绵羊UCP2和UCP3基因的克
发布时间:2021-12-11 05:57
UCP2和UCP3属于线粒体内膜蛋白,在线粒体中通过解偶联作用抑制ATP和ROS的形成,不仅对生物机体具有保护作用,而且可能参与能量代谢。绵羊是重要的经济动物之一。通过研究UCP2和UCP3基因的结构和遗传表达特性,有利于深入、全面地了解机体内复杂的代谢机制。目前关于绵羊UCP2和UCP3基因的核酸序列、分子结构、遗传变异和表达的研究极少。本研究在]DNA、mRNA和蛋白质3个水平上研究绵羊UCP2和UCP3基因的序列结构、遗传变异以及转录和翻译水平上的表达。采用RT-PCR、RACE和序列测定技术克隆绵羊UCP2和UCP3基因的全长cDNA序列。通过电子克隆获得两基因的基因组序列。以UCP1基因为参照,用real-time PCR技术检测南非肉用美利奴和山西肉用绵羊UCP2和UCP3 mRNA在冬春和夏秋两个不同时段的13种组织中的差异性表达。用免疫组化技术研究两个基因的蛋白产物在6种脂肪组织中的表达。应用多种软件对UCP2和UCP3基因的核苷酸和氨基酸序列进行生物信息学分析。主要结果如下:(1)采用RACE方法获得绵羊UCP2基因cDNA序列全长序列1641 bp,其中ORF为92...
【文章来源】:山西农业大学山西省
【文章页数】:168 页
【学位级别】:博士
【文章目录】:
摘要
中英文缩略词对照表
第一章 文献综述
1 生物能量学
1.1 线粒体的氧化磷酸化—ATP合成
1.2 代谢率
1.3 体内能量平衡
1.4 体温调节
2 解偶联蛋白家族基因(UCPs)
2.1 UCPs的类型及其分子特性
2.2 基因定位及其表达产物的分布
2.3 半衰期
2.4 UCP1-UCP3的进化分析
3 UCP2和UCP3分子调节机制的研究进展
3.1 质子漏和解偶联作用
3.2 分子调控机制的研究进展
3.3 生物学功能
3.4 影响UCP2和UCP3基因表达的因素
3.5 UCP2和UCP3基因的多态性研究
4 本研究的目的与意义
参考文献
第二章 绵羊UCP2和UCP3基因序列的克隆与分析
1 材料与方法
1.1 试验材料
1.2 试验方法
1.3 序列分析
2 结果与分析
2.1 绵羊UCP2基因部分cDNA序列的克隆与测序
2.2 绵羊UCP2和UCP3基因RACE扩增结果
2.3 绵羊UCP2和UCP3基因序列
2.4 不同物种间UCP2和UCP3基因的cDNA序列变异
2.5 不同物种UCP2和UCP3氨基酸多样性
3 讨论
3.1 绵羊UCP2和UCP3基因调控区预测位点、序列的分析
3.2 调控序列对基因表达的影响
3.3 变异位点及其效应分析
3.4 密码子偏性、同义替换和非同义替换
参考文献
第三章 UCP2和UCP3蛋白结构、功能预测与分子进化分析
1 材料与方法
1.1 序列的获取
1.2 分析方法
2 结果与分析
2.1 UCP2和UCP3蛋白质的基本性质
2.2 蛋白信号肽和二硫键预测
2.3 糖基化位点
2.4 磷酸化位点
2.5 蛋白质二级结构预测
2.6 蛋白质三级结构
2.7 相似性及分子系统进化树
3 讨论
3.1 蛋白质结构预测与其功能的关系
3.2 不同种群遗传分化和氨基酸序列相似性分析
参考文献
第四章 绵羊UCP2和UCP3 MRNA的时空差异性表达研究
1 材料与方法
1.1 试验材料
1.2 试验方法与操作技术
2 结果与分析
2.1 总RNA的提取
2.2 标准曲线的建立与分析
2.3 部分样品扩增动力学曲线
2.4 样品扩增熔解曲线
2.5 UCP1 mRNA的表达量及影响因素
2.6 UCP2 mRNA的表达量及影响因素
