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新城疫病毒感染鸡巨噬细胞miRNA表达谱分析及gga-miRNA155的功能

发布时间:2022-01-12 12:28
  新城疫是由新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV)强毒株引起的一种禽类急性高度接触性病毒性传染病,可感染大部分的非免疫鸟类,并可跨种传播哺乳动物。我国当前的优势型新城疫毒株为基因VII型强毒,其高致死率对全球养禽业的经济造成了严重危害。而现阶段对新城疫的防控措施主要依赖疫苗接种,在一定程度上控制了禽类感染新城疫病毒后的临床症状以及死亡现象,却无法完全控制病毒在禽类体内的复制以及机体向体外排毒的现象,因此单纯的依赖疫苗免疫存在着一定的局限性。microRNA(miRNA)是一类长度为1825 nt的可以由动物、植物、病毒等多种生物体编码合成的非编码小RNA,参与组织发育、细胞分化、增殖凋亡,以及在调控病毒的基因表达、干扰病毒复制、组装、释放等环节都发挥着重要的作用。本文通过高通量技术分析了鸡巨噬细胞感染新城疫强、弱毒后的miRNA表达谱,对筛选后的众多差异miRNA的表达量进行了荧光定量鉴定,并利用软件对差异miRNA进行了功能性分析,为今后研究新城疫病毒与miRNA之间的相互作用奠定了一定的基础。根据相关的文献和实验结果以及这次的高通量... 

【文章来源】:吉林大学吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校

【文章页数】:103 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

新城疫病毒感染鸡巨噬细胞miRNA表达谱分析及gga-miRNA155的功能


新城疫病毒复制过程

新城疫病毒感染鸡巨噬细胞miRNA表达谱分析及gga-miRNA155的功能


miRNA与mirtrons的pri-miRNA的特征

序列,作用方式,发夹结构,嘧啶


识别和切割(5′GURAGU 剪切位点,3′多聚嘧啶序列以及 CAG 剪切位点(有时是 UAG))。pri-mirtron 被剪切后悔形成 pre-miRNA 样发夹结构然后被 Dicer 识别并剪切。(Top) A typical pri-miRNA transcript contains a “lower stem,” which mediatesrecognition and cleavage by Drosha (blue arrows). The resulting pre-miRNA hairpinwith ~2nt3′overhangsis thencleavedbyDicer(greenarrows)to yielda ~22 nt duplex.(Bottom) A typical pri-mirtron locus lacks the “lower stem”but is insteadconstrained by primary nucleotide motifs that mediate their recognition and cleavageby the splicing machinery (i.e., 5′ GURAGU splice sites, 3′ polypyrimidine tracts, andCAG [or much less frequently UAG] splice sites). Once the spliced pri-mirtron isdebranched, it can adopt a pre-miRNA-like hairpin structure and be cleaved by Dicer.


本文编号:3584774

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