牦牛肌钙蛋白Ⅰ基因家族的克隆及组织表达分析

发布时间：2021-07-12 01:15

　　为了克隆TNNI基因家族,预测其蛋白结构和功能,并分析其在牦牛不同组织中的表达差异,以0.5岁健康的类乌齐牦牛为试验材料,采用RT-PCR技术克隆牦牛肌钙蛋白Ⅰ基因家族的CDS区序列并进行生物信息学分析,利用实时荧光定量PCR技术检测TNNI基因家族各成员的mRNA表达水平。结果表明,TNNI1、TNNI2和TNNI3基因CDS区大小分别为564,549,639 bp,分别编码187,182,212个氨基酸残基。预测分析结果显示:TNNI基因家族编码的蛋白质均为偏碱性蛋白,蛋白结构不稳定,均无跨膜结构域,无信号肽,属非分泌型蛋白;二、三级结构均以α-螺旋为主,均含有肌蛋白超家族保守结构域。系统进化树分析表明:类乌齐牦牛TNNI1基因与水牛的亲缘关系最近,其次是绵羊、黄牛,与小鼠亲缘关系最远;TNNI2和TNNI3均与黄牛、水牛的亲缘关系较近,与其他亲缘关系较远。实时荧光定量PCR结果显示,TNNI1和TNNI2基因在臀肌中的相对表达量最高,且TNNI1基因在心脏、肝脏和肺脏中的表达量显著高于TNNI2基因（P<0.05）,TNNI3基因在心脏中表达量较高,而在肺脏、臀肌和肝脏中表... 

【文章来源】：华北农学报. 2020,35(02)北大核心CSCD

【文章页数】：11 页

【部分图文】：

牦牛TNNI1基因编码蛋白保守结构域预测

牦牛TNNI2基因编码蛋白保守结构域预测

牦牛TNNI3基因编码蛋白保守结构域预测

【参考文献】：
期刊论文
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博士论文
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硕士论文
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[2]小尾寒羊TNNI2和TNNI3基因的克隆、结构分析及组织表达分析[D]. 张阳.山东农业大学 2016
[3]天府肉羊TNNI1和TNNI3基因的克隆、表达及其与肌肉组织学性状相关性研究[D]. 吴婷婷.四川农业大学 2013
[4]绵羊MYOZ2和MYOZ3基因的克隆及在凉山半细毛羊组织的时空表达[D]. 苏强强.四川农业大学 2011
[5]山羊CAPN1基因和CAST基因Ⅱ型转录本克隆及在不同组织中的表达[D]. 赵伯阳.四川农业大学 2011
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本文编号：3278891