家兔PPARγ和MYF5基因多态性及其与部分经济性状的关联研究
发布时间：2023-05-06 23:43
过氧化物酶体增殖物激活受体γ (peroxisome proliferator-activatived receptors, PPARγ)在脂肪细胞分化、脂肪代谢、胰岛素敏感性、糖代谢和能量平衡等过程中起重要的调节作用；而生肌因子5(myogenic factor 5, MYF5)调节肌肉定型、增殖、分化及生后肌肉生长。本试验采用直接测序方法检测PPARy和MYF5 2个基因编码区的变异位点,并用飞行质谱分型技术对235只家兔(伊拉兔93只,香槟兔81只,天府黑兔61只)候选SNPs进行基因分型,筛选出对经济性状具有遗传效应的SNPs,然后用271只新西兰兔扩大样本验证关联性,最后通过定量进一步研究PPARy基因的作用机制,以期筛选出可用于家兔分子育种的遗传标记。试验结果如下：1.通过直接测序在家兔PPARy基因编码区检测到1个同义突变(c.207A>C)；在MYF5基因编码区检测到2个同义突变(c.708C>T、c.66G>A)和1个非同义突变(c.571T>C),c.571T>C导致氨基酸由丝氨酸变为脯氨酸；而c.708C>T位点的|ΔRSCU|...
【文章页数】：69 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
1 文献综述
1.1 国内外兔业的发展现状
1.2 家兔生长发育特点及兔肉的营养价值
1.3 影响家兔生长和兔肉质量的因素
1.4 PPARγ基因研究进展
1.4.1 PPAR家族
1.4.2 PPARγ基因简介
1.4.3 PPARγ生物学功能
1.4.4 PPARγ基因在畜禽中的研究进展
1.5 MYF5基因研究进展
1.5.1 MYOD基因家族
1.5.2 MYF5基因简介
1.5.3 MYF5生物学功能
1.5.4 MYF5基因在畜禽中的研究进展
1.6 Sequenom MassARRAYTMSNP基因分型
1.7 候选基因法在育种中的应用
1.8 试验研究目的和主要内容
1.8.1 试验目的
1.8.2 试验主要内容
1.8.3 试验技术方案流程
2 材料与方法
2.1 试验材料
2.1.1 试验动物
2.1.2 耳组织及肝组织采集
2.2 主要试剂与仪器
2.2.1 主要试剂及试剂配制
2.2.2 主要仪器
2.3 试验方法
2.3.1 生长性状测定
2.3.2 全基因组DNA提取及检测
2.3.3 肝组织总RNA提取及检测
2.3.4 cDNA的合成
2.3.5 目的基因扩增
2.3.6 Sequenom MassARRAYTMSNP基因分型
2.3.7 PCR-RFLP基因分型
2.3.8 荧光定量
2.3.9 数据处理
3 试验结果
3.1 全基因组DNA提取以及肝脏组织总RNA提取结果
3.2 变异位点检测
3.3 候选SNP筛选
3.4 质谱分型结果
3.5 酶切分型结果
3.6 遗传结构分析结果
C位点基因型和等位基因频率"> 3.6.1 PPARγ c.207A>C位点基因型和等位基因频率
C位点基因型和等位基因频率"> 3.6.2 MYF5 c.571T>C位点基因型和等位基因频率
T位点基因型和等位基因频率"> 3.6.3 MYF5 c.708C>T位点基因型和等位基因频率
3.7 关联性分析结果
C与家兔经济性状的关联分析"> 3.7.1 PPARγ c.207A>C与家兔经济性状的关联分析
C与家兔经济性状的关联分析"> 3.7.2 MYF5 c.571T>C与家兔经济性状的关联分析
T与家兔经济性状的关联分析"> 3.7.3 MYF5 c.708C>T与家兔经济性状的关联分析
C位点不同基因型PPARγ基因mRNA相对表达量"> 3.8 不同日龄阶段和PPARγc.207A>C位点不同基因型PPARγ基因mRNA相对表达量
3.8.1 标准曲线绘制和熔解曲线获得
3.8.2 不同日龄阶段PPARγ基因mRNA表达量差异
