捻转血矛线虫丙硫咪唑耐药相关基因SNP及表达研究

发布时间：2021-01-04 18:59

　　捻转血矛线虫是对反刍动物影响最大的一种消化道线虫,捻转血矛线虫耐药性的产生,严重威胁着畜牧业的发展。为了筛选捻转血矛线虫丙硫咪唑耐药性相关基因用于耐药性产生机制研究和临床耐药虫株鉴定,本研究基于转录组数据,得到捻转血矛线虫丙硫咪唑敏感株和耐药株SNP信息,进行了功能富集分析,筛选出4个差异基因,对其进行生物信息学分析及PCR测序验证;对采自内蒙古乌审旗、察右后旗和科右前旗的丙硫咪唑耐药种群Ⅰ型β-tubulin基因167、198和200位点单核苷酸多态性位点进行了检测;对捻转血矛线虫耐丙硫咪唑虫株不同药物浓度刺激下P450、GST和ABC基因表达量进行了检测。研究结果如下:（1）捻转血矛线虫HC-WSrBZ1、HC-WSrBZ2共有6090个差异基因富集到50条GO Term上,KEGG pathway共筛选出11条显著富集通路。Hc-CYsBZ和Hc-CYrBZ共有6757个差异基因富集到50条GO Term上,KEGG pathway共筛选出19条显著富集通路。Hc-ssBZ、Hc-XArBZ共有208个差异基因富集到26条GO Term上,KEGG pathway共筛选出10条显... 

【文章来源】：内蒙古农业大学内蒙古自治区

【文章页数】：75 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图２捻转血矛线虫转录组中ｇｅｎｉｃ?ＳＮＰ概况??Ｆｉｇ．２?Ｓｕｍｍａｒｙ?ｏｆ?ｇｅｎｉｃ?ＳＮＰ?ｗｉｔｈｉｎ?ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅ?ｏｆ?Ｈ．?ｃｏｎｔｏｒｔｕｓ??

＿２８?檢转血矛线虫丙硫咪唑耐药相关基因ＳＮＰ及表达研究???２．３．８差异基因扩增产物测序分析??根据４个基因在４个不同样本中ＰＣＲ产物测序结果，利用ＤＮ?Ａｓｔａｒ中Ｍｅｇａｌｉｇｎ软件，??进行捻转血矛线虫标准敏感虫株与３个耐药虫株测序序列的两两比对。??ＨＣＯＮ＿００１９２０２０基因在３个耐药虫株中第２６６位均由Ｔ突变为Ｃ，见图１２；??ＨＣＯＮ＿０００３７８００基因在３个耐药虫株中，第１７９、１８２、１８８位均由Ａ突变为Ｇ，见图１３；??ＨＣＯＮ＿００１２９０９０基因在３个耐药虫株中第２８３位由Ｇ突变为Ａ，见图Ｉ４；??ＨＣＯＮ＿００１７８６５０基因在３个耐药虫株中第８９位均由Ｃ突变为Ａ，见图１５。突变结果均??与转录组测序结果一致。??■?．?ＪＭＢｉｉ?ａｉａｉｉ??＾５０?２＂０?２７０?￡Ｓ０?￡＆０??＾ＴＵ，Ｔ＾Ｃ－＾ＣＡＴＣｄ５｛；ｉＧＸＣＡ５ｒ，??ｔ?ｍｍｍｍｍｍｍｍｍｍ??ＧｙｒｔＡＧＸＡＣＳ甲山．ｒｔ？〒：?只?＾ｔＡＡｒＣ－ＡＣ＾ＣＡｔＣＣＣ＞Ｃ＞ＡＳ＞＞ＣＡｇＴ??＾?２５０?Ｚ￡０?２＊０?２－？Ｃ?２￡Ｃ?２＾０??ｗｎ?Ｋ＆ＡＡＣＧ?从ＭＵ．ＴＧＡ＾ＣＩｗＩＣＣｐｔＡ＾Ｃ＾ＧＴ??？说?ＣＡ：Ｃ?扯ＡＣＯ．Ｓ：??ＭＢＢＲｌ?９ＨＨＫ?１＾?０ＨＨＢ８８ＢＢ８ＳＨＢ１??ｌＣ＜－ＣＸＡ＾Ｃ＾Ｃ＞Ｔ＾ＴｒＫＣ－ＴＣ＾?＾＾．：ＳＡＳＣ－Ｃ?Ｃ？碑？渾：??ｒ７Ｉ〇?＾?ｃ?－〇?以?纾０??ｍｕｒｅ＊？■上：说？相ｅｘ：?ｒＡＴ＾．Ｔｃ－ｘ＾ｃｘｒｃｄｊｔＡＳＡＣＡＧＴ??图１２?ＨＣＯＮ＿００１９２０２０基因比

Ｇ?阳性数?／％?／％＿??羊群１?５?丙硫咪唑?３４８０?５?７２０?１?７９．３１?８０??羊群２?５?丙硫咪唑?１２４０?５?１１２０?５?＾６８?０??４．３．３虫卵孵化试验结果??求出校正虫卵孵化抑制率，利用Ｅｘｃｅｌ软件求出概率单位，以药物浓度的对数为??横坐标，概率单位为纵坐标，做散点图并绘制线性回归方程。羊群１捻转血矛线虫虫??卵孵化试验线性回归方程为ｙ＝〇．４９７３ｘ＋５．７３６６（Ｒ２＝０．６６５８），ＬＤ５Ｑ＝０．２２７吨／ｍＬ，结果??见图１９?；羊群２捻转血矛线虫虫卵孵化试验线性回归方程为??ｙ＝０．３６０８ｘ＋５．０６１６（Ｒ２＝０．９０６３），ＬＤ５０＝０．８４３?ｐｇ／ｍＬ，如图２０所示。据国内外报道，受??检样品ＬＤ５Ｑ值大于０．１｜ｉｇ／ｍＬ时，可判定该虫卵对于丙硫咪唑耐药。羊群１捻转血矛线??虫ＬＤ５〇＝０．２２７?＾ｉｇ／ｍＬ，表示出现了耐药性，而羊群２捻转血矛线虫ＬＤ５〇Ｋ）．８４３?＾ｇ／ｍＬ，??远大于０．１?（ｉｇ／ｍＬ，表；ＴＣ该羊群存在严重耐药性。??ｃ?６????????ｒ?Ｘ?５??ｙ＝０．４９７３ｘ?＋５．７３６６?４??蛛?？?Ｒ２?＝?０．６６５８??虫?－??２??１??－２．５?－２?－１．５?－０．５?０??药物浓度的对数??图１９羊群１捻转血矛线虫虫卵孵化试验??Ｆｉｇ．１９?Ｅｇｇ?ｈａｔｃｈ?ｔｅｓｔ?ｏｆ?Ｈ．?ｃｏｎｔｏｒｔｕｓ?ｉｎ?ｆｌｏｃｋ?１??


本文编号：2957258