基于线粒体数据在全球视角下解析家驴的种群系统地理关系和种群历史

发布时间：2020-12-13 22:26

　　家驴作为马属中的一种动物,和马具有一些相似的特征。但它的抗旱和耐压能力更为出众,因此多见分布在一些极端环境中。家驴的驯化标志着人类社会中的生产模式从固定的农耕模式变为了更具移动性的模式,对人类社会文明的发展具有重要意义。但如今野驴几近灭绝,家驴种质多样性急剧下降,探明家驴进化起源问题从而找到保护多样度相关对策变得迫在眉睫。从线粒体DNA分析及考古的证据都认为,在约5000年前的非洲东北部存在家驴驯化事件,进一步的分子证据认为驯化后分为了两支:努比亚世系（NUB）和索马里世系（SOM）,努比亚世系被认为是由努比亚野驴驯化而来,而索马里世系则起源于一种可能已灭绝的但关系与索马里野驴很近的野驴。然而目前尚未可知这两个世系是否源自同一驯化事件,即是否具有相同的驯化历史。在前期本研究假设两个世系具有相同驯化历史,则两个世系应当具有相似遗传特征。为了进一步确认该假设,我们选用了来自非洲及中亚地区以及中国的113个样品（包括家驴,亚洲野驴,马）对线粒体D-loop区以及其中77个样品进行线粒体全基因组测序,再结合网上已发表的531条涵盖非洲,亚洲等地区的线粒体基因进行综合分析。之后我们基于线粒体全基... 

【文章来源】：云南大学云南省 211工程院校

【文章页数】：67 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

本研究中使用的样品及NCBI下载样品分布图

部分样品线粒体D-loop序列扩增结果

家驴线粒体基因组构建的单倍型系统发育树

【参考文献】：
期刊论文
[1]马属动物进化特征概述[J]. 任秀娟,赵一萍,萨如拉,鲍红梅,王希生,道楞,阿娜尔,魏睿元,苏日嘎,彩丽干,白东义,李蓓,杨丽华,乌尼尔夫,芒来.  畜牧兽医学报. 2017(03)
[2]基于1H-NMR代谢组学的驴胶补血颗粒补血作用机制研究[J]. 刘彩春,刘欢,谷陟欣,秦雪梅,田俊生.  中草药. 2016(07)
[3]MC1R基因编码区的系统发育分析和正选择位点检测[J]. 李丽莎,李祥龙,周荣艳,李兰会,张永改,马梦云,张秀玲.  江苏农业科学. 2016(03)
[4]测序新技术Ion Torrent PGM及其法医学应用[J]. 刘宇轩,张文琼,黄代新.  中国法医学杂志. 2015(01)
[5]佳米驴消化生理特点与饲喂应注意的若干问题[J]. 韩英豪,张生卫,张燕.  畜牧兽医杂志. 2010(03)
[6]驴肉主要营养成分及与其它畜禽肉的分析比较[J]. 尤娟,罗永康,张岩春,郑喆.  肉类研究. 2008(07)
[7]中国驴种线粒体DNA D-loop多态性研究[J]. 雷初朝,陈宏,杨公社,孙维斌,雷雪芹,葛庆兰,王朝锋,吕宁,高雪,侯文通.  遗传学报. 2005(05)
[8]分子系统地理学及其应用[J]. 王静,李明,魏辅文,刘定震,蒙世杰,冯祚建.  动物分类学报. 2001(04)
[9]生态环境对野驴及家驴影响的比较[J]. 杨再.  家畜生态. 1991(01)



本文编号：2915282