杂种三叶草多叶型与标准型的转录组比较分析
发布时间:2021-03-17 19:24
三叶草的多叶型与标准型是以蒙农三叶草1号为母本和白三叶为父本进行远缘杂交及胚拯救技术而获得的Fi代株系。自2005年以来,经过对Fi代的胚离体培养、茎段离体培养器官发生和胚萌发适应条件等一系列研究,得到可以在温室和田间栽培的F1代植株。在杂交培育的研究过程中,部分三叶草植株出现4~5小叶的多叶型性状。通过对这些植株的根蘖进行营养扩繁,形成一系列多叶型株系。这一发现对于新品种的培育具有重要意义。为探索三叶草多叶现象的分子机制,本研究选择其中一个多叶型三叶草株系(1-1)和标准型三叶草株系(2-2)为研究对象,分别作为试验组和对照组,每组设立三个生物学重复。T1、T2、T3为试验组样品,T4、T5、T6为对照组样品,基于RNA-Seq技术,对6个样品进行转录组测序分析。主要研究结果如下:(1)转录组数据分析得到多叶型三叶草与标准型三叶草的差异表达基因共1985个,包括794个上调基因与1191个下调基因。GO功能注释表明差异表达基因主要富集在蛋白质磷酸化(Protein phosphorylation)、防御反应(Defense response)、核(Nucleus)、细胞质(Cytos...
【文章来源】:内蒙古农业大学内蒙古自治区
【文章页数】:67 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图2?Unigene长度分布图??Fig.2?Unigene?length?distribution?map??
图3?Mapped?Reads在mRNA上的位置分布图??Fig.3?Map?distribution?of?Mapped?Reads?on?mRNA??
图5转录组测序数据饱和度模拟图??Fig.5?Transcriptome?sequencing?data?saturatio?
【参考文献】:
期刊论文
[1]基于转录组测序数据分析及高通量GO注释理论的研究[J]. 刘粉香,杨文国,孙勤红. 安徽农业科学. 2018(31)
[2]多叶型苜蓿的研究进展[J]. 王晓龙,李红,杨伟光,杨曌,柴华,黄新育,高海娟,徐艳霞,蓝岚. 黑龙江畜牧兽医. 2016(23)
[3]苹果褐斑病菌侵染苹果属山定子的转录组学分析[J]. 李海录,宋艳艳,冯浩,黄丽丽,强晓玉,韩青梅. 农业生物技术学报. 2017(01)
[4]高加索三叶草、白三叶及其F1代株系种子特征的比较[J]. 李晓秀,王明玖,白春利. 畜牧与饲料科学. 2015(04)
[5]水稻土壤宏基因组中的β-葡萄糖苷酶基因克隆、表达及酶活的研究[J]. 贺俐,吴杨. 井冈山大学学报(自然科学版). 2014(03)
[6]白三叶草对林地微域环境的调节及其林下种植技术[J]. 万井尉. 现代农业. 2013(01)
[7]KEGG数据库的进展及其在生物信息学中的应用[J]. 李向真,刘子朋,李娟,方慧生. 药物生物技术. 2012(06)
[8]高加索三叶草、白三叶及其杂种F1代的ISSR分析[J]. 黄帆,王明玖,何丽君,陈丽丽,魏春秋. 中国草地学报. 2012(06)
[9]高通量转录组测序的数据分析与基因发掘[J]. 周华,张新,刘腾云,余发新. 江西科学. 2012(05)
[10]大规模GO注释的生物信息学流程[J]. 黄子夏,柯才焕,陈军. 厦门大学学报(自然科学版). 2012(01)
博士论文
[1]秦川牛肌肉生长发育相关基因和蛋白质的筛选及其初步鉴定[D]. 贺花.西北农林科技大学 2014
[2]高加索三叶草与白三叶杂交后代遗传特性及育性恢复的研究[D]. 黄帆.内蒙古农业大学 2012
硕士论文
[1]干旱胁迫下甜高粱(辽甜一)转录组分析[D]. 邵丹阳.河南大学 2018
[2]三叶草杂种F1代5个株系及亲本主要特征特性比较[D]. 邬娜.内蒙古农业大学 2017
[3]2种三叶草杂种F1代株系的鉴定与光合特性比较分析[D]. 周莹.内蒙古农业大学 2017
[4]白沙蒿对干旱响应的转录组研究[D]. 员艳丽.内蒙古师范大学 2016
[5]甘蔗脱叶性的评价及其分子基础[D]. 商贺阳.广西大学 2016
[6]高加索三叶草、白三叶及其F1代株系的遗传特征[D]. 李晓秀.内蒙古农业大学 2015
[7]低温胁迫下西葫芦转录组分析与SSR分子标记开发[D]. 张宏亮.山西农业大学 2015
[8]β-葡萄糖苷酶基因的筛选及性质分析[D]. 夏玉林.广东药科大学 2016
[9]紫花苜蓿耐盐生理特性及转录组分析[D]. 江超.山东农业大学 2014
[10]高加索三叶草与白三叶杂交BC1胚培养及F1育性分析[D]. 任尚佳.内蒙古农业大学 2014
本文编号:3087592
【文章来源】:内蒙古农业大学内蒙古自治区
【文章页数】:67 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图2?Unigene长度分布图??Fig.2?Unigene?length?distribution?map??
