三穗麻鸭PMEL-17、DRD4和5-HT1A基因表达及生物信息学研究
发布时间:2022-10-04 22:01
为研究三穗鸭100 kDa型跨膜糖蛋白受体基因(PMEL-17)、多巴胺受体基因(DRD4)和5-羟色胺1A型受体基因(5-HT1A)在三穗鸭各个组织中的表达情况,进一步探讨三穗鸭啄羽行为的发生机制。本研究应用分子遗传学手段并应用SPSS和Excel等生物信息学分析软件对三穗鸭PMEL-17、DRD4和5-HT1A基因在三穗鸭心、肝、脾、肺、肾、肠、脑、胸、腿、眼、肌胃和腺胃12个组织的表达情况进行了生物学分析。选取60只三穗鸭进行啄羽行为和正常行为观察,屠宰后选取3只(啄羽行为1只,正常行为2只)三穗鸭,并采集其各个组织,利用Trizol法对以上组织进行RNA提取,构建三穗鸭的cDNA文库,利用荧光定量PCR对上述三个基因在相关组织中的表达量进行检测。最后,应用RT-PCR并结合载体构建的方法对三穗鸭PMEL-17基因的完整编码区(CDS)进行克隆,对其结果进行生物信息学分析。得出以下结果:1.5-HT1A受体基因在啄羽行为组脑组织中表达量最高且表达差异极显著显著(P<0.01),其次是在肾组织中,其表达结果差异显著(P<0.05)。剩余的10个组织,该基因的表达量相近并且5-HT1...
【文章页数】:59 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
Abstract
第一章 文献综述
1 前言
2 中国养鸭现状
3 三穗鸭简介
4 DRD4、5-HT1A和PMEL-17受体基因研究进展
4.1 DRD4基因研究进展
4.2 5-HT1A基因研究进展
4.3 PMEL-17基因研究进展
5 生物信息学简介
6 生物信息数据库
7 生物信息学研究内容
8 生物信息学应用
9 本研究的目的与意义
第二章 三穗鸭DRD4、5-HT1A和PMEL-17基因表达分析
1 实验材料与方法
1.1 实验动物及饲养
1.2 样品采集
1.3 主要仪器
1.4 主要试剂
2 试验方法
2.1 总RNA提取
2.2 RT-PCR合成cDNA第一链
2.3 PCR引物设计和扩增条件优化
3 结果和分析
3.1 RNA的纯度与完整性
3.2 荧光定量PCR的灵敏性和可靠性
3.3 溶解曲线与假阳性
3.4 基因表达差异分析
4 讨论
4.1 关于5-HT1A基因的组织表达
4.2 关于DRD4基因的组织表达
4.3 关于PMEL-17基因的组织表达
第三章 三穗鸭PMEL-17基因的生物信息学分析
1.实验材料
1.1 实验动物样本
1.2 样品采集
1.3 主要试剂
2 试验方法
2.1 总RNA提取
2.2 RT-PCR合成cDNA第一链
2.3 实验仪器
2.4 PCR引物设计和扩增条件优化
2.5 PCR产物回收
2.6 基因克隆
2.7 基因克隆筛选
2.8 基因克隆测序
2.9 生物信息学分析
3.结果与分析
3.1 PCR扩增结果
3.2 PMEL-17基因生物信息学分析
4.讨论
第四章 结论与展望
1.结论
2.展望
致谢
参考文献
附录
附录Ⅰ 作者简介
一、基本情况
二、参与发表论文
三、参加的科研课题
附录Ⅱ 论文第二、三章使用主要仪器
附录Ⅲ 英文缩略表
附录Ⅳ 图样
实验图片
【参考文献】:
期刊论文
[1]论我国养鸭业的发展现状及问题分析[J]. 吴光瑞,黄文炳. 农技服务. 2017(23)
[2]基于RNA-Seq筛选鸭肠炎病毒感染鸭脾差异表达免疫相关基因[J]. 吴良涛,郑敏,华敏,万润,程振涛,周碧君,文明. 畜牧兽医学报. 2017(02)
[3]生物信息学数据库在医学研究中的应用[J]. 刘银凤,张雷. 中国病原生物学杂志. 2014(10)
[4]牛Phlda2基因的组织表达及生物信息学分析[J]. 赵姝君,王敬姣,王梦楠,吴茜红,李冬杰,李世杰. 基因组学与应用生物学. 2014(03)
[5]Trizol法大鼠心肌总RNA提取方法探讨[J]. 戴先成,柴智锋,徐永城,王山青. 刑事技术. 2014(03)
[6]三穗鸭品种特性概述及产业发展现状与对策[J]. 顾永江,陶宇航,何明才,顾永芬. 上海畜牧兽医通讯. 2013(06)
[7]三穗鸭MSTN基因多态性与屠宰性状相关性研究[J]. 易恒洁,李辉,杨胜林,赵忠海,彭邦星. 中国家禽. 2013(23)
[8]五羟色胺和多巴胺与攻击行为的关联研究进展[J]. 段云峰,吴晓丽,王涛,金锋. 生命科学. 2013(10)
