三株传染性喉气管炎病毒全基因组序列测定及分析

发布时间：2022-10-06 17:56

　　鸡传染性喉气管炎（ILT）是由鸡传染性喉气管炎病毒（Infectious laryngotracheitis virus，ILTV）引起的鸡的急性上呼吸道传染病，感染鸡的死亡和产蛋下降可造成严重的经济损失。ILT呈世界范围内流行，我国于上世纪50年代发现本病，现在许多省份流行，是危害养禽业的重要疫病之一。 近年来，关于ILTV的流行病学研究表明，ILTV疫苗株免疫鸡群后会引起ILT的暴发，这些研究都是基于ILTV的ICP4、TK及其部分糖蛋白基因。随着高通量测序技术的发展，自2011年以来，国外已陆续发表18株ILTV病毒全基因组序列，而国内ILTV毒株的遗传背景模糊，尚未有ILTV全基因组序列的报道。 2009年，本实验室于中国江苏某养殖场分离出一株ILTV，命名为LJS09。为进一步了解我国ILTV毒株的分子遗传特性及我国ILTV强毒株、流行毒株和疫苗株的分子差异，本研究选择我国强毒株WG、流行毒株LJS09和疫苗株K317，并对其全基因组序列进行测定分析。 本实验应用91对引物对三株ILTV基因组进行了分段扩增及核酸序列的测定，并采用单引物扩增与常规PCR结合的... 

【文章页数】：65 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
Abstract
第一章 引言
    1.1 传染性喉气管炎概述
    1.2 传染性喉气管炎病毒的生物学特性
        1.2.1 病毒和毒株分类
        1.2.2 病毒形态学
    1.3 病毒复制
    1.4 宿主范围
    1.5 流行病学
    1.6 ILTV 的发病机理
    1.7 ILTV 基因组学研究
    1.8 ILTV 主要结构蛋白的研究
    1.9 研究目的和意义
第二章 三株传染性喉气管炎病毒基因组序列测定与分析
    2.1 材料
        2.1.1 毒株，菌种，质粒，鸡胚
        2.1.2 试剂
        2.1.3 实验仪器
    2.2 方法
        2.2.1 病毒的分离与增殖
        2.2.2 分离病毒的鉴定
        2.2.3 引物设计
        2.2.4 基因组的分段扩增
        2.2.5 单引物扩增确定 TRS区与 UL区接头
        2.2.6 IRS和 TRS重复区的确定
        2.2.7 PCR 产物鉴定及回收纯化
        2.2.8 PCR 产物连接与转化
        2.2.9 重组质粒的提取、鉴定及序列测定
        2.2.10 全基因组序列拼接、分析及比较
    2.3 结果
        2.3.1 分离病毒增殖
        2.3.2 病毒基因组 DNA 鉴定
        2.3.3 病毒电镜观察
        2.3.4 间接免疫荧光检测
        2.3.5 TRS/UL区接头的确定
        2.3.6 重复区序列的确定
        2.3.7 基因组序列分段扩增结果
        2.3.8 三株 ILTV 基因组结构组成
        2.3.9 遗传进化分析
        2.3.10 开放阅读框分析
        2.3.11 单核苷酸多态性（SNP）分析
        2.3.12 与细胞嗜性相关糖蛋白氨基酸突变分析
        2.3.13 非编码区分析
    2.4 讨论
第三章 全文结论
参考文献
附录
致谢
作者简介


【参考文献】：
期刊论文
[1]鸡传染性喉气管炎研究进展[J]. 王云峰,石星明,王玫,童光志,杨桂花,孙鹏.  兽医导刊. 2008(11)
[2]鸡传染性喉气管炎病毒（ILTV）王岗株糖蛋白gB基因序列比较分析[J]. 张绍杰,孟松树,仇华吉,王柳,倪键强,何召庆,王玫,童光志.  中国兽医学报. 2000(06)



本文编号：3687117