广州市2014－2019年H5亚型禽流感病毒流行与基因遗传特征分析

发布时间：2021-02-23 20:12

　　目的分析广州市H5亚型禽流感病毒流行特点及基因进化和变异特征,为禽流感的防控提供依据。方法对2014-2019年广州市禽类市场外环境标本进行禽流感病毒核酸检测并分析H5亚型流行情况,随机选取48份（46份来源于环境和2份来源于病例）H5阳性标本进行HA和NA基因测序,应用生物信息学软件分析分子遗传特征。结果 2014-2019年监测的52 284份环境标本中,检出H5亚型阳性标本1 094份,阳性率为2.09%。遗传进化分析显示,HA基因属于Clade 2.3.4.4.C分支,NA基因主要归属于欧亚谱系H6N6进化分支,HA和NA基因的进化以时间聚类为特点,相近年份流行株聚成一个进化分支。分子特征显示,48份毒株裂解位点呈现高致病性分子特点,受体结合位点仍为禽源受体,但普遍发生S123P、S133A和T156A倾向结合人源受体的位点突变。抗原位点变异主要出现在B、E区,并表现时间分布的特点,同一年份流行株常发生与上一年份流行株不同的抗原位点变异。2017年开始所有毒株出现由氨基酸缺失导致的糖基化位点的增加（140-NHT）。结论广州市禽类市场外环境H5亚型禽流感病毒长期流行,且阳性率占... 

【文章来源】：中华流行病学杂志. 2020,41(07)北大核心

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【参考文献】：
期刊论文
[1]福建省人感染H5N6禽流感病毒与外环境禽流感病毒相关性分析[J]. 陈平,谢剑锋,林琦,赵琳,张炎华,陈宏彬,翁育伟,郑奎城.  中国人兽共患病学报. 2018(08)



本文编号：3048161