, CXCL2,CXCL3, CXCL5, CXCL6, IL-1β, 和 IFIT2 在 LPS 处理组中上调表达而在 LTA 处理组下调表达(图 2-2),这 8 个基因均为趋化因子或细胞因子。
图 2-3 KEGG 富集分析散点图ich factor 是在这一途径项中标注的不同表达的基因数与在此路径中标注的所有基因数的比意味着更强的强度。Q-value 代表优化的 p 值,越小代表越集中富集。 符号代表在三个处组中均有富集。Fig 2-3 Scatter plots for KEGG enrichment results.he Rich factor is the ratio of differentially expressed gene numbers annotated in this pathway terme number annotated in this pathway term. Greater rich factor means greater intensiveness. Q-valucted p value ranging from 0 to 1, and less Q-value means greater intensiveness. The symbol of indicates the enriched pathways shared with three pairs.18
(3)用荧光酶标仪分别在 493nm 激发光和 518nm 发射光下测定 FITC-葡聚糖不同梯度浓度的荧光强度,每个浓度测定 3 次,取 3 次测量的平均值,绘制 FITC-葡聚糖浓度与荧光强度标准曲线。(4)根据标准曲线计算不同透过时间下荧光强度,将 30min 下的未处理组设定为对照组,结果以各组与对照组的倍数显示。3.3.13 数据分析本章所涉及实验均重复 3 次,按照统计分析软件 SPSS 13.0 的单因素 ANOVA 和LSD 检验进行,结果以平均值±标准差(mean±SD)的格式呈现。并利用双尾 T 检验检测各组之间差异的显著性,*P<0.05 表示差异显著;**P<0.01 表示差异极显著。3.4 结果3.4.1.LPS 处理 BMECs 差异表达基因的验证为了验证测序结果,我们随机挑选了 20 个差异表达基因并用定量实时 PCR 验证它们的 mRNA 表达水平并与测序结果一致。(图 3-1)
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