2.7 UCP3 mRNA的表达量及影响因素
3 讨论
3.1 关于UCP1-UCP3 mRNA的空间性表达
3.2 关于UCP1-UCP3 mRNA的季节性表达
参考文献
第五章 绵羊UCP2和UCP3蛋白的免疫组化分析
1 材料与方法
1.1 试验材料
1.2 试验方法与操作技术
2 结果与分析
2.1 免疫组化分析
2.2 UCP2的表达量及影响因素
2.3 UCP3的表达量及影响因素
3 讨论
参考文献
全文结论
特色与创新
附录一 绵羊UCP2和UCP3基因全长CDNA序列和对应氨基酸序列
附录二 绵羊UCP2和UCP3基因的DNA序列
附录三 绵羊UCP2和UCP3基因转录起始位点和启动子预测结果
附录四 绵羊UCP2和UCP3基因转录因子结合位点预测结果
附录五 蛋白质结构预测对照软件结果
附录六 蛋白质结构预测对照软件结果
ABSTRACT
致谢
【参考文献】:
期刊论文
[1]糖皮质激素受体的生物学功能及其在骨代谢中作用的研究进展[J]. 郏舜杰,洪盾,陈海啸. 中国细胞生物学学报. 2012(12)
[2]基于质谱的蛋白质O-糖基化分析[J]. 王胜,邹霞,张延. 化学进展. 2010(12)
[3]猪UCP5基因克隆表达特性及与屠体性状的关联分析[J]. 李红霞,赵兴波,徐宁迎,姜运良,曹梦,刘玉方,方迟,李宁. 生物化学与生物物理进展. 2010(12)
[4]植物CBF1转录因子的生物信息学分析[J]. 蒋瑶,陈其兵. 林业科学. 2010(06)
[5]糖基化改变与肿瘤的基础研究[J]. 范振符,陈智周,范飞舟. 标记免疫分析与临床. 2010(02)
[6]转录因子Sp1与肿瘤关系研究的新进展[J]. 白雪,邓红. 浙江大学学报(医学版). 2010(02)
[7]鳜UCP1,2基因结构、序列分析及组织表达[J]. 王琳,梁旭方,李光照,刘秀霞,林群,白俊杰. 水产学报. 2009(06)
[8]光周期和高脂食物对布氏田鼠能量代谢和产热的影响[J]. 赵志军,陈竞峰,王德华. 动物学报. 2008(04)
[9]PPARδ在脂质代谢中的作用[J]. 王静,江淼,夏军辉,李霞,易光辉,阮长耿. 生命的化学. 2008(02)
[10]基因组CpG岛甲基化检测技术研究进展[J]. 张松法,叶枫,陈怀增,谢幸. 国际遗传学杂志. 2006(03)
本文编号:3534133
【文章来源】:山西农业大学山西省
【文章页数】:168 页
【学位级别】:博士
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第一章 文献综述
1 生物能量学
1.1 线粒体的氧化磷酸化—ATP合成
1.2 代谢率
1.3 体内能量平衡
1.4 体温调节
2 解偶联蛋白家族基因(UCPs)
2.1 UCPs的类型及其分子特性
2.2 基因定位及其表达产物的分布
2.3 半衰期
2.4 UCP1-UCP3的进化分析
3 UCP2和UCP3分子调节机制的研究进展
3.1 质子漏和解偶联作用
3.2 分子调控机制的研究进展
3.3 生物学功能
3.4 影响UCP2和UCP3基因表达的因素
3.5 UCP2和UCP3基因的多态性研究
4 本研究的目的与意义
参考文献
第二章 绵羊UCP2和UCP3基因序列的克隆与分析
1 材料与方法
1.1 试验材料
1.2 试验方法
1.3 序列分析
2 结果与分析
2.1 绵羊UCP2基因部分cDNA序列的克隆与测序
2.2 绵羊UCP2和UCP3基因RACE扩增结果
2.3 绵羊UCP2和UCP3基因序列
2.4 不同物种间UCP2和UCP3基因的cDNA序列变异
2.5 不同物种UCP2和UCP3氨基酸多样性
