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普通牛和瘤牛肝脏和脾脏组织的比较蛋白质组学研究

发布时间:2020-12-11 14:35
  家牛分为普通牛(Bostaurus)和瘤牛(Bos indicus),二者除了在外形上存在差异外,对于环境适应、生活习性、抗病力等方面都存在明显的差异,己有研究证明瘤牛与普通牛相比,对泰勒虫病和蜱虫感染有更强的抵抗力,而对锥虫病的抵抗力方面则较低。而目前关于普通牛与瘤牛之间抗病力差异的遗传基础的相关研究很少。本文利用蛋白质组学方法来研究普通牛和瘤牛肝脏和脾脏组织的差异蛋白质表达情况,从蛋白质组学水平解析二者间在抗病力方面差异的遗传基础。对普通牛和瘤牛肝脏和脾脏组织进行了 iTRAQ质谱检测,分别获得了肝脏、脾脏的蛋白质差异表达谱,以普通牛为参照样本,肝脏显著差异蛋白总数为197个,其中上调蛋白127个,下调蛋白70个,脾脏显著差异蛋白总数142个,其中上调蛋白77个,下调蛋白65个。对显著差异表达的蛋白质进行生物信息学分析,发现肝脏中差异表达蛋白质主要富集的GO条目是羧酸分解过程、有机酸分解过程、小分子分解过程;脾脏是组蛋白H3-K27三甲基化、核小体选位、受伤反应,免疫有关涉及的GO富集条目是免疫响应、免疫球蛋白复合物、免疫球蛋白受体结合等。肝脏中主要富集的KEGG代谢通路全为代谢类... 

【文章来源】:云南大学云南省 211工程院校

【文章页数】:65 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

普通牛和瘤牛肝脏和脾脏组织的比较蛋白质组学研究


图1本研宄目的图解??

蛋白质组学,实验流程,瘤牛


时将普通牛、瘤牛脾脏和肝脏分别混合为一组进行iTRAQ试剂盒标记并进行试验。??2.2实验方法??2.2.1?iTRAQ蛋白质组学实验流程(图2)?? ̄?乂>?^?」??一? ̄??一:?’??图2.?iTRAQ蛋白质组学实验流程??11??

序列,蛋白质鉴定,覆盖率,序列


kD?(1380),?41-60?KD?(1125),61-80?KD?(543))(图?3a)。此外,所鉴定的蛋白??质具有高的肽覆盖率,其中21-40的23%显示出超过6-10的15%的序列覆盖率??(图3C)。脾脏中大多数蛋白质的鉴定(74.7%)的分子量范围在(1-20kD?(660),??21-40kD?(1522),41-60KD?(1259),61-80KD?(683))(图?3b)。此外,所鉴定的??蛋白质具有高的肽覆盖率,其中21-40的24%显示出超过6-10的16%的序列覆盖??率(图3d)。??18??

【参考文献】:
期刊论文
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本文编号:2910708

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