岷县黑裘皮羊微卫星多样性与生产性状的关联分析

发布时间：2020-11-10 14:01

　　 岷县黑裘皮羊是甘肃省地方裘皮用绵羊品种,研究其遗传多样性与生产性状的关联性可以为种质资源的保护和利用提供理论依据。本研究在分析体重与体尺性状通径关系的基础上,利用微卫星标记技术,选取联合国粮农组织(FAO)推荐的24对微卫星引物,以144只岷县黑裘皮羊为研究对象,分析了其群体遗传多样性,同时利用SPSS 21.0软件的一般线性模型对微卫星标记与性状的表型数据进行关联分析。结果表明:1.岷县黑裘皮羊12、24和36月龄各生产性状变异系数分别为8.44%~19.89%、4.24%~8.52%和4.31%~10.62%。2.体重与体尺性状的相关性分析得出:除12月龄胸宽与体重无显著相关外(P0.05),其它各体尺性状与体重均呈正相关(P0.05)。3.逐步多元回归分析得出:12月龄岷县黑裘皮羊体尺与体重的最优回归方程:Y=0.409 X_5+0.246 X_1-19.850,R~2=0.546;24月龄:Y=0.485 X_5+0.929 X_3-19.569,R~2=0.719;36月龄:Y=1.086 X_3+0.327 X_2+0.251 X_1-10.207,R~2=0.930。4.体重与体尺性状的通径分析得出:12和24月龄时,胸围对体重的直接作用最大,体高和胸宽通过胸围对体重的间接作用大于自身的直接作用;36月龄时,胸宽对体重的直接作用最大,体高通过胸宽对体重的间接作用最大。5.微卫星遗传多样性分析得出:24个微卫星位点共检测到231个等位基因,平均等位基因数为9.63个;群体等位基因频率为0.0104~0.7396,等位基因片段大小为97~285bp;平均有效等位基因数为3.6540个,平均观测杂合度为0.4839,平均期望杂合度为0.6956,平均遗传杂合度为0.6883,平均多态信息含量为0.6527。位点MAF70等位基因数(Na=15)、有效等位基因数(Ne=8.2433)、期望杂合度(He=0.8879)和多态信息含量(PIC=0.8673)最高,位点OarFCB128观测杂合度(Ho=0.8125)最高;位点OarAE129等位基因数(Na=4)最少,位点SRCRSP9期望杂合度(He=0.4357)、多态信息含量(PIC=0.4070)最低,位点OarFCB304观测杂合度(Ho=0.2500)最低。所选位点中19个处于Hardy-Weinberg不平衡状态。说明岷县黑裘皮羊具有丰富的遗传多样性,环境适应能力较强,同时这24个微卫星位点可用于岷县黑裘皮羊生产性状的关联分析。6.对24个微卫星标记与生产性状的关联分析表明:21个位点分别与12、24和36月龄岷县黑裘皮羊体重、体高、体长、胸宽、胸深和胸围存在不同程度的关联性(P0.5)。其中,12月龄时,与体重相关的位点有7个:DYMS1、SRCRSP9、ILSTS11、OarFCB304、OarJMP58、MAF65、MAF70;与体高相关的位点有7个:OarFCB128、OarVH72、ILSTS28、MAF214、MAF33、OarJMP29、MAF70;与体长相关的位点有3个:OarFCB193、MAF65、MAF70;与胸宽相关的位点有1个:ILSTS28;与胸深相关的位点有4个:MAF214、OarFCB304、OarJMP29、MAF209;与胸围相关的位点有5个:ILSTS11、OarFCB193、OarJMP58、MAF65、MAF70。24月龄时,与体重相关的位点有7个:SRCRSP9、ILSTS11、MAF33、OarFCB193、OarJMP29、OarJMP58、MAF209;与体高相关的位点有4个:MCM140、OarFCB193、OarJMP58、MAF70;与体长相关的位点有4个:DYMS1、MAF214、MAF65、MAF209;与胸宽相关的位点有1个:ILSTS5;与胸深相关的位点有4个:BM8125、ILSTS5、ILSTS11、OarFCB304;与胸围相关的位点有7个:BM8125、SRCRSP9、MCM140、OarFCB193、OarJMP29、OarJMP58、MAF209。36月龄时,与体重相关的位点有5个:OarHH47、OarVH72、OarCB226、OarFCB193、OarJMP29;与体高相关的位点有5个:OarHH47、DYMS1、SRCRSP9、MCM140、OarFCB193;与体长相关的位点有4个:OarAE129、ILSTS5、OarFCB304、MAF65;与胸宽相关的位点有6个:OarFCB128、OarVH72、BM8125、OarCB226、OarFCB193、OarFCB304;与胸深相关的位点有4个:OarAE129、OarCB226、MAF33、MAF65;与胸围相关的位点有5个:ILSTS5、MCM140、OarFCB193、OarJMP29、MAF65。综上所述,岷县黑裘皮羊各体尺性状对体重的影响随月龄的变化而变化;同时,该群体遗传多样性丰富,所选位点与生产性状间关联程度较高,作为国家级畜禽遗传资源,该品种的保护工作急不可待。
【学位单位】：甘肃农业大学
【学位级别】：硕士
【学位年份】：2019
【中图分类】：S826
【部分图文】：

