牛病毒性腹泻病毒E2蛋白多表位疫苗筛选及生物信息学验证

发布时间：2023-02-07 12:49

　　为了筛选牛病毒性腹泻病毒(BVDV)E2蛋白的多表位亚单位疫苗,本研究选用4种B细胞预测软件(immunomedicine group、ABCpred、BepiPred、SMVTriP)和2种T细胞预测软件(NetBoLApan、NetMHCIIpan)筛选出重叠肽作为优势表位,通过柔性linker连接成多表位疫苗,使用免疫信息学方法对抗原性、过敏源、理化性质、糖基化位点、二级和三级结构进行评估。通过二硫化物工程提高疫苗稳定性。使用分子对接评估疫苗构建体与免疫受体的结合能力,最后进行silico克隆。结果表明,成功构建17 000相对分子质量的可溶性蛋白质,免疫信息学结果表明,疫苗构建体是非过敏性良好抗原,具有一个潜在的N-糖基化位点,在二级结构中α螺旋占约3.2%,β折叠占约43.2%,无规卷曲占约53.6%。三级结构Ramachandran作图发现优势区域中含有88.2%残基,进行细化后优势区域的残基增加到93.5%,3D模型表位作图也证明多表位疫苗具有良好的免疫原性,二硫化物工程确定出3对残留物可以形成二硫键,分子对接表明疫苗构建体与TLR3受体具有高亲和力,最后密码子优化和si...

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 序列来源
    1.2 E2蛋白B细胞表位预测
    1.3 E2蛋白T细胞表位预测
    1.4 优势表位序列的筛选与融合
    1.5 过敏原和抗原性预测
    1.6 理化参数的评估及糖基化位点预测
    1.7 二级结构预测
    1.8 三级结构的预测、细化及验证
    1.9 三级结构突出表位预测
    1.10 用于疫苗稳定性的二硫化物工程
    1.11 疫苗构建体与免疫受体的分子对接
    1.12 密码子优化和silico克隆
2 结果
    2.1 BVDV E2蛋白氨基酸序列
    2.2 E2蛋白B细胞表位预测
    2.3 E2蛋白T细胞表位预测
    2.4 E2蛋白优势表位筛选及融合
    2.5 过敏原和抗原性评估
    2.6 多表位疫苗的理化参数及N-糖基化位点
    2.7 多表位疫苗的的二级结构
    2.8 多表位疫苗三级结构预测、细化和验证
    2.9 三级结构表位作图
    2.10 用于疫苗稳定性二硫化物设计
    2.11 疫苗构建体与免疫受体的分子对接
    2.12 密码子优化和silico克隆
3 讨论



本文编号：3736854