猪繁殖与呼吸综合征病毒贵州株GZ-RNSP2基因的克隆与遗传变异分析

发布时间：2021-05-12 07:38

　　为了解猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）贵州株GZ-R的遗传变异情况及其NSP2基因的特征,本试验基于NSP2基因设计了2对特异性引物对目的基因进行巢式RT-PCR、克隆和序列分析。结果显示,第二轮巢式PCR除扩增出约3 000 bp的预期条带外,还扩增出另一条约1 200 bp的条带;将两DNA片段克隆至pMD19-T载体后经测序得到两条片段,大片段长2 980 bp,命名为GZR-NSP2-L;小片段长1 131 bp,命名为,GZR-NSP2-S;两片段同源性比对发现,GZR-NSP2-S具有GZR-NSP2-L N端第1-945位核苷酸与C端第2 795-2 980位核苷酸,缺失GZR-NSP2-L第946-2 794位之间的核苷酸;GZR-NSP2-L与VR-2332株、Lelystad virus株的核苷酸同源性分别为81.2%、48.6%;编码氨基酸同源性比对结果与核苷酸同源性结果一致,揭示PRRSV GZ-R株属于美洲型毒株;氨基酸缺失位点比对发现,GZ-R NSP2在其第481位、第533-561位存在30个不连续氨基酸的缺失,缺失位点与PRRSV高致病性毒株一致。... 

【文章来源】：中国畜牧兽医. 2020,47(11)北大核心

【文章页数】：8 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 材料
        1.1.1 病料
        1.1.2 主要试剂
    1.2 方法
        1.2.1 引物设计与合成
        1.2.2 病毒总RNA的提取和cDNA合成
        1.2.3 PRRSV NSP2基因巢式RT-PCR
        1.2.4 PRRSV NSP2基因克隆
        1.2.5 GZ-R NSP2基因遗传变异分析
2 结 果
    2.1 NSP2基因巢式RT-PCR结果
    2.2 GZ-R NSP2克隆质粒PCR鉴定结果
    2.3 同源性比对结果
        2.3.1 GZR-NSP2-L、GZR-NSP2-S测序和比对结果
        2.3.2 GZR-NSP2-L核苷酸同源性比对结果
        2.3.3 GZR-NSP2-L编码氨基酸同源性比对结果
    2.4 GZR-NSP2-L编码氨基酸缺失位点分析
    2.5 GZR-NSP2-L核苷酸遗传进化树分析
3 讨 论
4 结 论


【参考文献】：
期刊论文
[1]内蒙古自治区PRRSV分离株全基因测序与遗传变异分析[J]. 解蕊伊,温树波,李卓昕,解长占,赵冠宇,庄忻雨,张赫,任静强,鲁会军.  中国病原生物学杂志. 2019(05)
[2]猪繁殖与呼吸综合征病毒细胞受体功能研究进展[J]. 王向鹏,陈璐,张赟.  中国预防兽医学报. 2018(07)
[3]猪繁殖与呼吸综合征病毒的遗传变异与演化[J]. 杨汉春,周磊.  生命科学. 2016(03)
[4]一株不能被高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒（HP-PRRSV）疫苗抗血清中和的HP-PRRSV的分离鉴定[J]. 陈家锃,白云,常丹,张秋月,王倩,冷超粮,张武超,赵鸿远,叶超,李琳,田志军,彭金美,安同庆,童光志.  中国预防兽医学报. 2014(03)

硕士论文
[1]EDC3蛋白与PRRSV作用关系的探究[D]. 李昌红.贵州大学 2019
[2]猪繁殖与呼吸综合征病毒分离鉴定、变异与重组及致病性研究[D]. 王新港.河南农业大学 2018



本文编号：3183022