利用微卫星和SNP标记对西门塔尔牛进行亲子推断的研究
发布时间:2021-11-24 13:44
系谱信息在牛遗传育种中起到重要作用,可用于QTL定位、全基因组选择及基于BLUP模型的种公牛遗传评定等研究。本研究的实验群体为来自内蒙古乌拉盖地区的西门塔尔牛资源群体,由于该资源群体以放牧形式为主、自然交配和人工授精相结合的配种方式,加之管理方式粗放,系谱记录缺失和错误十分严重。错误的系谱会降低遗传评定准确性,降低遗传进展,因此进行西门塔尔牛亲子鉴定是亟待解决的问题。本研究通过检测西门塔尔牛实验群体中微卫星和SNP两种标记的遗传多态性,旨在优化西门塔尔牛基于微卫星标记的亲子鉴定体系,建立基于SNP标记的西门塔尔牛亲子鉴定体系,并利用两套标记对本群体牛进行亲子鉴定,纠正潜在的错误系谱,建立完整、准确的系谱体系,提高育种值估计的准确性,进而加快西门塔尔牛的遗传进展。结果如下:1.确定了8个微卫星标记作为西门塔尔牛微卫星亲子鉴定体系的标记组合:BM2113、TGLA122、ETH225、INRA023、TGLA53、CSSM66、HAUT27、INRA037及2个候选标记:BM1824和INRA032。该标记组合的等位基因数、期望杂合度、多态信息含量的平均值分别为:11.4、0.828、0....
【文章来源】:中国农业科学院北京市
【文章页数】:60 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
遗传物质传递图
SNP芯片分型流程
基因组DNA的琼脂糖凝胶电泳检测结果
【参考文献】:
期刊论文
[1]利用SNP标记进行北京地区中国荷斯坦牛亲子推断的研究[J]. 郭刚,周磊,刘林,李东,张胜利,刘剑锋,丁向东,张毅,王雅春,张勤,张沅. 畜牧兽医学报. 2012(01)
[2]亲权鉴定方法概述[J]. 徐卫华,符生苗,赵英. 海南医学. 2011(23)
[3]内蒙古地区西门塔尔牛亲子鉴定微卫星标记筛选[J]. 宋玲,贺建宁,孙东晓,李俊雅,张沅. 中国畜牧杂志. 2011(13)
[4]应用微卫星DNA标记分析荷斯坦母牛系谱可靠性及影响因素[J]. 初芹,张毅,孙东晓,俞英,王雅春,张沅. 畜牧兽医学报. 2011(02)
[5]利用微卫星和SNP标记信息进行奶牛亲子鉴定的模拟研究[J]. 周磊,初芹,刘林,刘剑锋,王雅春,张沅. 畜牧兽医学报. 2011(02)
[6]奶牛亲子鉴定技术研究进展[J]. 焦利红,田雨泽,贾福德,朱芳贤,马毅. 中国奶牛. 2009(05)
[7]羊驼种群内亲缘关系的研究[J]. 高莉,赵英虎,董常生. 激光生物学报. 2007(06)
[8]微卫星标记的研究与应用[J]. 荀来武,王桂瑛,何华川,刘燕,杨晓花,张琪艳. 草食家畜. 2007(03)
[9]应用血型分析技术对奶牛亲子关系正确率的调查初报[J]. 汪湛,田雨泽,刘和凤. 中国畜牧兽医. 2005(03)
[10]AFLP分子标记技术的发展及其在海洋生物中的应用[J]. 王伟继,岳志芹,孔杰,王清印. 海洋水产研究. 2005(01)
博士论文
[1]中国牦牛分子系统发育的初步研究[D]. 李齐发.南京农业大学 2004
硕士论文
[1]基于高密度SNP芯片技术对西门塔尔牛部分肉质性状的全基因组关联分析[D]. 张立敏.中国农业科学院 2012
[2]应用微卫星确定中国西门塔尔牛亲缘关系[D]. 贺建宁.中国农业科学院 2010
[3]应用微卫星DNA对Holstein奶牛进行亲子鉴定[D]. 鲁玉霞.山东师范大学 2008
本文编号:3516097
【文章来源】:中国农业科学院北京市
【文章页数】:60 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
遗传物质传递图
SNP芯片分型流程
基因组DNA的琼脂糖凝胶电泳检测结果
【参考文献】:
期刊论文
[1]利用SNP标记进行北京地区中国荷斯坦牛亲子推断的研究[J]. 郭刚,周磊,刘林,李东,张胜利,刘剑锋,丁向东,张毅,王雅春,张勤,张沅. 畜牧兽医学报. 2012(01)
[2]亲权鉴定方法概述[J]. 徐卫华,符生苗,赵英. 海南医学. 2011(23)
[3]内蒙古地区西门塔尔牛亲子鉴定微卫星标记筛选[J]. 宋玲,贺建宁,孙东晓,李俊雅,张沅. 中国畜牧杂志. 2011(13)
[4]应用微卫星DNA标记分析荷斯坦母牛系谱可靠性及影响因素[J]. 初芹,张毅,孙东晓,俞英,王雅春,张沅. 畜牧兽医学报. 2011(02)
[5]利用微卫星和SNP标记信息进行奶牛亲子鉴定的模拟研究[J]. 周磊,初芹,刘林,刘剑锋,王雅春,张沅. 畜牧兽医学报. 2011(02)
[6]奶牛亲子鉴定技术研究进展[J]. 焦利红,田雨泽,贾福德,朱芳贤,马毅. 中国奶牛. 2009(05)
[7]羊驼种群内亲缘关系的研究[J]. 高莉,赵英虎,董常生. 激光生物学报. 2007(06)
[8]微卫星标记的研究与应用[J]. 荀来武,王桂瑛,何华川,刘燕,杨晓花,张琪艳. 草食家畜. 2007(03)
[9]应用血型分析技术对奶牛亲子关系正确率的调查初报[J]. 汪湛,田雨泽,刘和凤. 中国畜牧兽医. 2005(03)
[10]AFLP分子标记技术的发展及其在海洋生物中的应用[J]. 王伟继,岳志芹,孔杰,王清印. 海洋水产研究. 2005(01)
博士论文
[1]中国牦牛分子系统发育的初步研究[D]. 李齐发.南京农业大学 2004
硕士论文
[1]基于高密度SNP芯片技术对西门塔尔牛部分肉质性状的全基因组关联分析[D]. 张立敏.中国农业科学院 2012
[2]应用微卫星确定中国西门塔尔牛亲缘关系[D]. 贺建宁.中国农业科学院 2010
[3]应用微卫星DNA对Holstein奶牛进行亲子鉴定[D]. 鲁玉霞.山东师范大学 2008
本文编号:3516097
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