鸡胚外泌体miRNAs功能分析
发布时间:2021-08-02 22:50
旨在基于鸡胚外泌体及所含有的miRNAs解析其产生生理功效的活性物质基础及作用机制。本研究收集13胚龄惠阳胡须鸡胚蛋18枚(3组,每组6枚),采用酶消化、蔗糖密度梯度和差速超速离心等方法分离鸡胚组织来源的外泌体,经透射电镜、纳米流式和标志蛋白流式检测等方法鉴定其特征。利用高通量测序方法研究外泌体样本中miRNAs表达谱,对各样本top 10且共表达的miRNAs进行靶基因预测与功能分析。结果表明,分别获得了3个浮力密度范围(S1:1.13 g·mL-1、S2:1.21 g·mL-1和S3:1.32 g·mL-1)具有外泌体典型特征的胞外囊泡;与miRBase V21进行比对发现,S1、S2和S3样品中分别含有675、661和845个已知的miRNAs,这些miRNAs中有488个(52.6%)三者共有,包括了广泛参与细胞增殖、分化和免疫应答等过程的功能性miRNAs。TargetScan 7.2和miRDB预测得到3个样本中top 10且共表达的56个miRNAs的靶基因,获得的3 650个靶基因经DAVID分析,显著富...
【文章来源】:畜牧兽医学报. 2020,51(06)北大核心CSCD
【文章页数】:11 页
【部分图文】:
鸡胚组织中胞外囊泡分离流程
表2 miRNA荧光定量验证特异性引物Table2 miRNA-specific primers for qPCR miRNA名称Name 引物Primer miRNA名称Name 引物Primer gga-miR-203a GCGGTGAAATGTTTAGGACCACTTG gga-miR-205a CTCCTTCATTCCACCGGAGTCTG gga-miR-155 GCCTTAATGCTAATCGTGATAGGGG gga-miR-122-5p GCTGGAGTGTGACAATGGTGTTTGT gga-miR-148a-3p GCGTCAGTGCACTACAGAACTTTGT gga-miR-30a-5p GCTTGTAAACATCCTCGACTGGAAG gga-miR-200a-5p GCGCATCTTACTAGACAGTGCTGGA gga-miR-125b-5p GCTCCCTGAGACCCTAACTTGTGA图7 3个样品top 10共表达miRNAs的维恩图
3个样品top 10共表达miRNAs的维恩图
本文编号:3318418
【文章来源】:畜牧兽医学报. 2020,51(06)北大核心CSCD
【文章页数】:11 页
【部分图文】:
鸡胚组织中胞外囊泡分离流程
表2 miRNA荧光定量验证特异性引物Table2 miRNA-specific primers for qPCR miRNA名称Name 引物Primer miRNA名称Name 引物Primer gga-miR-203a GCGGTGAAATGTTTAGGACCACTTG gga-miR-205a CTCCTTCATTCCACCGGAGTCTG gga-miR-155 GCCTTAATGCTAATCGTGATAGGGG gga-miR-122-5p GCTGGAGTGTGACAATGGTGTTTGT gga-miR-148a-3p GCGTCAGTGCACTACAGAACTTTGT gga-miR-30a-5p GCTTGTAAACATCCTCGACTGGAAG gga-miR-200a-5p GCGCATCTTACTAGACAGTGCTGGA gga-miR-125b-5p GCTCCCTGAGACCCTAACTTGTGA图7 3个样品top 10共表达miRNAs的维恩图
3个样品top 10共表达miRNAs的维恩图
本文编号:3318418
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