甘肃农业大学 2019 届硕士学位论文0.312 和 0.693；36 月龄体高、体长和胸宽对体重的直接通径系数分别为 0.299、0.312 和0.519。说明 12 月龄时，胸围对体重的直接作用大于体高；24 月龄时，胸围对体重的直接作用大于胸宽；36 月龄时，胸宽对体重的直接作用最大，体长次之，体高最小。岷县黑裘皮羊体尺与体重间的通径关系如图 2-1 所示。36 月龄时，体高与体长和胸宽间的相关系数分别为 0.254 和 0.806，体长与体重的直接通径系数为 0.312，因此，通过体长的间接通径系数为 0.254 0.312=0.079，通过胸宽的间接通径系数为 0.8060.519=0.418。同理计算出其它体尺对体重的通径系数，结果见表 2-5。说明 12 和 24 月龄时，体高和胸宽通过胸围对体重的间接作用均大于自身的直接作用；36 月龄时，体高通过胸宽对体重的间接作用最大。

、 ：第 、 个等位基因的频率；n：等位基因数。（4）多态信息含量多态信息含量（PIC）是表示微卫星位点遗传变异程度的指标，反映多态性的高低。 11 1221212ninjiniPIC PiPiPj（公式：3-6）n：等位基因数； 、 ：第 、 个等位基因的频率。3.2 结果与分析3.2.1 基因组 DNA 检测结果将提取的基因组 DNA 用 1%琼脂糖凝胶电泳检测（图 3-1），结果显示各泳道均有DNA 条带，且位置基本相同，说明所提 DNA 质量较好，只是各泳道内条带明暗程度不一，说明所提 DNA 浓度不同，为保证 PCR 扩增产物浓度的一致，对基因组 DNA 进行了浓度一致性调整，可用于下一步试验。

图 3-2 3 号个体在位点 MAF33 的检测结果（基因型为 126/136 bp）Figure 3-2 Detection results of No.3 in loci MCM140（The genetype is 177/181图 3-3 2 号个体在位点 OarJMP29 的检测结果（基因型为 136/136 bp）Figure 3-3 Detection results of No.2 in loci OarJMP29（The genetype is 136/1采用 ABI-3730 基因测序仪进行毛细管电泳检测，结果显示，各个位点较完整，荧光强度值和片段大小均在理想范围内。图 3-2 为 3 号样品在位点基因型（126/136bp），是杂合子；图 3-3 为 2 号个体在位点 OarJMP29 的基因bp），是纯合子。3.2.4 群体遗传多样性分析
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本文编号：2878015