猪嵴病毒结构蛋白的克隆及生物信息学分析

发布时间：2021-11-03 20:05

　　猪嵴病毒2008年首次由匈牙利学者Pankovics P从仔猪腹泻样本中检测到阳性扩增,此后,猪嵴病毒在匈牙利、中国、泰国、日本、韩国、意大利和美国等国家相继有相关研究报道。为研究猪嵴病毒（porcine kobuvirus, PKV）福建株的基因结构蛋白的特征,本研究根据GenBank中登录的猪嵴病毒（porcine kobuvirus, PKV） VPO、VP3和VP1基因序列特征设计特异性引物,采用RT-PCR方法对从福建省某疑似流行性腹泻病毒感染的猪场采集腹泻粪便样品和小肠组织混合物中扩增猪嵴病毒VP0、VP3和VP1基因,将扩增后的目的片段克隆后进行序列测定。结果表明,所扩增的目的片段编码有完整的VPO、VP3和VP1开放阅读框。所获的猪嵴病毒福建株VP0基因的核苷酸长度为1098bp,编码366个氨基酸。所编的VP0蛋白大小为38.489kD、其理论等电点（isoelectric point, pI）为6.71、该蛋白所带负电荷氨基酸（天冬氨酸和谷氨酸）（Asp+Glu）残基为19,正电荷氨基酸（赖氨酸和精氨酸）（Arg+Lys）残基为18,该蛋白的原子组成为：C1711H... 

【文章来源】：福建农林大学福建省

【文章页数】：58 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

猪崎病毒基因组结构（引自Reuter等，2009)

2. 1. 1 VPO基因的PGR『增经过特异性引物扩增后，获得的序列为noobp，见图1-1。M 1bp,賴讓:m "3- JLM. I； J500 K腿國图1-1猪嵴病毒VPO基因的扩增Figure 1-1 the PGR products of the VPO gene fragments2.1.2 VPO蛋白的序列分析所获的猪嵴病毒福建株VPO基因的核苷酸长度为1098bp，编码366个氨基酸。经拼接获得的序列为-GGGAACTCAACCACTAACATCTACGGAAGTAATAACAACGTTACTACTGACGTAGGTGCGAACGGTTGGACTCCCACAGTGAACACTGGTCTTGGAGACGGTCCTGTTTCTTCCTCTGCTGATGACCTTGCTGGTCGCTCTGGTGGTTCT27

图2-1猪嵴病毒VP3基因的扩增Figure 2-1 the PCR products of the VP3 gene fragments序列分析病毒福建株VP3基因的核昔酸长度为669bp，编码223个列为：AATCCGGTCCCTCCCCGGGGCTGGAGCTTTTGGTAGGAAATCCCCATCTACGCGATGGAGTCTTTCCGACACCTGCAAAAGTCAATGATTGGCTTGAATTTGCCCACGAGTCTTACACTTGGACAATGGCCGAGACGACGGAGGCTGTGATTGAACCAGTCCTCCTTGCTGCTACTTTGTCACCAACCTCTATGCCCAATGGCGTGGAGAACCTTCACTGGTTCTGCTCAACACTTTGGGCGTCTTGCGCTGCTGCAACCCCACCTGCTaCCCTTCAGCAAGCC

【参考文献】：
期刊论文
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[2]动物嵴病毒病原特点及检测[J]. 代洪波,李淞,周远成,朱玲,徐志文.  病毒学报. 2012(05)
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[4]猪嵴病毒PCR检测方法的建立及其应用[J]. 王长松,兰道亮,华修国.  中国动物检疫. 2012(02)
[5]福建省首次检出Aichi病毒及其分子流行病学调查[J]. 吴冰珊,沈晓娜,王美爱,严延生.  中国人兽共患病学报. 2011(02)



本文编号：3474269