寒泊羊脂联素基因表达及生物信息学分析

发布时间：2021-05-05 16:42

　　试验旨在探究脂联素（adiponectin,ADIPOQ）基因在不同月龄寒泊羊背最长肌组织中的表达规律及生物学特征。采用实时荧光定量PCR方法对3个不同时期（1、7、13月龄）寒泊羊背最长肌组织中ADIPOQ基因mRNA表达水平进行检测,并利用生物信息学方法分析ADIPOQ基因的核苷酸及编码氨基酸序列分子结构特征、蛋白特性及网络互作蛋白。结果显示,ADIPOQ基因在1、7、13月龄寒泊羊背最长肌组织中均有表达,并随着月龄增加呈现增加趋势,无显著性差异（P>0.05）。绵羊ADIPOQ基因核苷酸及氨基酸序列与山羊（98.60%和99.00%）、牛（98.60%和87.00%）的同源性较高。蛋白理化性质分析发现,ADIPOQ蛋白分子式为C₁₁₇₂H₁₇₇₆N₃₁₄O₃₄₉S₅,分子质量为26.00 ku,理论等电点（pI）为5.88,推测该蛋白为酸性蛋白;ADIPOQ亲水性总平均值（GRAVY）为-0.403,推测该蛋白为亲水性蛋白,不属于跨膜蛋白;信号肽序列为Met

【文章来源】：中国畜牧兽医. 2020,47(12)北大核心

【文章页数】：10 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 样品采集
    1.2 主要试剂
    1.3 组织RNA提取及cDNA合成
    1.4 引物设计及合成
    1.5 实时荧光定量PCR
    1.6 统计分析
    1.7 生物信息学分析
        1.7.1 序列获取及系统进化树的构建
        1.7.2 理化性质分析及亚细胞定位预测
        1.7.3 蛋白高级结构预测
        1.7.4 蛋白互作网络预测
2 结 果
    2.1 RNA提取与质量检测
    2.2 ADIPOQ基因在不同月龄寒泊羊背最长肌中的表达量
    2.3 绵羊ADIPOQ基因生物信息学分析
        2.3.1 不同物种ADIPOQ基因核苷酸及氨基酸序列相似性比对及系统发育分析
        2.3.2 ADIPOQ蛋白理化性质分析
        2.3.3 ADIPOQ蛋白亲/疏水性预测分析
        2.3.4 ADIPOQ跨膜结构预测
        2.3.5 ADIPOQ磷酸化位点预测
        2.3.6 ADIPOQ蛋白亚细胞定位预测
        2.3.7 ADIPOQ蛋白保守结构域分析
        2.3.8 ADIPOQ蛋白高级结构预测
        2.3.9 ADIPOQ蛋白互作网络分析
3 讨 论
4 结 论


【参考文献】：
期刊论文
[1]贵州黑山羊ADIPOQ基因组织表达分析及脂肪中表达规律研究[J]. 杨洋,陈浩林,徐敏,倪锴.  中国畜牧杂志. 2020(10)
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[3]牛肌内前体脂肪细胞的分离培养及分化相关基因的表达规律研究[J]. 张萌萌,魏胜娟,王艺如,王深圳,郑月英,郑豪,颜培实.  畜牧与兽医. 2018(05)
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[5]淮南猪与长白猪脂肪代谢酶及脂联素的发育差异[J]. 苗志国,谢红兵,王永强,魏刚才.  贵州农业科学. 2018(01)
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[7]藏山羊脂联素基因的克隆与表达分析[J]. 李雪梅,薛科,仲涛,李利,王林杰,张红平.  中国畜牧兽医. 2014(06)
[8]鸭脂联素基因多态对肉质和血清生化指标的影响[J]. 张依裕,李万贵,潘兰兵,林家栋,刘若余.  基因组学与应用生物学. 2014(02)
[9]藏羊脂联素基因多态性及其与产肉性能的相关性分析[J]. 杨树猛,马登录,郭淑珍,李保明,马忠涛,才让闹日,牛小莹,格桂花,赵光平,杨秀兰,张玉珍,尕旦吉,张海滨.  中国草食动物科学. 2014(02)
[10]脂联素（AdipoQ）及其受体基因（AdipoR1 and AdipoR2）在猪背最长肌和腰大肌中的表达差异[J]. 罗宗刚,李祥,李明洲,李学伟.  农业生物技术学报. 2011(03)



本文编号：3170229