C位点不同基因型mRNA表达量差异"> 3.8.3 PPARγ c.207A>C位点不同基因型mRNA表达量差异
4 讨论
4.1 候选基因选择
4.2 基因多态性与家兔经济性状相关
4.2.1 PPARγ基因多态性与家兔经济性状相关
4.2.2 MYF5基因多态性与家兔经济性状相关
4.3 PPARγ基因mRNA表达量的变化
5 结论
6 展望
参考文献
致谢
攻读硕士期间发表文章情况
本文编号：3809826
【文章页数】：69 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
1 文献综述
1.1 国内外兔业的发展现状
1.2 家兔生长发育特点及兔肉的营养价值
1.3 影响家兔生长和兔肉质量的因素
1.4 PPARγ基因研究进展
1.4.1 PPAR家族
1.4.2 PPARγ基因简介
1.4.3 PPARγ生物学功能
1.4.4 PPARγ基因在畜禽中的研究进展
1.5 MYF5基因研究进展
1.5.1 MYOD基因家族
1.5.2 MYF5基因简介
1.5.3 MYF5生物学功能
1.5.4 MYF5基因在畜禽中的研究进展
1.6 Sequenom MassARRAYTMSNP基因分型
1.7 候选基因法在育种中的应用
1.8 试验研究目的和主要内容
1.8.1 试验目的
1.8.2 试验主要内容
1.8.3 试验技术方案流程
2 材料与方法
2.1 试验材料
2.1.1 试验动物
2.1.2 耳组织及肝组织采集
2.2 主要试剂与仪器
2.2.1 主要试剂及试剂配制
2.2.2 主要仪器
2.3 试验方法
2.3.1 生长性状测定
2.3.2 全基因组DNA提取及检测
2.3.3 肝组织总RNA提取及检测
2.3.4 cDNA的合成
2.3.5 目的基因扩增
2.3.6 Sequenom MassARRAYTMSNP基因分型
2.3.7 PCR-RFLP基因分型
2.3.8 荧光定量
2.3.9 数据处理
3 试验结果
3.1 全基因组DNA提取以及肝脏组织总RNA提取结果
3.2 变异位点检测
3.3 候选SNP筛选
3.4 质谱分型结果
3.5 酶切分型结果
3.6 遗传结构分析结果
C位点基因型和等位基因频率"> 3.6.1 PPARγ c.207A>C位点基因型和等位基因频率
C位点基因型和等位基因频率"> 3.6.2 MYF5 c.571T>C位点基因型和等位基因频率
T位点基因型和等位基因频率"> 3.6.3 MYF5 c.708C>T位点基因型和等位基因频率
3.7 关联性分析结果
C与家兔经济性状的关联分析"> 3.7.1 PPARγ c.207A>C与家兔经济性状的关联分析
C与家兔经济性状的关联分析"> 3.7.2 MYF5 c.571T>C与家兔经济性状的关联分析
T与家兔经济性状的关联分析"> 3.7.3 MYF5 c.708C>T与家兔经济性状的关联分析
C位点不同基因型PPARγ基因mRNA相对表达量"> 3.8 不同日龄阶段和PPARγc.207A>C位点不同基因型PPARγ基因mRNA相对表达量
3.8.1 标准曲线绘制和熔解曲线获得
3.8.2 不同日龄阶段PPARγ基因mRNA表达量差异
C位点不同基因型mRNA表达量差异"> 3.8.3 PPARγ c.207A>C位点不同基因型mRNA表达量差异
4 讨论
4.1 候选基因选择
4.2 基因多态性与家兔经济性状相关
4.2.1 PPARγ基因多态性与家兔经济性状相关
4.2.2 MYF5基因多态性与家兔经济性状相关
4.3 PPARγ基因mRNA表达量的变化
5 结论
6 展望
参考文献
致谢
攻读硕士期间发表文章情况
本文编号：3809826
本文链接：https://www.wllwen.com/yixuelunwen/dongwuyixue/3809826.html
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