广西猪嵴病毒的感染状况调查与基因序列分析

发布时间：2021-04-15 03:35

　　本研究采用RT-PCR方法对从广西9个地市采集的猪肠样以及猪粪便样品进行了猪嵴病毒（PKV）的检测,从498份样品中检测出159份阳性,阳性率为31.9%,从阳性病料中挑选21株猪嵴病毒毒株进行完整的ORF基因测序分析。在这21株毒株中有14株毒株ORF全长7467bp,编码2488个氨基酸;有7株毒株在2B基因位置连续缺失90个碱基,ORF全长7377bp,编码2458个氨基酸。广西毒株的多聚蛋白的预测剪切位点与PKV标准毒株S-1一致。广西毒株的完整ORF框与猪嵴病毒的参考毒株进行同源性比对,发现这些毒株的核苷酸同源性为86.5%-90.3%,氨基酸同源性为93.0%-97.2%；与其他动物源性的嵴病毒相比,同源性最高的是羊源,核昔酸同源性为73.2%-74.1%,氨基酸同源性为77.0%-78.2%；而同源性最低的是人源,核苷酸和氨基酸同源性分别为57.9%-59.0%和60.6%-61.5%。分析猪嵴病毒各个基因片段,发现21株毒株与猪嵴病毒参考毒株核苷酸变异最大的是VP0,同源性仅为79.8%-89.7%,而突变最小的为3D,同源性高达91%-94%；氨基酸方面,氨基酸变化最... 

【文章来源】：广西大学广西壮族自治区 211工程院校

【文章页数】：67 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

病毒粒子模式图

日本学者就是采用憐妈酸负染的电镜方法发现了BKV U-1株与AiV粒子很相似，并结合其他方法确定了U-1是嵴病毒的一个新种（图1-3)。IHHHHAichi vims. U-1 strain FV-1图1-3电子显微镜下的AiV以及负染色的BKV和PV-1 (引自Teruo Yamashita等，2003)Fig 】-3 Electrom micrograph of Aichi Virus,U-1 stain and PV-1 stain with 2% phosphotungsticacid(PH=7.2) for 2 min9

D基因RT-PCR产物电泳图

【参考文献】：
期刊论文
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硕士论文
[1]河南猪嵴病毒分子流行病学调查、全基因序列分析、VP1蛋白表达及其初步应用[D]. 姬郭彪.河南农业大学 2013
[2]猪嵴病毒全基因组序列分析及荧光定量PCR检测方法的建立[D]. 王长松.上海交通大学 2013



本文编号：3138589