基于Imp肽核酸探针检测血清1型鸭疫里默氏菌及基于gyrA肽核酸诺氟沙星增效作用的研究
发布时间:2021-01-17 15:06
鸭疫里默氏菌(Riemerella anatipestifer,RA)是一种革兰氏阴性菌,主要引起鸭、鹅、火鸡等禽类的接触性传染病。本文开展了基于膜通透性增强蛋白(Imp)的肽核酸(PNA)探针检测血清1型RA及基于拓扑异构酶A(gyrA)的肽核酸增强诺氟沙星抗菌作用的研究,主要内容和结果如下:1.基于Imp肽核酸探针检测血清1型RA的研究和应用利用软件筛选出imp基因的第134-145位点序列合成PNA-imp。在RA imp引物上添加5-FAM荧光标记,然后以血清1型RA CH-1株、血清2型RA CH-2株、ATCC 11845株及未知血清型RA各临床分离株为模板进行PCR扩增,将PNA-imp与扩增产物进行杂交,荧光显微镜下PNA-imp与靶位点特异性结合后会呈现绿色荧光亮斑。结果表明:在PNA-imp 6.2μM、60°C条件下可以特异检测到血清1型RA;对2和6型RA、大肠杆菌、鼠伤寒沙门氏菌、多杀性巴氏杆菌等检测结果均为阴性。2.基于gyrA肽核酸增强抗菌作用的研究和应用利用软件筛选出gyrA基因的第1591-1604位点序列合成PNA-gyrA。对比PNA-gyrA与喹...
【文章来源】:四川农业大学四川省 211工程院校
【文章页数】:65 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
γPNA与DNA杂交复合体结构
γPNA调控翻译[78]
RNAstructure 5.8软件绘制 imp mRNA 的二潜在的反义作用靶区域,如发卡、膨胀环、内件分析靶区域 RNA 与 PNA 结合的各项参数:净能量(overall△G)、PNA 与直链靶序列结合因双链解开所需要的能量(Break-targΔG)、Po-self△G)、PNA 分子间结合所需要的能量(o温度(Tm),然后根据最低自由能原则筛选出结成 PNA-imp 序列递交至 panagene 公司进行合成,得到 PNA-imp 结构示意图。如图 3 所示,其中CTCTTGCGA。
【参考文献】:
期刊论文
[1]抑制DNA拓扑异构酶Ⅰ可抑制炎性基因的表达并保护机体免受炎症损伤[J]. 李江雪,于益芝,RIALDI A,CAMPISI L,ZHAO N. 中国肿瘤生物治疗杂志. 2017(01)
[2]鸭疫里默氏杆菌16S rRNA和dnaB基因的双重PCR检测方法的建立[J]. 丁云竹,孙冰清,姜盼,崔俊生,陶敏捷,胡青海,常维山. 中国预防兽医学报. 2017(01)
[3]DNA拓扑异构酶抑制剂在逆转肿瘤多药耐药性中的研究进展[J]. 张游华,顾牣赜,牛天力,张青川. 现代肿瘤医学. 2016(24)
[4]部分革兰氏阴性菌脂多糖运输蛋白LptD的结构及功能研究进展[J]. 莫婷,刘马峰,程安春. 微生物学通报. 2017(01)
[5]血清15型鹅源鸭疫里默氏杆菌的分离鉴定及交叉免疫保护研究[J]. 姜安安,王小兰,王少辉,韩先干,丁铲,王桂军,于圣青. 中国动物传染病学报. 2015(03)
[6]鸭疫里默氏杆菌耐药性及检测方法研究进展[J]. 李亚菲,孙娜,蒋红霞,曾振灵. 中国家禽. 2013(19)
[7]血清1型鸭疫里默氏杆菌灭活油乳剂疫苗的研制[J]. 王小兰,胡青海,童永亮,韩先干,丁铲,于圣青. 中国预防兽医学报. 2012(04)