3 讨论
3.1 绵羊UCP2和UCP3基因调控区预测位点、序列的分析
3.2 调控序列对基因表达的影响
3.3 变异位点及其效应分析
3.4 密码子偏性、同义替换和非同义替换
参考文献
第三章 UCP2和UCP3蛋白结构、功能预测与分子进化分析
1 材料与方法
1.1 序列的获取
1.2 分析方法
2 结果与分析
2.1 UCP2和UCP3蛋白质的基本性质
2.2 蛋白信号肽和二硫键预测
2.3 糖基化位点
2.4 磷酸化位点
2.5 蛋白质二级结构预测
2.6 蛋白质三级结构
2.7 相似性及分子系统进化树
3 讨论
3.1 蛋白质结构预测与其功能的关系
3.2 不同种群遗传分化和氨基酸序列相似性分析
参考文献
第四章 绵羊UCP2和UCP3 MRNA的时空差异性表达研究
1 材料与方法
1.1 试验材料
1.2 试验方法与操作技术
2 结果与分析
2.1 总RNA的提取
2.2 标准曲线的建立与分析
2.3 部分样品扩增动力学曲线
2.4 样品扩增熔解曲线
2.5 UCP1 mRNA的表达量及影响因素
2.6 UCP2 mRNA的表达量及影响因素
2.7 UCP3 mRNA的表达量及影响因素
3 讨论
3.1 关于UCP1-UCP3 mRNA的空间性表达
3.2 关于UCP1-UCP3 mRNA的季节性表达
参考文献
第五章 绵羊UCP2和UCP3蛋白的免疫组化分析
1 材料与方法
1.1 试验材料
1.2 试验方法与操作技术
2 结果与分析
2.1 免疫组化分析
2.2 UCP2的表达量及影响因素
2.3 UCP3的表达量及影响因素
3 讨论
参考文献
全文结论
特色与创新
附录一 绵羊UCP2和UCP3基因全长CDNA序列和对应氨基酸序列
附录二 绵羊UCP2和UCP3基因的DNA序列
附录三 绵羊UCP2和UCP3基因转录起始位点和启动子预测结果
附录四 绵羊UCP2和UCP3基因转录因子结合位点预测结果
附录五 蛋白质结构预测对照软件结果
附录六 蛋白质结构预测对照软件结果
ABSTRACT
致谢
【参考文献】:
期刊论文
[1]糖皮质激素受体的生物学功能及其在骨代谢中作用的研究进展[J]. 郏舜杰,洪盾,陈海啸. 中国细胞生物学学报. 2012(12)
[2]基于质谱的蛋白质O-糖基化分析[J]. 王胜,邹霞,张延. 化学进展. 2010(12)
[3]猪UCP5基因克隆表达特性及与屠体性状的关联分析[J]. 李红霞,赵兴波,徐宁迎,姜运良,曹梦,刘玉方,方迟,李宁. 生物化学与生物物理进展. 2010(12)
[4]植物CBF1转录因子的生物信息学分析[J]. 蒋瑶,陈其兵. 林业科学. 2010(06)
[5]糖基化改变与肿瘤的基础研究[J]. 范振符,陈智周,范飞舟. 标记免疫分析与临床. 2010(02)
[6]转录因子Sp1与肿瘤关系研究的新进展[J]. 白雪,邓红. 浙江大学学报(医学版). 2010(02)
[7]鳜UCP1,2基因结构、序列分析及组织表达[J]. 王琳,梁旭方,李光照,刘秀霞,林群,白俊杰. 水产学报. 2009(06)
[8]光周期和高脂食物对布氏田鼠能量代谢和产热的影响[J]. 赵志军,陈竞峰,王德华. 动物学报. 2008(04)
[9]PPARδ在脂质代谢中的作用[J]. 王静,江淼,夏军辉,李霞,易光辉,阮长耿. 生命的化学. 2008(02)
[10]基因组CpG岛甲基化检测技术研究进展[J]. 张松法,叶枫,陈怀增,谢幸. 国际遗传学杂志. 2006(03)
本文编号:3534133
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