聚合酶保真性下降导致口蹄疫病毒减毒的研究
发布时间:2021-07-21 21:14
口蹄疫(Foot-and-Mouth Disease, FMD)是由口蹄疫病毒(Foot-and-Mouth Disease Virus, FMDV)引起的急性、热性传染病,主要侵害猪、牛、羊等偶蹄动物。该病一旦爆发对出口贸易将造成严重的影响,给发病国家和地区带来巨大的经济损失。世界动物卫生组织(OIE)将其列为必须通报的动物疫病。FMDV属于微RNA病毒科(Picornaviridae)口蹄疫病毒属(Aphthovirus)的成员,病毒基因组是由单股正链RNA组成。微RNA病毒基因组编码的3D非结构蛋白为RNA依赖的RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase, RdRp),是病毒复制酶系统的核心成分,与病毒基因编码的一些其他蛋白以及宿主细胞因子一起构成病毒的复制酶系统,在RNA病毒的复制周期中起重要的作用。由于RdRp缺乏校正功能,使得RNA病毒具有高度异质的准种(quasispecies)特性。已有的研究表明,提高或降低RdRp的保真性可改变RNA病毒种群的遗传多样性和宿主适应性,进而可导致病毒对自然宿主的致病性减弱。因此,依据RdRp的复制保真性对病毒...
【文章来源】:中国农业科学院北京市
【文章页数】:45 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
FMDV的复制周期(引自FieldsVirology.Edition,2007)
包括指手掌区(palm subdomain)、拇指区(thumb subdomain)和手指(finger subdomain)区三个亚结构域(图1.3),其中手掌区尤为保守(Ngetal.,2002;0’reillyetal.,1998)。手掌区亚结构域位于RdRp的中心,其気基酸序列呈高度保守性,RdRp的活性位点多位于手掌区(O'reillyet al., 1998)。手掌区连着 5 个保守基序(motifA-E)(Ferrer-Orta et al., 2004; Van Dijk et al., 2004),这个区域的结构包括一个3链反向平行p片层,侧面与3个a螺旋相连,在己知的多聚核苦酸聚合酶中保守性最高。其中,Motif A—般包含一个P链-转角-a螺旋和一个长的a螺旋结构,p链末端的天冬氨酸残基十分保守,可能参与核音酸转移时与双价离子的结合(Hansen et al., 1997;Steitz, 1998)。MotifA和MotifB被认为参与核昔酸的识别和连接。MotifC包含高度保守的GDD活性位点
突变株的变异频率为4.8/104nt,Y241F突变株的变异频率为4.2/104nt,G36IS突变株的变异频率为5.8/104nt (图2.1)。从这些数据可以看出,与亲本毒株相比,突变株D165E、K172R和G361S的保真性降低最为明显,分别下降了 2.02、1.67和1.49倍。12-1^ 10- 木木T 7 q:8- i 6^5 *J I I I I I^ Z /■ ■/图2.1低保真性FMDV RdRp突变株的产生Fig. 2.1 Generation of FMDV RdRp mutants with low-fidelity polymerase.己有研究显示,复制保真性升高的口蹄疫病毒聚合酶突变株具有抵抗核苷类诱变剂的能力。相反,复制保真性降低的口蹄疫病毒聚合酶突变株对核苷类药物更加敏感。为了分析复制保真性降低是否影响突变株对核苷类诱变剂药物的敏感性,我们进行了药物抵抗试验,检测突变株对不20
【参考文献】:
期刊论文
[1]准种的研究现状[J]. 王均,许红梅. 儿科药学杂志. 2011(01)
[2]2003~2008年世界口蹄疫流行分布与分析[J]. 张怀宇,范运峰,邹兴启,荆文魁,刘彩霞,王伊琴. 检验检疫学刊. 2009(02)
[3]1990-2001年世界口蹄疫流行情况及其防治对策[J]. 袁文泽,苏永生,李春阵,庄仁礼. 中国动物检疫. 2002(02)
硕士论文
[1]口蹄疫病毒Asia1/1/YZ/CHA/06的全基因组序列分析[D]. 王海伟.中国农业科学院 2008
本文编号:3295788
【文章来源】:中国农业科学院北京市
【文章页数】:45 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
FMDV的复制周期(引自FieldsVirology.Edition,2007)
包括指手掌区(palm subdomain)、拇指区(thumb subdomain)和手指(finger subdomain)区三个亚结构域(图1.3),其中手掌区尤为保守(Ngetal.,2002;0’reillyetal.,1998)。手掌区亚结构域位于RdRp的中心,其気基酸序列呈高度保守性,RdRp的活性位点多位于手掌区(O'reillyet al., 1998)。手掌区连着 5 个保守基序(motifA-E)(Ferrer-Orta et al., 2004; Van Dijk et al., 2004),这个区域的结构包括一个3链反向平行p片层,侧面与3个a螺旋相连,在己知的多聚核苦酸聚合酶中保守性最高。其中,Motif A—般包含一个P链-转角-a螺旋和一个长的a螺旋结构,p链末端的天冬氨酸残基十分保守,可能参与核音酸转移时与双价离子的结合(Hansen et al., 1997;Steitz, 1998)。MotifA和MotifB被认为参与核昔酸的识别和连接。MotifC包含高度保守的GDD活性位点
突变株的变异频率为4.8/104nt,Y241F突变株的变异频率为4.2/104nt,G36IS突变株的变异频率为5.8/104nt (图2.1)。从这些数据可以看出,与亲本毒株相比,突变株D165E、K172R和G361S的保真性降低最为明显,分别下降了 2.02、1.67和1.49倍。12-1^ 10- 木木T 7 q:8- i 6^5 *J I I I I I^ Z /■ ■/图2.1低保真性FMDV RdRp突变株的产生Fig. 2.1 Generation of FMDV RdRp mutants with low-fidelity polymerase.己有研究显示,复制保真性升高的口蹄疫病毒聚合酶突变株具有抵抗核苷类诱变剂的能力。相反,复制保真性降低的口蹄疫病毒聚合酶突变株对核苷类药物更加敏感。为了分析复制保真性降低是否影响突变株对核苷类诱变剂药物的敏感性,我们进行了药物抵抗试验,检测突变株对不20
【参考文献】:
期刊论文
[1]准种的研究现状[J]. 王均,许红梅. 儿科药学杂志. 2011(01)
[2]2003~2008年世界口蹄疫流行分布与分析[J]. 张怀宇,范运峰,邹兴启,荆文魁,刘彩霞,王伊琴. 检验检疫学刊. 2009(02)
[3]1990-2001年世界口蹄疫流行情况及其防治对策[J]. 袁文泽,苏永生,李春阵,庄仁礼. 中国动物检疫. 2002(02)
硕士论文
[1]口蹄疫病毒Asia1/1/YZ/CHA/06的全基因组序列分析[D]. 王海伟.中国农业科学院 2008
本文编号:3295788
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