[8]鸭疫里默氏杆菌病原及其防控关键技术研究[J]. 程安春,朱德康,王晓佳,王雪平,张莎秋,贾仁勇,罗启慧,韩新峰,陈孝跃,汪铭书. 中国家禽. 2012(06)
[9]近年我国部分地区鸭疫里默氏杆菌耐药性分析[J]. 孙静,郭浩,王秀玲,常维山. 山东畜牧兽医. 2011(05)
[10]鸭疫里默氏杆菌16 S rRNA PCR快速检测方法的建立[J]. 冯金牛,陈芳艳,阮二垒,杨丽云,黎丁滔,陈瑞爱,区德庆,唐秀英,王林川. 中国兽医科学. 2010(04)
本文编号:2983099
【文章来源】:四川农业大学四川省 211工程院校
【文章页数】:65 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
γPNA与DNA杂交复合体结构
γPNA调控翻译[78]
RNAstructure 5.8软件绘制 imp mRNA 的二潜在的反义作用靶区域,如发卡、膨胀环、内件分析靶区域 RNA 与 PNA 结合的各项参数:净能量(overall△G)、PNA 与直链靶序列结合因双链解开所需要的能量(Break-targΔG)、Po-self△G)、PNA 分子间结合所需要的能量(o温度(Tm),然后根据最低自由能原则筛选出结成 PNA-imp 序列递交至 panagene 公司进行合成,得到 PNA-imp 结构示意图。如图 3 所示,其中CTCTTGCGA。
【参考文献】:
期刊论文
[1]抑制DNA拓扑异构酶Ⅰ可抑制炎性基因的表达并保护机体免受炎症损伤[J]. 李江雪,于益芝,RIALDI A,CAMPISI L,ZHAO N. 中国肿瘤生物治疗杂志. 2017(01)
[2]鸭疫里默氏杆菌16S rRNA和dnaB基因的双重PCR检测方法的建立[J]. 丁云竹,孙冰清,姜盼,崔俊生,陶敏捷,胡青海,常维山. 中国预防兽医学报. 2017(01)
[3]DNA拓扑异构酶抑制剂在逆转肿瘤多药耐药性中的研究进展[J]. 张游华,顾牣赜,牛天力,张青川. 现代肿瘤医学. 2016(24)
[4]部分革兰氏阴性菌脂多糖运输蛋白LptD的结构及功能研究进展[J]. 莫婷,刘马峰,程安春. 微生物学通报. 2017(01)
[5]血清15型鹅源鸭疫里默氏杆菌的分离鉴定及交叉免疫保护研究[J]. 姜安安,王小兰,王少辉,韩先干,丁铲,王桂军,于圣青. 中国动物传染病学报. 2015(03)
[6]鸭疫里默氏杆菌耐药性及检测方法研究进展[J]. 李亚菲,孙娜,蒋红霞,曾振灵. 中国家禽. 2013(19)
[7]血清1型鸭疫里默氏杆菌灭活油乳剂疫苗的研制[J]. 王小兰,胡青海,童永亮,韩先干,丁铲,于圣青. 中国预防兽医学报. 2012(04)
[8]鸭疫里默氏杆菌病原及其防控关键技术研究[J]. 程安春,朱德康,王晓佳,王雪平,张莎秋,贾仁勇,罗启慧,韩新峰,陈孝跃,汪铭书. 中国家禽. 2012(06)
[9]近年我国部分地区鸭疫里默氏杆菌耐药性分析[J]. 孙静,郭浩,王秀玲,常维山. 山东畜牧兽医. 2011(05)
[10]鸭疫里默氏杆菌16 S rRNA PCR快速检测方法的建立[J]. 冯金牛,陈芳艳,阮二垒,杨丽云,黎丁滔,陈瑞爱,区德庆,唐秀英,王林川. 中国兽医科学. 2010(04)
本文编号:2983099
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