一株塞内卡病毒的分离与鉴定
发布时间:2021-07-04 03:32
2018年11月,河南南阳地区某养殖场发生了猪水疱病,经实验室检测确诊为塞内卡病毒(SVV)感染。选择SVV检测阳性的临床样品,处理后接种PK-15细胞,经多次传代培养,成功分离到1株塞内卡病毒,命名为HeNNY-1/2018株,并在PK-15细胞上对该毒株进行了空斑纯化和生长曲线的绘制。为进一步研究其遗传进化特点,采用RT-PCR技术扩增了其全基因组序列,并分别构建了基于VP1基因和全基因组的系统进化树。结果表明,分离株HeNNY-1/2018在感染后第24小时病毒效价最高为107.6TCID50/m L。基因组核苷酸同源性分析显示,分离株HeNNY-1/2018与我国广西分离毒株GXHZH-1和美国毒株KS15-01呈现较高的核苷酸同源性,分别为98.0%和98.7%。进一步分子进化树分析显示,该毒株与2018年报道的广西地区的毒株处于较近的进化分支,而与我国早年间分离得到的其他毒株亲缘关系较远。本研究为河南地区塞内卡病毒流行状况提供了新的证据,也为下一步研究该病的诊断和防控提供了有力支撑。
【文章来源】:中国兽医科学. 2020,50(09)北大核心CSCD
【文章页数】:7 页
【部分图文】:
临床样品的病原检测
使用已发表的用于全基因组扩增的引物进行扩增,成功获得了7条目的条带,条带大小基本与预期相符(见图5)。经克隆测序后,拼接得到HeNNY-1/2018毒株的全基因组序列信息,全长共7 285 bp,其中1~668 bp为5′-UTR区,7 215~7 285 bp为3′-UTR区,中间部分为ORF区,详细数据已提交至GenBank数据库(登录号MK357116)。图3 病毒空斑
病毒空斑
【参考文献】:
期刊论文
[1]健康猪体内塞尼卡病毒的分离和鉴定[J]. 张志,张丽丽,张美晶,刘爽,张峰,董雅琴,张慧,崔进,吴发兴,李晓成. 中国预防兽医学报. 2019(04)
[2]塞内卡谷病毒荧光RT-RPA快速检测方法的建立[J]. 林彦星,曹琛福,花群俊,黄超华,杨俊兴,徐铮,史卫军,阮周曦,花群义. 中国兽医科学. 2018(12)
[3]猪塞尼卡谷病毒病现状与未来防控思考[J]. 樊晓旭,迟田英,吴晓东,王志亮. 中国动物检疫. 2018(02)
本文编号:3263943
【文章来源】:中国兽医科学. 2020,50(09)北大核心CSCD
【文章页数】:7 页
【部分图文】:
临床样品的病原检测
使用已发表的用于全基因组扩增的引物进行扩增,成功获得了7条目的条带,条带大小基本与预期相符(见图5)。经克隆测序后,拼接得到HeNNY-1/2018毒株的全基因组序列信息,全长共7 285 bp,其中1~668 bp为5′-UTR区,7 215~7 285 bp为3′-UTR区,中间部分为ORF区,详细数据已提交至GenBank数据库(登录号MK357116)。图3 病毒空斑
病毒空斑
【参考文献】:
期刊论文
[1]健康猪体内塞尼卡病毒的分离和鉴定[J]. 张志,张丽丽,张美晶,刘爽,张峰,董雅琴,张慧,崔进,吴发兴,李晓成. 中国预防兽医学报. 2019(04)
[2]塞内卡谷病毒荧光RT-RPA快速检测方法的建立[J]. 林彦星,曹琛福,花群俊,黄超华,杨俊兴,徐铮,史卫军,阮周曦,花群义. 中国兽医科学. 2018(12)
[3]猪塞尼卡谷病毒病现状与未来防控思考[J]. 樊晓旭,迟田英,吴晓东,王志亮. 中国动物检疫. 2018(02)
本文编号:3263943
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