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捻转血矛线虫丙硫咪唑耐药相关基因SNP及表达研究

发布时间:2021-01-04 18:59
  捻转血矛线虫是对反刍动物影响最大的一种消化道线虫,捻转血矛线虫耐药性的产生,严重威胁着畜牧业的发展。为了筛选捻转血矛线虫丙硫咪唑耐药性相关基因用于耐药性产生机制研究和临床耐药虫株鉴定,本研究基于转录组数据,得到捻转血矛线虫丙硫咪唑敏感株和耐药株SNP信息,进行了功能富集分析,筛选出4个差异基因,对其进行生物信息学分析及PCR测序验证;对采自内蒙古乌审旗、察右后旗和科右前旗的丙硫咪唑耐药种群Ⅰ型β-tubulin基因167、198和200位点单核苷酸多态性位点进行了检测;对捻转血矛线虫耐丙硫咪唑虫株不同药物浓度刺激下P450、GST和ABC基因表达量进行了检测。研究结果如下:(1)捻转血矛线虫HC-WSrBZ1、HC-WSrBZ2共有6090个差异基因富集到50条GO Term上,KEGG pathway共筛选出11条显著富集通路。Hc-CYsBZ和Hc-CYrBZ共有6757个差异基因富集到50条GO Term上,KEGG pathway共筛选出19条显著富集通路。Hc-ssBZ、Hc-XArBZ共有208个差异基因富集到26条GO Term上,KEGG pathway共筛选出10条显... 

【文章来源】:内蒙古农业大学内蒙古自治区

【文章页数】:75 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

捻转血矛线虫丙硫咪唑耐药相关基因SNP及表达研究


图2捻转血矛线虫转录组中genic?SNP概况??Fig.2?Summary?of?genic?SNP?within?transcriptome?of?H.?contortus??

序列,基因,测序


_28?檢转血矛线虫丙硫咪唑耐药相关基因SNP及表达研究???2.3.8差异基因扩增产物测序分析??根据4个基因在4个不同样本中PCR产物测序结果,利用DN?Astar中Megalign软件,??进行捻转血矛线虫标准敏感虫株与3个耐药虫株测序序列的两两比对。??HCON_00192020基因在3个耐药虫株中第266位均由T突变为C,见图12;??HCON_00037800基因在3个耐药虫株中,第179、182、188位均由A突变为G,见图13;??HCON_00129090基因在3个耐药虫株中第283位由G突变为A,见图I4;??HCON_00178650基因在3个耐药虫株中第89位均由C突变为A,见图15。突变结果均??与转录组测序结果一致。??■?.?JMBii?aiaii??^50?2"0?270?£S0?£&0??^TU,T^C-^CATCd5{;iGXCA5r,??t?mmmmmmmmmm??GyrtAGXACS甲山.rt?〒:?只?^tAArC-AC^CAtCCC>C>AS>>CAgT??^?250?Z£0?2*0?2-?C?2£C?2^0??wn?K&AACG?从MU.TGA^CIwICCptA^C^GT???说?CA:C?扯ACO.S:??MBBRl?9HHK?1^?0HHB88BB8SHB1??lC<-CXA^C^C>T^TrKC-TC^?^^.:SASC-C?C?碑?渾:??r7I〇?^?c?-〇?以?纾0??mure*?■上:说?相ex:?rAT^.Tc-x^cxrcdjtASACAGT??图12?HCON_00192020基因比

散点图,羊群,捻转血矛线虫,虫卵


G?阳性数?/%?/%_??羊群1?5?丙硫咪唑?3480?5?720?1?79.31?80??羊群2?5?丙硫咪唑?1240?5?1120?5?^68?0??4.3.3虫卵孵化试验结果??求出校正虫卵孵化抑制率,利用Excel软件求出概率单位,以药物浓度的对数为??横坐标,概率单位为纵坐标,做散点图并绘制线性回归方程。羊群1捻转血矛线虫虫??卵孵化试验线性回归方程为y=〇.4973x+5.7366(R2=0.6658),LD5Q=0.227吨/mL,结果??见图19?;羊群2捻转血矛线虫虫卵孵化试验线性回归方程为??y=0.3608x+5.0616(R2=0.9063),LD50=0.843?pg/mL,如图20所示。据国内外报道,受??检样品LD5Q值大于0.1|ig/mL时,可判定该虫卵对于丙硫咪唑耐药。羊群1捻转血矛线??虫LD5〇=0.227?^ig/mL,表示出现了耐药性,而羊群2捻转血矛线虫LD5〇K).843?^g/mL,??远大于0.1?(ig/mL,表;TC该羊群存在严重耐药性。??c?6????????r?X?5??y=0.4973x?+5.7366?4??蛛???R2?=?0.6658??虫?-??2??1??-2.5?-2?-1.5?-0.5?0??药物浓度的对数??图19羊群1捻转血矛线虫虫卵孵化试验??Fig.19?Egg?hatch?test?of?H.?contortus?in?flock?1??


本文编号:2957258

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