不同地区家畜肠道微生物和土壤微生物多样性及相关性研究

发布时间：2021-01-04 20:17

　　微生物群落作为微生物的功能组合,在多细胞生物和环境中起着重要作用。动物肠道微生物受到环境等多因素的影响,土壤作为环境中微生物的重要聚集地,是否会对该地区家畜肠道微生物产生影响,值得探索。为此本研究利用宏基因组测序技术,对锡林郭勒和红原地区家畜肠道微生物和土壤微生物多样性进行研究。主要结果如下:对锡林郭勒地区牛、山羊和马肠道微生物研究结果表明:同一环境下牛、山羊和马的肠道均以广古菌门、厚壁菌门、变形菌门、拟杆菌门为优势菌门,在属水平,不同家畜间菌属的相对丰度存在显著差异,但是反刍动物牛和山羊的肠道微生物结构较为相似,其肠道中的副类杆菌属、另枝菌属、颤杆菌克显著高于马,而非反刍动物马肠道中Subdoligranulum显著高于牛和山羊（P<0.05）。栖息地土壤微生物对牛、山羊、马肠道微生物产生了不同的影响,其中土壤中的地嗜皮菌属、马赛菌属、游动杆菌属、鞘脂菌属对所有家畜肠道微生物都产生了显著影响（P<0.05）。对红原地区牛肠道微生物研究结果表明:红原地区牛肠道以广古菌门,厚壁菌门,拟杆菌门,变形菌门为优势菌门,以甲烷短杆菌属,消化链球菌属,拟杆菌属,大肠埃希氏菌属,另枝菌属... 

【文章来源】：内蒙古农业大学内蒙古自治区

【文章页数】：55 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图１样本釆集分布图??Ｆｉｇ．ｌ?Ｓａｍｐｌｅ?ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ｍａｐ??

?内蒙古农业大学硕士学位论文?２１＿??Ｓｕｂｄｏｌｉｇｒａｎｕｌｕｍ?（１．１４％?）?〇??卜｜｜｜＿?｜｜ｉ＿??邏＿１＿—??ｃ?—?ｒｉ?ｃｎ?＊ｒｉ?ａｃ?ｃ－??｜?１?１?１?Ｉ?Ｓ?Ｉ?Ｉ?Ｉ??图１０红原地区牛肠道微生物门水平（Ａ）和属水平（Ｂ）相对含量??Ｆｉｇ．?１０?Ｔｈｅ?ｒｅｌａｔｉｖｅ?ａｂｕｎｄａｎｃｅ?ｏｆ?ｃａｔｔｌｅ?ｉｎｔｅｓｔｉｎａｌ?ｍｉｃｒｏｂｉｏｍｅ?ａｔ?ｐｈｙｌｕｍ?ｌｅｖｅｌ?（Ａ）?ａｎｄ?ａｔ?ｇｅｎｕｓ?ｌｅｖｅｌ?ＣＢ?）?ｆｒｏｍ??Ｈｏｎｇｙｕａｎ?ｒｅｇｉｏｎ??３．５红原地区土壤微生物分析??３．５．１红原地区土壤ａ多样性分析??基于Ｉｌｌｕｍｉｎａ?ＨｉＳｅｑ?２０００测序技术，对红原地区７份土壤样品进行宏基因组测??序，平均每个样品测得了?６Ｇｂ以上的数据。经过质量控制后，平均每个样品的测序??量为?４．６７?Ｇｂ?（范围＝４．０７－５．２９?Ｇｂ；?ＳＤ＝０．４３）。??为了评估红原地区土壤微生物的ａ多样性，本研宂选取了香农指数和辛普森指??数来反映其微生物的多样性和丰富度，结果如表７所示。红原地区土壤微生物香农??指数平均?２．２０?（ｒａｎｇｅ＝ｌ．１２－３．２５），辛普森指数平均?０．７３（ｒａｎｇｅ＝０．３９－０．９４）。??

２２?不同地区家畜肠道微生物和土壤微生物多样性及相关性研究???表７红原地区土壤微生物多样性指数??Ｔａｂｌｅ．７?Ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ?ｉｎｄｉｃｅｓ?ｉｎ?ｓｏｉｌ?ｍｉｃｒｏｂｉｏｍｅ?ｆｒｏｍ?Ｈｏｎｇｙｕａｎ?ｒｅｇｉｏｎ??样品名称?香农指数?辛普森指数??ＨＴ２?１．８４?０．６７??ＨＴ３?１．１２?０．３９??ＨＴ４?２．９５?０．９１??ＨＴ５?１．７２?０．６８??ＨＴ６?３．２５?０．９４??ＨＴ７?１．８４?０．６５??ＨＴ８?２．７０?０．９０??Ｍｅａｎ±ＳＤ?２．２０＋０．７７?０．７３±０．２０??３．５．２红原地区土壤微生物结构解析??ｉ幽■??ｇ?ｅ?５?Ｉ?Ｉ?ｅ?Ｉ??ｏｔｍｒ??＇＂＇■Ｉ?Ｔ—??駿纖；ｓｓ－ｆｉｑｉｈｔｍｖａｔｔｂｉｕｍ??Ｉ?■嶋??ｒ＾ｔ?＾?〇ｆ＞??ｔ?ｔｒ?ｉｚ?ｔ?ｔｘ?完??图１１红原地区土壤微生物门水平（Ａ）和属水平（Ｂ）相对含量??Ｆｉｇ．?１１?Ｔｈｅ?ｒｅｌａｔｉｖｅ?ａｂｕｎｄａｎｃｅ?ｏｆ?ｓｏｉｌ?ｍｉｃｒｏｂｉｏｍｅ?ａｔ?ｐｈｙｌｕｍ?ｌｅｖｅｌ?（Ａ）?ａｎｄ?ａｔ?ｇｅｎｕｓ?ｌｅｖｅｌ?（Ｂ）?ｆｒｏｍ??Ｈｏｎｇｙｕａｎ?ｒｅｇｉｏｎ??


本文编号：2957335