阿拉善戈壁驼与沙漠驼股二头肌转录组学比较研究
发布时间：2021-11-09 06:23
经过多年的社会生产实践,大家发现了一个规律那就是:戈壁驼的体格和产肉量比沙漠驼普遍都大的多。在这个基础上,本文以阿拉善戈壁驼和沙漠驼的股二头肌为研究对象,探索两种骆驼产肉量发生差异的分子机制。采用高通量转录组测序（RNA-seq）技术筛选出阿拉善戈壁驼和沙漠驼股二头肌组织差异表达基因。利用数据库对差异基因进行GO功能注释和信号通路分析。本研究的主要结果如下显示:（1）高通量转录组测序结果显示,阿拉善沙漠驼5个样本得到的总Reads数分别是 47100696/63323176/5197540/49347678/61617914,其中 clean Reads 数分别是46041008/62211266/50906716/48313858/60988046,戈壁驼 5 个样本得到的总 Reads数分别是 53658154/59330764/56583910/46423336/65432244;Clean reads 数分别是52687830/58009318/54861640/45504318/64529048,Clean reads 数占比都达 90%以上,这表明测序结果饱和度良好,测序数...
【文章来源】：内蒙古农业大学内蒙古自治区
【文章页数】：71 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图１阿拉善沙漠驼
沙漠驼股二头肌转录组学的比较研究???总ＲＮＡ??Ｉ????〇，ＢＫＡｄ＾＾?太除?ｒＲＮＡ?＜？典核?Ｓｍａｌｌ?ＲＮＡ??上ｍ５％；）衣核?及拟核生物）??－ｐ???ｖ?＼ｆ???????．．．将狀八＾机扪断??ｊ?３，端？?５，端接头连接???４；???用陆机引物和逆转朵酚从ＲＮＡ片段合??成ｃＤＮＡ片段??ｃＤＮＡ片段末端修仏迕接测吓接头?逆料录合成ｃＤＮＡ片段???Ｊ；?；?；???Ｍ备测序文库及＊０序??图３转录组测序技术流程图??Ｆｉｇ．３?Ｆｌｏｗ?ｃｈａｒｔ?ｏｆ?ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅ?ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ?ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ??目前，高通量测序技术有四种，分别为Ｒ〇ｃｈｅ／４５４、ＡＢＩ／Ｓｏｌｉｄ、??Ｈｅｌｉｃｏｓ／ＨｅｌｉＳｃｏｐｅ以及Ｉｌｌｕｍｉｎａ／Ｓｏｌｅｘａ测序技术。和其它３种测序技术相比，??Ｉｌｌｕｍｉｎａ测序技术具有以下４点优势：（１）能够精确的识别单核苷酸的多态性和??可变剪切位点的编码序列，对转录组信息进行全面的分析；（２）测序成本低；（３）??在单核苷酸水平下，能检测任何物种的转录活动；（４）能够分析转录本的结构和??表达水平，可以找到稀有的以及以前不曾发现的转录本，这一点很重要。??１．５研究目的及意义??在我国阿拉善地区，经济动物阿拉善双峰驼的产肉率较高，并且不同地区双??峰驼的体型及产肉量存在明显差异。同一年龄段阿拉善戈壁骟驼平均体型明显大??于沙漠骟驼，存在显著差异（ｐ＜〇．〇５）或极显著差异（ｐ＜０．０１）；同一年龄段戈壁骟驼??各项屠宰指标相较于沙漠骟驼均体现出明显优势（活重比沙漠骟驼重约
?内蒙古农业大学硕士学位论文?５??１．６技术路线??昶序饥识准备?实时災光定软ＰＣＲ??１?儿?■丨?枰品准拓??ＲＮＡ拗娶样姑??ＪＴ???文坪????的逑＿？＞：?设ｉＷＪ丨物???及??及??时泌ｍ测吖??２????ＴＴ?１?劣时炎光达ｔｆｔＰＣＲ??测序结采分析?＾??＾?，?￣付珙尥势分折￣??料泌特征分析????ＪＩ??几??ｉ；＂ｍ枰沙说驼和戈明驼产肉性能效时？分析??图４技术路线图??Ｆｉｇ．４?Ｔｈｅ?ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ?ｒｏａｄ?ｍａｐ??
本文编号：3484794
【文章来源】：内蒙古农业大学内蒙古自治区
【文章页数】：71 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图１阿拉善沙漠驼
沙漠驼股二头肌转录组学的比较研究???总ＲＮＡ??Ｉ????〇，ＢＫＡｄ＾＾?太除?ｒＲＮＡ?＜？典核?Ｓｍａｌｌ?ＲＮＡ??上ｍ５％；）衣核?及拟核生物）??－ｐ???ｖ?＼ｆ???????．．．将狀八＾机扪断??ｊ?３，端？?５，端接头连接???４；???用陆机引物和逆转朵酚从ＲＮＡ片段合??成ｃＤＮＡ片段??ｃＤＮＡ片段末端修仏迕接测吓接头?逆料录合成ｃＤＮＡ片段???Ｊ；?；?；???Ｍ备测序文库及＊０序??图３转录组测序技术流程图??Ｆｉｇ．３?Ｆｌｏｗ?ｃｈａｒｔ?ｏｆ?ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅ?ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ?ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ??目前，高通量测序技术有四种，分别为Ｒ〇ｃｈｅ／４５４、ＡＢＩ／Ｓｏｌｉｄ、??Ｈｅｌｉｃｏｓ／ＨｅｌｉＳｃｏｐｅ以及Ｉｌｌｕｍｉｎａ／Ｓｏｌｅｘａ测序技术。和其它３种测序技术相比，??Ｉｌｌｕｍｉｎａ测序技术具有以下４点优势：（１）能够精确的识别单核苷酸的多态性和??可变剪切位点的编码序列，对转录组信息进行全面的分析；（２）测序成本低；（３）??在单核苷酸水平下，能检测任何物种的转录活动；（４）能够分析转录本的结构和??表达水平，可以找到稀有的以及以前不曾发现的转录本，这一点很重要。??１．５研究目的及意义??在我国阿拉善地区，经济动物阿拉善双峰驼的产肉率较高，并且不同地区双??峰驼的体型及产肉量存在明显差异。同一年龄段阿拉善戈壁骟驼平均体型明显大??于沙漠骟驼，存在显著差异（ｐ＜〇．〇５）或极显著差异（ｐ＜０．０１）；同一年龄段戈壁骟驼??各项屠宰指标相较于沙漠骟驼均体现出明显优势（活重比沙漠骟驼重约
?内蒙古农业大学硕士学位论文?５??１．６技术路线??昶序饥识准备?实时災光定软ＰＣＲ??１?儿?■丨?枰品准拓??ＲＮＡ拗娶样姑??ＪＴ???文坪????的逑＿？＞：?设ｉＷＪ丨物???及??及??时泌ｍ测吖??２????ＴＴ?１?劣时炎光达ｔｆｔＰＣＲ??测序结采分析?＾??＾?，?￣付珙尥势分折￣??料泌特征分析????ＪＩ??几??ｉ；＂ｍ枰沙说驼和戈明驼产肉性能效时？分析??图４技术路线图??Ｆｉｇ．４?Ｔｈｅ?ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ?ｒｏａｄ?ｍａｐ??
本文编号：3484794
本文链接：https://www.wllwen.com/yixuelunwen/dongwuyixue/3484794.html
