2018—2019年LX4型鸡传染性支气管炎病毒S1基因变异性分析

发布时间：2023-02-05 18:04

　　为了解近两年我国家禽中流行的IBV S1基因的变异情况,文章对2018—2019年鸡传染性支气管炎病毒（IBV）阳性样本进行检测,共分离到134株IBV,进一步对分离株S1基因进行克隆和测序鉴定。结果显示经过与NCBI登录的参考毒株序列比对分析发现107株分离株为LX4型,并且与LX4（AY338732）的氨基酸同源性为88.0%～95.2%,且点突变较多,糖基化位点在第54、138、247、447、454位出现变异和缺失,第533位蛋白质裂解位点也出现不同程度的变异。以上结果表明近两年我国流行的IBV S1基因已出现不同程度的变异。 

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 毒株来源和参考毒株
    1.2 主要试剂及仪器
    1.3 引物设计与合成
    1.4 病毒分离与鉴定
    1.5 S1基因扩增和遗传变异性分析
    1.6 S1基因进化树及遗传变异性分析
2 结果与分析
    2.1 鸡胚病毒分离
    2.2 S1基因PCR鉴定结果
    2.3 LX4型分离株S1基因同源性及进化树分析
    2.4 LX4型分离株S1基因氨基酸差异性分析
3 讨论
    3.1 影响IBV分离的因素
    3.2 IBV变异及其影响
4 结论



本文编号：3735435