山东部分地区猪瘟病毒感染情况调查及其基因变异分析

发布时间：2021-04-11 13:03

　　为了解山东地区猪瘟病毒（CSFV）的感染和变异情况,应用RT-PCR方法对2018年从无害化处理场和屠宰场采集的756份猪的组织样品进行CSFV检测,并对阳性毒株的5′UTR、E0和E2基因进行扩增、克隆和序列分析。结果显示,756份样品中有59份为CSFV阳性,阳性率为7.8%。根据测序结果选取有代表性的9株CSFV病毒进行序列分析,对E2基因序列分析显示,与兔化弱毒（HCLV）疫苗株相比,在可造成免疫逃逸的关键氨基酸位点这9株毒株均存在相同的3个氨基酸位点的突变,而E0基因在密码子程度上一直向着远离经典毒株Shimen株和HCLV疫苗株方向发展。以5′UTR和E2基因为基础进行分型,发现这9株病毒均属于2.1d亚群,与Shimen株、HCLV疫苗株亲缘关系较远。综上说明,山东地区猪瘟病毒已经朝着远离疫苗株的方向进化。 

【文章来源】：动物医学进展. 2020,41(11)北大核心

【文章页数】：5 页

【部分图文】：

CSFV 5′UTR和E2基因序列的系统发育树

使用MegAlign软件对猪瘟病毒E2基因推导的氨基酸序列进行比对(图1)。扩增的9株猪瘟病毒的E2基因,Dezhou-1株和Zaozhuang-1株在20位氨基酸位点与其他毒株位点有所不同,这些毒株与Shimen株和HCLV株对比,均存在11个氨基酸位点的突变:4 aa (L-P)、8 aa (G-E)、15 aa (K-R)、24 aa (N-D)、29 aa (K-R)、33 aa (V-T)、40 aa (T-I)、56 aa (G-R)、59 aa (L-P)、72 aa (N-S)和74 aa (S/L-A)。2.4 E0基因的核苷酸序列及推导的氨基酸序列同源性比较

E0基因的2个RNase活性区域和猪瘟病毒的毒力等相关,运用MegAlign软件对扩增的猪瘟病毒E0基因的RNase活性区域进行比对(图2)。2.6 基于5′UTR和E2基因的进化树分析

【参考文献】：
期刊论文
[1]2015-2017年山东地区CSFV、PRRSV和PRV的流行病学调查与分析[J]. 张树金,曾昊,于江,陈智,张玉玉,王鑫,陈蕾,唐融志,郭立辉,任素芳,邱文彬,李玉保,吴家强.  中国兽医学报. 2019(06)
[2]福建省一株猪瘟病毒流行毒株全基因组序列测定与分析[J]. 魏春华,刘建奎,戴爱玲,曾建平,林炜明,杨小燕.  动物医学进展. 2018(10)
[3]猪瘟综合防控研究进展[J]. 任世斌,赵亮,郭抗抗,林青.  动物医学进展. 2018(09)
[4]2012年—2016年云南省部分地区规模猪场4种常见病毒感染情况的调查[J]. 宋春莲,曾敬元,陶杨,张雪,谢相悦,刘永波,吴常月,李鑫,凌万旭,何锦,张桂生,兰春林,王艳芬,李鲜,舒相华.  动物医学进展. 2018(01)
[5]2014-2015年河南省猪瘟野毒E2、E0基因变异分析[J]. 李栋梁,王新港,郭天准,常洪涛,崔丹丹,赵军,杨霞,李永涛,陈陆,王川庆.  中国兽医学报. 2017(07)
[6]猪瘟诊断技术的应用进展[J]. 许光勇,王朝军,周海深,徐利.  中国猪业. 2017(05)
[7]猪瘟病毒流行毒株遗传演化分析与免疫对策[J]. 吴家强.  兽医导刊. 2016(23)
[8]猪瘟病毒和猪繁殖与呼吸综合征病毒高致病性/经典毒株多重RT-PCR方法的建立及应用[J]. 王晓波,李丽敏,袁万哲,宋勤叶,孙泰然,逯继成.  中国兽医学报. 2015(05)
[9]山西猪瘟野毒株E2基因序列测定与遗传变异多样性分析[J]. 姚敬明,孟帆,雷宇平,吴忻,王娟萍,刘文俊,韩一超,樊振华,张瑞琴,米瑞娟.  中国兽医学报. 2014(09)

硕士论文
[1]2012-2013年广西猪瘟流行病学调查[D]. 欧莹.广西大学 2014



本文编号：3131305