一株猪流感病毒A/swine/Shanghai/01/2019（H1N1）的分离鉴定及遗传进化分析

发布时间：2021-06-07 15:48

　　为鉴定上海地区猪流感病毒的流行株及其分子生物学特征,本研究从上海地区养殖场采集疑似流感症状的猪咽拭子样品40份,采用套式PCR结合鸡胚分离鉴定方法,从中分离到1株H1N1亚型猪流感病毒（SIV）,命名为A/swine/Shanghai/01/2019（H1N1）。经全基因组测定和遗传进化分析结果显示该分离株的8个基因节段与欧亚类禽H1N1 SIV同源性最高,其PB2、PB1、PA基因节段可能来源于A/swine/Jiangsu/49/2012（H1N1）病毒,NA、NP和M基因节段可能来源于A/swine/Shanghai/3/2014（H1N1）病毒。该分离病毒的HA蛋白裂解位点为PSIQSR↓GLFGAI,为低致病性流感病毒的分子特征。该分离株NA蛋白未出现与神经氨酸酶抑制剂相关的氨基酸突变,M2蛋白S³¹N突变表明该病毒可能对金刚烷胺类药物具有一定的耐药性。PA蛋白²²⁴S和PB2蛋白⁷⁰¹N突变提示该分离株对哺乳动物的适应性增强,可能导致其致病性增强,需要加强对此类SIV的监测。结合近年来的监测表明,上海地区猪群... 

【文章来源】：中国预防兽医学报. 2020,42(08)北大核心CSCD

【文章页数】：5 页

【部分图文】：

SIV的分离鉴定（A）及8个基因节段的扩增（B）结果

对毒株A swine/Shanghai/01/2019的8个基因节段进行序列测定分析，结果显示，分离株HA、PB2、PB1、PA基因与A/swine/Jiangsu/49/2012(H1N1）的同源性最高，达99.2%～99.8%；而NA、NP、M和NS基因则与A swine/Shanghai/3/2014(H1N1）毒株的同源性最高，达99.5%～100%。通过将分离株的8个基因节段的核苷酸序列与GenBank中的经典型H1N1、欧亚类禽型H1N1、类人型H1N1和2009H1N1分支代表毒株进行比对分析，结果显示，A/swine/Shanghai/01/2019的8个基因节段均属于欧亚类禽型H1N1进化分支，未出现不同基因型流感病毒片段之间的重组，与江苏省猪群中分离出的类禽型H1N1 SIV亲源关系很近（图2）。结合近年来监测结果发现，欧亚类禽型H1N1 SIV在我国猪群感染具有持续性，自2006年后成为主要流行株，虽然其致病力相对较低，但可感染人类，并通过空气飞沫传播，因此值得长期持续检测。2.3 HA蛋白关键氨基酸位点分析

【参考文献】：
期刊论文
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[3]一株类禽型H1N1亚型猪流感病毒的反向遗传系统的建立[J]. 孟沙沙,乔传玲,陈艳,杨焕良,刘丽萍,尹航,辛晓光,陈化兰.  中国预防兽医学报. 2013(02)
[4]多重RT-PCR检测猪流感病毒及血清亚型[J]. 刘惠莉,周宗清,邢继兰,潘洁,杨秋峰,饶柏忠.  中国兽医学报. 2008(11)
[5]套式RT-PCR方法检测临床样品中的猪流感病毒[J]. 祁贤,陆承平,王贵平,宋长绪.  中国病毒学. 2005(02)



本文编号：3216860