发情周期不同阶段山羊卵巢IncRNA和mRNA的分析

发布时间：2021-11-15 07:44

　　山羊是一种重要的多用途家畜,是一种重要的经济动物,其繁殖力是山羊养殖业的重要环节之一,而繁殖主要受生殖激素调控,卵巢是主要繁殖器官并直接介导排卵及分泌性激素,对山羊的繁殖性能起着关键性作用。近几年,研究者们发现越来越多的lncRNA调控哺乳动物的繁育。作为一种具有编码蛋白质能力的RNA,mRNA在哺乳动物卵巢功能中发挥的作用也越来越受到研究者们的重视。然而很少有人研究山羊卵巢中lncRNA和mRNA对山羊繁育的影响。在本研究中,我们共采集10个山羊卵巢（黄体期卵巢和卵泡期卵巢各5个）,主要采用RNA-seq技术,对黄体期以及卵泡期山羊卵巢进行全集基因组分析,通过共定位和共表达的分析方法,预测lncRNA的靶基因,对其靶基因以及mRNA基因进行GO和KEGG等功能分析,筛选与山羊繁育能力相关的长非编码RNA和mRNA,并研究不同繁殖周期山羊卵巢的转录差异,可以为研究山羊繁育提供理论基础。（1）对采集到的安徽白山羊黄体期和卵泡期卵巢进行RNA-seq。在本次测序中,我们共建立10个文库,黄体期卵巢（LO）和卵泡期卵巢（FO）的文库分别得到106510454、108716574、977751... 

【文章来源】：阜阳师范大学安徽省

【文章页数】：60 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

LncRNA筛选流程图

其中lncRNA 包括 3753 个 novel lncRNA（lincRNA 占 74.0%，antisense-lncRNA 占 26.0%（图3.1c））和 1173 个 Annotated lncRNA（图 3.1b）。研究结果表明，卵泡期和黄体期卵巢表达水平几乎一致，lncRNA 和 TUCP 的表达水平比 mRNA 低（图 3.1d/e）。

图 3.2 黄体期和卵泡期山羊卵巢中 lncRNA、TUCP、mRNA 的比较Figure 3.2 Comparison of lncRNA, TUCP, and mRNA in the goat ovary of the luteal and follicular phase3.2 不同发情时期山羊卵巢中转录本的总体差异表达情况在本研究中，从山羊卵巢中一共鉴定出 4926 个 lncRNA、1454 个 TUCP、43766

【参考文献】：
期刊论文
[1]长链非编码RNA与缺氧缺血脑损伤[J]. 赵凤艳,屈艺.  中国当代儿科杂志. 2016(11)
[2]应用Solexa测序技术挖掘山羊卵巢组织microRNA[J]. 张晓东,凌英会,张运海,李运生,刘亚,曹鸿国,张子军,殷宗俊,丁建平,章孝荣.  中国农业科学. 2013(01)



本文编号：3496345