[9]三穗鸭体型外貌观察与生长发育分析[J]. 戴焰,杨海兵,易恒洁,李辉,张依裕,杨胜林,蒲德坤,吴宗豪,欧秀勇. 家畜生态学报. 2013(06)
[10]三穗鸭挥发性风味成分研究[J]. 苏伟,武昌会,母应春,陈旭,朱秋劲. 食品研究与开发. 2012(10)
硕士论文
[1]光照对蛋鸭昼夜行为节律的影响及遗传效应分析[D]. 陆曼.贵州大学 2017
[2]三穗麻鸭行为及DRD4、5-HT1A基因多态性研究[D]. 李潇蒙.贵州大学 2016
本文编号:3685838
【文章页数】:59 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
Abstract
第一章 文献综述
1 前言
2 中国养鸭现状
3 三穗鸭简介
4 DRD4、5-HT1A和PMEL-17受体基因研究进展
4.1 DRD4基因研究进展
4.2 5-HT1A基因研究进展
4.3 PMEL-17基因研究进展
5 生物信息学简介
6 生物信息数据库
7 生物信息学研究内容
8 生物信息学应用
9 本研究的目的与意义
第二章 三穗鸭DRD4、5-HT1A和PMEL-17基因表达分析
1 实验材料与方法
1.1 实验动物及饲养
1.2 样品采集
1.3 主要仪器
1.4 主要试剂
2 试验方法
2.1 总RNA提取
2.2 RT-PCR合成cDNA第一链
2.3 PCR引物设计和扩增条件优化
3 结果和分析
3.1 RNA的纯度与完整性
3.2 荧光定量PCR的灵敏性和可靠性
3.3 溶解曲线与假阳性
3.4 基因表达差异分析
4 讨论
4.1 关于5-HT1A基因的组织表达
4.2 关于DRD4基因的组织表达
4.3 关于PMEL-17基因的组织表达
第三章 三穗鸭PMEL-17基因的生物信息学分析
1.实验材料
1.1 实验动物样本
1.2 样品采集
1.3 主要试剂
2 试验方法
2.1 总RNA提取
2.2 RT-PCR合成cDNA第一链
2.3 实验仪器
2.4 PCR引物设计和扩增条件优化
2.5 PCR产物回收
2.6 基因克隆
2.7 基因克隆筛选
2.8 基因克隆测序
2.9 生物信息学分析
3.结果与分析
3.1 PCR扩增结果
3.2 PMEL-17基因生物信息学分析
4.讨论
第四章 结论与展望
1.结论
2.展望
致谢
参考文献
附录
附录Ⅰ 作者简介
一、基本情况
二、参与发表论文
三、参加的科研课题
附录Ⅱ 论文第二、三章使用主要仪器
附录Ⅲ 英文缩略表
附录Ⅳ 图样
实验图片
【参考文献】:
期刊论文
[1]论我国养鸭业的发展现状及问题分析[J]. 吴光瑞,黄文炳. 农技服务. 2017(23)
[2]基于RNA-Seq筛选鸭肠炎病毒感染鸭脾差异表达免疫相关基因[J]. 吴良涛,郑敏,华敏,万润,程振涛,周碧君,文明. 畜牧兽医学报. 2017(02)
[3]生物信息学数据库在医学研究中的应用[J]. 刘银凤,张雷. 中国病原生物学杂志. 2014(10)
[4]牛Phlda2基因的组织表达及生物信息学分析[J]. 赵姝君,王敬姣,王梦楠,吴茜红,李冬杰,李世杰. 基因组学与应用生物学. 2014(03)
[5]Trizol法大鼠心肌总RNA提取方法探讨[J]. 戴先成,柴智锋,徐永城,王山青. 刑事技术. 2014(03)
[6]三穗鸭品种特性概述及产业发展现状与对策[J]. 顾永江,陶宇航,何明才,顾永芬. 上海畜牧兽医通讯. 2013(06)
[7]三穗鸭MSTN基因多态性与屠宰性状相关性研究[J]. 易恒洁,李辉,杨胜林,赵忠海,彭邦星. 中国家禽. 2013(23)
[8]五羟色胺和多巴胺与攻击行为的关联研究进展[J]. 段云峰,吴晓丽,王涛,金锋. 生命科学. 2013(10)
[9]三穗鸭体型外貌观察与生长发育分析[J]. 戴焰,杨海兵,易恒洁,李辉,张依裕,杨胜林,蒲德坤,吴宗豪,欧秀勇. 家畜生态学报. 2013(06)
[10]三穗鸭挥发性风味成分研究[J]. 苏伟,武昌会,母应春,陈旭,朱秋劲. 食品研究与开发. 2012(10)
硕士论文
[1]光照对蛋鸭昼夜行为节律的影响及遗传效应分析[D]. 陆曼.贵州大学 2017
[2]三穗麻鸭行为及DRD4、5-HT1A基因多态性研究[D]. 李潇蒙.贵州大学 2016
本文编号:3685838
本文链接:https://www.wllwen.com/yixuelunwen/dongwuyixue/3685838.html