玻璃化冷冻牛GV卵母细胞全基因组甲基化模式初探

发布时间：2021-06-07 06:43

　　旨在研究玻璃化冷冻对牛GV期卵母细胞全基因组甲基化的影响。本研究收集新鲜、玻璃化冷冻的牛GV卵母细胞,采用单细胞全基因组甲基化测序（ScWGBS）技术对新鲜、玻璃化法冷冻牛GV卵母细胞的全基因组甲基化水平进行检测,旨在揭示两者DNA甲基化模式的差异。结果表明,玻璃化冷冻不会对牛GV卵母细胞的全基因甲基化水平造成显著影响。基于基因本体（GO）和信号通路（KEGG）对140个差异甲基化区域（DMRs）进行分析,发现DMRs主要参与细胞发育、细胞骨架组织等功能,主要富集在PI3K-Akt信号通路、GnRH信号通路等,并筛选出与卵母细胞成熟（TSC2）、细胞骨架（NUDC）、细胞活力（MAFK）等相关的基因。上述结果,可为提高GV卵母细胞玻璃化冷冻效率奠定信息基础和研究方向。 

【文章来源】：畜牧兽医学报. 2020,51(05)北大核心CSCD

【文章页数】：10 页

【部分图文】：

F_GV、V_GV组的DMR聚类图

差异甲基化区域相关基因的GO富集结果

图2 差异甲基化区域相关基因的GO富集结果如表1所示,本试验中两组样品Q30平均值均大于89%。同时,F_GV、V_GV组样品过滤后比对到基因组上的序列数占过滤后序列数的平均百分比分别为35.18%、35.87%,较人卵母细胞(29.4%)[22]、小鼠肝细胞(32.3%)测序结果高[24]。这些结果说明,本试验测序结果可靠,可用于下一步分析。

【参考文献】：
期刊论文
[1]新鲜、玻璃化冷冻牛卵母细胞体外受精囊胚全基因组甲基化模式初探[J]. 赵亚涵,郝海生,杜卫华,庞云渭,闫长亮,刘岩,赵善江,赵学明,朱化彬.  畜牧兽医学报. 2019(06)



本文编号：3216081