利用宏基因组测序技术对大熊猫阴道菌群的研究

发布时间：2021-09-12 08:51

　　为了阐明大熊猫阴道微生物组成,为合理的进行大熊猫阴道感染治疗提供科学依据,本研究利用宏基因组测序技术对不同地区（组别:WLQ、BFX、DJY）和不同年龄（组别:A1、A2、A3）的14个大熊猫阴道分泌物样品进行微生物菌群分析.结果表明:在物种注释上,占主导地位的微生物为变形菌门、担子菌门、厚壁菌门和放线菌门;在功能注释上,注释为碳水化合物代谢、氨基酸代谢的基因是样品中含有微生物数量最多的功能基因;在抗性基因注释上,变形菌门比厚壁菌门和拟杆菌门更易携带耐药基因,且沙门氏菌耐药基因APH3-lb分布存在于所有样品中.此外,不同年龄组大熊猫阴道菌群差异显著;DJY组衣原体比例最高.耐药基因APH3-lb和衣原体对大熊猫繁育存在一定的威胁,需要持续关注. 

【文章来源】：四川大学学报(自然科学版). 2020,57(03)北大核心CSCD

【文章页数】：9 页

【部分图文】：

在属水平上基于 Bray-Curtis 距离的聚类树

在基因功能水平上基于Bray-Curtis距离的聚类树

为研究地区组和年龄组中功能组成的相似度,在KEGG水平上对功能丰度值进行了PCA分析.如图3所示,在地区组中,WLQ组和DJY组的功能具有一定的相似性,BFX组则与WLQ组和DJY组存在一定的差异性.在年龄组中,A1组中的样品在功能上存在一定的相似性,而A2组和A3组中的样品功能差异较明显.总的来说,尽管个体间差异较明显,但每一个组都表现为独立的分布.图4 抗性基因物种归属分析圈图和抗性机制与物种Overview圈图

【参考文献】：
期刊论文
[1]基于高通量测序对四川怀远特色发酵食品微生物群落结构分析[J]. 刘筱雪,袁文娟,丁涛,熊粟栗,张杰,白林含.  四川大学学报(自然科学版). 2019(03)
[2]大熊猫阴道菌群调查[J]. 雷蕾,余星明,曾蔚,费立松,王强,张再蓉,王成东,牛李丽,赵波,钟顺隆.  中国兽医科技. 2001(09)

博士论文
[1]基于宏基因组序列的黑熊肠道微生物组的应用基础研究[D]. 宋璨.重庆大学 2017



本文编号：3393928