基于代谢组学的水牛早期胚胎发育潜能预测模型建立的初步研究
发布时间:2023-01-03 09:58
胚胎代谢组学的变化动态地反映了胚胎发育状态及其对内外环境做出的应答,可作为胚胎发育潜能的评价标准。基于胚胎代谢组学的整体预测模式比以形态学为基础的传统评价方法对胚胎发育潜能的预测具有更好的一致性和预见性。本研究通过建立单胚胎培养体系,借助代谢组学的理论和方法,初步建立了早期胚胎发育潜能的预测模型。本研究分为三个部分,简述如下: 研究一,通过改良当前水牛胚胎体外培养体系,初步建立了培养效果较好的单胚胎培养系统。本实验中,将水牛胚胎的体外培养分为两步。第一步是水牛卵子进行体外受精后,将假定受精卵移入提前培养好的单层细胞中,第二步将成功发育至桑葚胚的胚胎移入无血清微滴中进行单胚胎培养。实验结果显示,两步法培养水牛单胚胎,相比较于传统方法培养水牛胚胎,培养效率(指桑葚胚发育至囊胚效率)较低(51.2%V.S40.4%,),但优于一些文献报道中的无血清单胚胎培养实验的囊胚发育率。两步法无血清的单胚胎培养平台的建立,为后续代谢组学研究奠定了基础。 研究二,探讨了两步法培养水牛胚胎过程中第二步培养时血清和BSA在水牛胚胎发育过程中拉曼指纹图谱的变化。结果显示,在血清培养系统中,不同来源的...
【文章页数】:66 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
ABSTRACT
第一部分 文献综述
1. 胚胎体外培养系统
1.1 植入前胚胎培养液
1.1.1 含血清的培养系统
1.1.2 无血清培养系统
1.2 植入前胚胎培养系统其他相关因素
1.2.1 培养箱气相环境
1.2.2 培养方式
2. 单胚胎培养应用于代谢研究
2.1 代谢组学
2.2 代谢组学研究应用于单胚胎研究
2.2.1 单胚胎培养
2.2.2 代谢组学应用于单胚胎研究
3. 拉曼光谱学应用于代谢组学研究
3.1 拉曼光谱
3.2 拉曼光谱在生命科学领域的研究现状
4 基于支持向量机的拉曼光谱数据分类及预测
4.1 支持向量机算法简介
4.2 SVM原理
4.3 提高SVM的性能讨论
第二部分 实验研究
第一章 实验材料及方法
1 实验材料和主要仪器
1.1 主要试剂
1.2 操作液
1.3 主要实验仪器
2 试验方法
2.1 共培养系统单层的制备
2.2 卵泡液的制备
2.3 发情牛血清的制备
2.4 卵母细胞的体外成熟(IVM)
2.5 卵母细胞的体外受精(IVF)
2.6 胚胎培养(IVC)
2.7 单胚胎培养液的收集
2.8 单胚胎培养液拉曼光谱的测量
2.9 统计分析
第二章 两步法培养水牛单胚胎
前言
实验设计与结果
分析和讨论
小结
第三章 对单胚胎培养液的拉曼光谱研究
前言
实验设计与结果
1 不同积分时间对样品拉曼光谱结果的影响
2 不同添加物对两步法胚胎培养的拉曼光谱
分析和讨论
1 不同积分时间对样品拉曼光谱结果的影响
2 血清对两步法胚胎培养的拉曼光谱的影响
小结
第四章 胚胎发育潜能的预测模型初步建立
前言
实验设计与结果
分析和讨论
1 测量数据的可视化
2 数据预处理
3 样本分类设置
4 SVM分类预测
5 SVM预测模型的优化
小结
参考文献
附录Ⅰ 重要术语中英文对照表
附录Ⅱ 拉曼特征峰物质归属表
致谢
硕士期间发表文章情况
【参考文献】:
期刊论文
[1]代谢组学:一个迅速发展的新兴学科(英文)[J]. 唐惠儒,王玉兰. 生物化学与生物物理进展. 2006(05)
本文编号:3727249
【文章页数】:66 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
ABSTRACT
第一部分 文献综述
1. 胚胎体外培养系统
1.1 植入前胚胎培养液
1.1.1 含血清的培养系统
1.1.2 无血清培养系统
1.2 植入前胚胎培养系统其他相关因素
1.2.1 培养箱气相环境
1.2.2 培养方式
2. 单胚胎培养应用于代谢研究
2.1 代谢组学
2.2 代谢组学研究应用于单胚胎研究
2.2.1 单胚胎培养
2.2.2 代谢组学应用于单胚胎研究
3. 拉曼光谱学应用于代谢组学研究
3.1 拉曼光谱
3.2 拉曼光谱在生命科学领域的研究现状
4 基于支持向量机的拉曼光谱数据分类及预测
4.1 支持向量机算法简介
4.2 SVM原理
4.3 提高SVM的性能讨论
第二部分 实验研究
第一章 实验材料及方法
1 实验材料和主要仪器
1.1 主要试剂
1.2 操作液
1.3 主要实验仪器
2 试验方法
2.1 共培养系统单层的制备
2.2 卵泡液的制备
2.3 发情牛血清的制备
2.4 卵母细胞的体外成熟(IVM)
2.5 卵母细胞的体外受精(IVF)
2.6 胚胎培养(IVC)
2.7 单胚胎培养液的收集
2.8 单胚胎培养液拉曼光谱的测量
2.9 统计分析
第二章 两步法培养水牛单胚胎
前言
实验设计与结果
分析和讨论
小结
第三章 对单胚胎培养液的拉曼光谱研究
前言
实验设计与结果
1 不同积分时间对样品拉曼光谱结果的影响
2 不同添加物对两步法胚胎培养的拉曼光谱
分析和讨论
1 不同积分时间对样品拉曼光谱结果的影响
2 血清对两步法胚胎培养的拉曼光谱的影响
小结
第四章 胚胎发育潜能的预测模型初步建立
前言
实验设计与结果
分析和讨论
1 测量数据的可视化
2 数据预处理
3 样本分类设置
4 SVM分类预测
5 SVM预测模型的优化
小结
参考文献
附录Ⅰ 重要术语中英文对照表
附录Ⅱ 拉曼特征峰物质归属表
致谢
硕士期间发表文章情况
【参考文献】:
期刊论文
[1]代谢组学:一个迅速发展的新兴学科(英文)[J]. 唐惠儒,王玉兰. 生物化学与生物物理进展. 2006(05)
本文编号:3727249
本文链接:https://www.wllwen.com/yixuelunwen/dongwuyixue/3727249.html