图3?Mapped?Reads在mRNA上的位置分布图??Fig.3?Map?distribution?of?Mapped?Reads?on?mRNA??
图5转录组测序数据饱和度模拟图??Fig.5?Transcriptome?sequencing?data?saturatio?
【参考文献】:
期刊论文
[1]基于转录组测序数据分析及高通量GO注释理论的研究[J]. 刘粉香,杨文国,孙勤红. 安徽农业科学. 2018(31)
[2]多叶型苜蓿的研究进展[J]. 王晓龙,李红,杨伟光,杨曌,柴华,黄新育,高海娟,徐艳霞,蓝岚. 黑龙江畜牧兽医. 2016(23)
[3]苹果褐斑病菌侵染苹果属山定子的转录组学分析[J]. 李海录,宋艳艳,冯浩,黄丽丽,强晓玉,韩青梅. 农业生物技术学报. 2017(01)
[4]高加索三叶草、白三叶及其F1代株系种子特征的比较[J]. 李晓秀,王明玖,白春利. 畜牧与饲料科学. 2015(04)
[5]水稻土壤宏基因组中的β-葡萄糖苷酶基因克隆、表达及酶活的研究[J]. 贺俐,吴杨. 井冈山大学学报(自然科学版). 2014(03)
[6]白三叶草对林地微域环境的调节及其林下种植技术[J]. 万井尉. 现代农业. 2013(01)
[7]KEGG数据库的进展及其在生物信息学中的应用[J]. 李向真,刘子朋,李娟,方慧生. 药物生物技术. 2012(06)
[8]高加索三叶草、白三叶及其杂种F1代的ISSR分析[J]. 黄帆,王明玖,何丽君,陈丽丽,魏春秋. 中国草地学报. 2012(06)
[9]高通量转录组测序的数据分析与基因发掘[J]. 周华,张新,刘腾云,余发新. 江西科学. 2012(05)
[10]大规模GO注释的生物信息学流程[J]. 黄子夏,柯才焕,陈军. 厦门大学学报(自然科学版). 2012(01)
博士论文
[1]秦川牛肌肉生长发育相关基因和蛋白质的筛选及其初步鉴定[D]. 贺花.西北农林科技大学 2014
[2]高加索三叶草与白三叶杂交后代遗传特性及育性恢复的研究[D]. 黄帆.内蒙古农业大学 2012
硕士论文
[1]干旱胁迫下甜高粱(辽甜一)转录组分析[D]. 邵丹阳.河南大学 2018
[2]三叶草杂种F1代5个株系及亲本主要特征特性比较[D]. 邬娜.内蒙古农业大学 2017
[3]2种三叶草杂种F1代株系的鉴定与光合特性比较分析[D]. 周莹.内蒙古农业大学 2017
[4]白沙蒿对干旱响应的转录组研究[D]. 员艳丽.内蒙古师范大学 2016
[5]甘蔗脱叶性的评价及其分子基础[D]. 商贺阳.广西大学 2016
[6]高加索三叶草、白三叶及其F1代株系的遗传特征[D]. 李晓秀.内蒙古农业大学 2015
[7]低温胁迫下西葫芦转录组分析与SSR分子标记开发[D]. 张宏亮.山西农业大学 2015
[8]β-葡萄糖苷酶基因的筛选及性质分析[D]. 夏玉林.广东药科大学 2016
[9]紫花苜蓿耐盐生理特性及转录组分析[D]. 江超.山东农业大学 2014
[10]高加索三叶草与白三叶杂交BC1胚培养及F1育性分析[D]. 任尚佳.内蒙古农业大学 2014
本文编号:3087592
本文链接:https://www.wllwen.com/yixuelunwen/dongwuyixue/3087592.html