鸡肠道微生物的群落结构和功能基因与鸡的健康养殖

发布时间：2021-06-23 14:01

　　鸡肉生产对全球食品安全至关重要。长期以来,亚治疗剂量的抗生素在养鸡行业中被广泛用作促生长剂,并导致了抗生素抗性问题,对公共健康产生了威胁。博落回提取物（MCE）是一种植物源的天然促生长剂,其主要有效成分为苄基异喹啉生物碱,能替代抗生素产生促生长的效果。虽然各类促生长剂的作用机制尚未被完全解析,但已明确肠道微生物在其中有重要作用。为了更好地研究肠道微生物的促生长作用机制,本研究建立了一种从鸡肠道内容物中提取宏基因组DNA的方法,并构建了首个鸡肠道微生物宏基因集。然后在此基础上,研究了鸡的前肠与后肠微生物菌群的不同特征和随时间变化的规律。在鸡的饲料中添加博落回提取物（MCE）和金霉素（CTC）,均能提高鸡的生长性能,并且影响前肠微生物的菌群特征。博落回提取物（MCE）增强了前肠中益生菌乳酸菌属（Lactobacillus）的相对丰度,也增强了菌群中氨基酸、维生素和次级胆汁酸的生物合成通路,为宿主提供了营养补充。金霉素（CTC）促进了天然生产抗生素的北里孢菌属（Kitasatospora）和链霉菌属（Streptomyces）,并且增强了抗生素、脂肪酸、不饱和脂肪酸和次级胆汁酸的微生物合成通... 

【文章来源】：中国农业科学院北京市

【文章页数】：68 页

【学位级别】：博士

【图文】：

肠道微生物宏基因组DNA的实验处理流程

２．?Ａ．差速离心富集微生物细胞示意图Ｂ．裂解破碎微生物细胞糜颗粒沉淀，取上清微生物细胞悬浮液进行高速离心，富集得到微生物细胞。液９５°Ｃ高温破碎方法进行第一轮细胞裂解破碎，ａ得到含ＤＮＡ的上清液；ｂ磨破碎、裂解液９５°Ｃ高温破碎，得到含ＤＮＡ的上清液；ｃ混合两次得到的ＤＮＡ１３??

测和去冗余分析，得到包含９，０３７，２４１个非冗余基因的宏基因集，开放阅??读框（ＯＲＦ）的平均长度为６９７?ｂｐ。??对所有样品进行基因的稀释曲线分析。如图４所示，稀释曲线最终??接近于饱和，即随着样品数的增加，基因数目几乎不再变化，表明该宏??基因集已包含了鸡肠道微生物中绝大多数的基因。如果使用单一地区样??品或者单一肠段样品做稀释曲线分析，则不能达到９．０?Ｍ的基因数目和??较高的饱和度。可见，使用不同品种地区和不同肠段来源的鸡肠道样品，??对构建完整的鸡肠道微生物宏基因集是非常必要的。??２０??


本文编号：3245068