一株塞内卡病毒A全基因组序列测定与致病性分析
发布时间:2023-03-26 20:33
本研究旨在明确塞内卡病毒A(Senecavirus A, SVA)FJLY株的基因组特性及其与其他毒株的同源性关系,并了解SVA-FJLY株的致病性。以分离自福建省某养殖场中的一株SVA-FJLY株为研究对象,参照其原型毒株SVV-001(GenBank No.DQ641257.1)全基因组序列设计5对引物,通过RT-PCR扩增、测序、拼接,获得SVA-FJLY株全基因组序列并进行序列分析;并通过滴鼻攻毒3~4周龄仔猪。结果表明,SVA-FJLY株基因组全长7 275 bp(不包括PolyA),SVA-FJLY株基因组存在一个多聚蛋白、VP1蛋白和VP2蛋白。SVA-FJLY株与参考毒株之间的基因组一级结构有较高的相似性,与HeB01-2017株(MF967574.1)相似性最高,达98.5%;而与SVA原型毒株SVV-001株(DQ641257.1)的相似性较低,为93.9%。SVA-FJLY株与国内几个毒株属于同一个分支,与国内的HeB01-2017株亲缘关系最近,同时与国外Colombia-2016株(KX857728.1)的亲缘关系最近。通过动物试验发现试验组猪攻毒10 d后,...
【文章页数】:7 页
【文章目录】:
1 材料与方法
1.1 病毒和试验动物
1.2 主要试剂
1.3 引物
1.4 RNA提取
1.5 RT-PCR
1.6 目的基因回收与测序
1.7 致病性试验
2 结 果
2.1 目的基因扩增
2.2 序列测定与拼接
2.3 SVA-FJLY株与参考毒株相似性比较
2.4 致病性试验
3 讨 论
4 结 论
本文编号:3771679
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1 材料与方法
1.1 病毒和试验动物
1.2 主要试剂
1.3 引物
1.4 RNA提取
1.5 RT-PCR
1.6 目的基因回收与测序
1.7 致病性试验
2 结 果
2.1 目的基因扩增
2.2 序列测定与拼接
2.3 SVA-FJLY株与参考毒株相似性比较
2.4 致病性试验
3 讨 论
4 结 论
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