梅山猪与杜洛克猪卵泡中circ0010513的鉴定及分析

发布时间：2021-03-18 12:40

　　试验旨在探索circRNA在卵泡中可能发挥的潜在作用,为了解circRNA调控卵泡发育的机制奠定基础。采用RNA-Seq和生物信息学方法鉴定梅山猪与杜洛克猪卵泡中circRNA的表达量,运用miRanda、RNAhybrid和targetscan软件,对差异性表达的circRNA进行靶基因预测;对靶基因进行GO和KEGG富集分析,并运用qRT-PCR分析梅山猪和杜洛克猪circ0010513在各时期卵泡及各组织的表达量。结果表明:circ0010513在梅山猪M2卵泡（M2卵泡直径5.1～7.0 mm）中的表达量极显著高于杜洛克猪（P<0.01）,而梅山猪M1（M1卵泡直径3.1～5.0 mm）卵泡中的表达量极显著高于杜洛克猪（P<0.01）,该结果与高通量测序结果一致。circ0010513在心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、下丘脑、垂体、卵巢、输卵管、子宫和子宫角中均有不同程度的表达,其潜在靶基因DUSP5、GADD45G、LAMB3等通过参与繁殖相关的信号通路影响猪的卵泡发育,提示其可能通过对靶基因的调控作用间接参与卵泡发育过程。 

【文章来源】：畜牧与兽医. 2020,52(12)北大核心

【文章页数】：7 页

【部分图文】：

circ0010513 PCR产物图

circ0010513首尾链接序列测序峰图

circ0010513在杜洛克猪不同组织中相对表达量

【参考文献】：
期刊论文
[1]环状RNA的研究进展[J]. 马翔,任秀智,刘军龙,鲁艳芹,韩金祥.  中国生物制品学杂志. 2016(08)

博士论文
[1]二花脸猪卵泡形成和早期发育的特性及其相关通路的研究[D]. 丁威.南京农业大学 2010

硕士论文
[1]Gadd45g调控胚胎干细胞自我更新的作用研究[D]. 李薇.安徽大学 2016



本文编号：3088341