山羊APOE基因克隆及组织细胞表达模式分析

发布时间：2023-02-06 12:51

　　旨在克隆山羊载脂蛋白E（Apolipoprotein E,APOE）基因序列并进行生物信息学分析,明确APOE基因在山羊各组织及分化前后脂肪细胞中的表达模式,利用RT-PCR及3′RACE方法克隆山羊APOE基因序列,利用实时荧光定量PCR（Real-time quantitative PCR,qPCR）方法检测该基因在山羊心、肝、脾、肺、肾、肌肉、脂肪等13个组织中的表达水平以及在皮下前体脂肪细胞成脂分化过程中的表达变化情况。结果表明,RT-PCR方法获得山羊APOE基因序列970 bp,其中ORF 951 bp,5′UTR 7 bp,3′UTR 12 bp（GenBank登录号:MN049956）;3′RACE法获得3′UTR 152 bp（登录号:MN049957）;Targetscan和Mirbase预测得知miR-22-3p可能靶标山羊APOE基因;蛋白预测显示山羊APOE编码316个氨基酸,是一个具有信号肽、无跨膜结构域的不稳定酸性蛋白;亚细胞定位结果发现APOE在细胞外、细胞质、液泡、细胞核以及内质网中均发挥生物学作用;进化树显示该基因在各物种的同源性较高,与绵羊、藏羚羊... 

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【文章目录】：
1 材料和方法
    1.1 试验材料
        1.1.1 试验样品采集
        1.1.2 试验材料
    1.2 试验方法
        1.2.1 山羊APOE基因克隆
        1.2.2 山羊APOE的生物信息学分析
        1.2.3 山羊APOE基因组织表达模式分析
        1.2.4 APOE基因在山羊皮下脂肪细胞分化过程中的表达模式
        1.2.5 数据统计分析
2 结果与分析
    2.1 山羊APOE基因克隆
    2.2 生物信息学分析
        2.2.1 基本理化性质分析
        2.2.2 蛋白结构特征互作及靶标miRNA预测
    2.3 APOE系统进化树构建
    2.4 山羊APOE基因组织表达谱构建
    2.5 山羊APOE基因细胞时序表达谱构建
3 讨论与结论



本文编号：3736032