山猪Myf5基因SNPs筛查及SNPs组合对三种肉质性状的影响

发布时间：2021-09-19 01:32

　　猪肉作为当今世界人们生活最主要的肉制品来源,其肉质品质及肉质安全问题越来越受人们的重视。我国是世界上第一猪肉生产国与消费国,猪肉产量和消费量占世界总产量和总消费量的一半左右,人们的饭桌上几乎离不开猪肉。而猪肉的肉质性状是由多基因控制的复杂的复合性状,受到多种肉质基因的共同影响,而单个基因的影响又是通过其碱基序列的突变而产生的。Myf5是生肌调节因子家族（MRFs）的成员之一,控制早期肌肉的分化,是影响肉质的候选基因之一。早期对Myf5的多态性的研究多为研究基因部分片段的部分SNPs与肉质的相关性,却很少有扩增Myf5基因全长,研究所有SNPs及其组成的单倍型对肉质的影响,并且在山猪这个特殊的地方猪种中更没有系统的分析研究。本研究对不同山猪血统的猪种的部分肉质性状进行检测,并在之前Myf5基因研究的基础上,利用PCR-SSCP扩增Myf5全部的外显子片段,找出Myf5基因编码序列上所有的突变位点,对Myf5的全部外显子进行多态性分析,并利用SPSS statistics16.0分析单个SNP及SNPs组成的单倍型对部分肉质性状的影响,同时采用荧光定量PCR检测不同样本背最长肌的Myf5基... 

【文章来源】：南京师范大学江苏省 211工程院校

【文章页数】：58 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
第一章 文献综述
    1.1 猪肉质研究现状
        1.1.1 用于猪肉质研究的猪品种资源
        1.1.2 山猪品种资源状况
        1.1.3 中国地方猪品种遗传多样性研究
        1.1.4 山猪的遗传结构研究
    1.2 猪肉质的评定及影响因素
        1.2.1 猪肉质的评定
        1.2.2 肌肉组织学特性对肉质的影响
        1.2.3 肉质相关基因对肉质的影响
    1.3 MRFs研究现状
        1.3.1 MRF简介
        1.3.2 Myf5研究现状
        1.3.3 Myf5对肌肉分化的作用
        1.3.4 Myf5作为影响生长性能的肉质性状候选基因的研究
    1.4 分子遗传标记在动物遗传育种中的应用
        1.4.1 分子遗传标记简介
        1.4.2 SNPs简介
        1.4.3 PCR-SSCP原理及应用
第二章 Myf5基因多态性对三种肉质性状的影响研究
    2.1 材料、仪器与试剂
        2.1.1 实验材料的采集与保存
        2.1.2 实验仪器
        2.1.3 实验试剂
        2.1.4 实验药品、酶和试剂盒
    2.2 实验方法
        2.2.1 猪血液基因组DNA提取
        2.2.2 猪组织基因组DNA提取
        2.2.3 DNA质量检测
            2.2.3.1 DNA紫外分光光度计检测
            2.2.3.2 DNA琼脂糖电泳检测
        2.2.4 PCR-SSCP检测与测序
            2.2.4.1 PCR引物设计与反应条件
            2.2.4.2 PCR产物检测
            2.2.4.3 聚丙烯酰胺凝胶电泳
            2.2.4.4 测序
        2.2.5 胴体重及部分肉质性状测定
        2.2.6 数据处理和统计分析
    2.3 结果与分析
        2.3.1 猪血液和组织DNA浓度和质量的检测
        2.3.2 PCR-SSCP检测结果和序列的比较分析
            2.3.2.1 外显子1测序结果
            2.3.2.2 突变点1和2组成单倍型SSCP检测
            2.3.2.3 外显子2 SSCP检测
            2.3.2.4 外显子3 SSCP检测
        2.3.3 Myf5基因多态性分析
        2.3.4 胴体重、剪切力及蛋白质比较、
            2.3.4.1 不同性别猪胴体重、剪切力及蛋白质比较
            2.3.4.2 不同猪种部分肉质比较
            2.3.4.3 不同山猪血统的山猪杜洛克杂交猪胴体肉质比较
        2.3.5 Myf5基因多态性对部分肉质性状的影响
            2.3.5.1 Myf5基因SNPs对胴体重、剪切力及蛋白质的影响
            2.3.5.2 Myf5基因单倍型对部分肉质性状的影响
    2.4 讨论
        2.4.1 江苏山猪品种资源保护
        2.4.2 SNPs的研究
        2.4.3 不同猪种及不同性别猪基因多态性分析
        2.4.4 基因多态性对部分肉质性状的影响
第三章 Myf5表达分析及其与肉质的相关性研究
    3.1 材料、仪器与试剂
        3.1.1 实验材料的采集与保存
        3.1.2 主要实验仪器
        3.1.3 主要的实验试剂
        3.1.4 主要实验药品
    3.2 实验方法
        3.2.1 猪组织RNA的提取
            3.2.1.1 总RNA的提取
            3.2.1.2 RNA总浓度和质量的检测
        3.2.2 RNA反转录成cDNA
        3.2.3 实时荧光定量PCR
            3.2.3.1 实时荧光定量PCR引物设计
            3.2.3.2 荧光定量PCR反应
        3.2.4 胴体重、剪切力及蛋白质含量的检测
        3.2.5 数据处理和分析
    3.3 结果与分析
        3.3.1 RNA条带检测
        3.3.2 荧光定量PCR产物特异性
        3.3.3 Myf5基因荧光定量PCR分析
            3.3.3.1 Myf5基因在不同猪种中的表达情况
            3.3.3.2 Myf5基因多态性对表达量的影响
            3.3.3.3 Myf5基因表达量与肉质及各肉质相关性分析
    3.4 讨论
参考文献
在读期间发表的学术论文
致谢


【参考文献】：
期刊论文
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[2]利用微卫星PCR技术分析山猪的遗传结构[J]. 伍革民,许晓风,章熙霞,霍金龙,苗永旺,霍海龙.  云南农业大学学报. 2008(01)
[3]猪MyoG基因3′端PCR-SSCP遗传多态性及其遗传效应（英文）[J]. 薛慧良,周忠孝.  生态学杂志. 2007(04)
[4]山猪群体遗传结构的RAPD分析[J]. 伍革民,许晓风,章熙霞.  江苏农业科学. 2007(01)
[5]山猪血清蛋白质多态性聚丙烯酰胺凝胶电泳分析研究[J]. 钱继宁,朱善良,许晓凤,伍革民.  江苏教育学院学报(自然科学版). 2006(03)
[6]浅谈中国家畜多样性的保护[J]. 曹果清,周忠孝.  家畜生态. 2001(02)
[7]新疆褐牛weaver位点部分序列的克隆测序及分析[J]. 单雪松,张沅,李宁.  农业生物技术学报. 2000(03)
[8]家猪染色体C－带作为遗传标记的研究[J]. 徐银学,夏祖灼,甘杰,姜志华.  江苏农业学报. 1994(03)
[9]中国家猪高分辨G-带及模式图[J]. 陈文元,王子淑,王喜忠.  遗传学报. 1991(02)
[10]银染核仁组成区（Ag-NOR）与家猪品种的起源进化[J]. 詹铁生,袁志发,柳万生.  畜牧兽医学报. 1989(01)



本文编号：3400739