猪心肌和骨骼肌microRNA表达谱分析与比较

发布时间：2023-05-07 06:54

　　MicroRNA (miRNA)是非编码小RNA家族的重要成员,长为22nt左右,它能负调控靶基因的表达。许多证据都证明了miRNA在肌肉的增殖,分化和发育的过程中都起着十分重要的作用。心肌和骨骼肌(如：背最长肌和腰大肌)同属横纹肌,但是它们在生物个体内所行使的功能差异却很大。猪在畜牧生产和医学研究领域都有非常重要的价值,且心肌与骨骼肌在miRNA表达谱上的研究报道都比较少。本研究利用Illumina高通量测序技术平台构建了3只210日龄雌性长白猪的心肌,背最长肌和腰大肌三个组织的小RNA文库,得到的结果如下：1)心肌,背最长肌和腰大肌三个文库共检测得到56 M的原始数据,其中高质量读段(high-quality reads)在心肌,背最长肌和腰大肌分别为20.31 M,15.87 M和17,93 M,这些测序读段分别占了原始数据的94.12%,95.48%和97.14%；2)三个文库共检测得到907个非冗余的miRNA (unique miRNAs),其中有441个为三个库共同表达,利用IDEG6进行差异显著性检验,发现123个miRNA为三个文库差异表达的miRNA (P<1...

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【学位级别】：硕士

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摘要
Abstract
1 文献综述
    1.1 心肌与骨骼肌
    1.2 猪是典型的的生物学研究模型
    1.3 MicroRNA研究进展
        1.3.1 MicroRNA的发现
        1.3.2 MicroRNA的生物合成
        1.3.3 MicroRNA的作用机制
        1.3.4 MicroRNA的典型特点
        1.3.5 MicroRNA的研究方法
    1.4 MicroRNA对肌肉的调控
        1.4.1 MicroRNA的生成对肌肉的作用
        1.4.2 MicroRNA影响肌肉生长发育
        1.4.3 MicroRNA与肌肉相关疾病
    1.5 高通量测序对猪microRNA研究的推动
    1.6 本研究的意义和主要研究内容
        1.6.1 研究意义
        1.6.2 主要研究内容
2 材料与方法
    2.1 试验材料
        2.1.1 样品采集
        2.1.2 数据库和生物软件
        2.1.3 主要试剂
        2.1.4 主要仪器
    2.2 试验方法
        2.2.1 组织样品准备
        2.2.2 高通量测序及生物信息学分析
        2.2.3 荧光定量PCR分析
3 结果与分析
    3.1 Total RNA提取结果
    3.2 测序数据概述
    3.3 miRNA表达谱鉴定
    3.4 miRNA在三个文库的差异表达分析
    3.5 差异表达miRNA的生物学功能预测
    3.6 与信号通路相关的miRNA和mRNA
    3.7 高通量数据验证
4 讨论
    4.1 高通量测序结果可靠性
    4.2 心肌与两种骨骼肌的差异性
    4.3 高表达的miRNA预示了重要的生物学功能
    4.4 胰岛素信号通路miRNA-mRNA调控网络
    4.5 钙信号通路miRNA-mRNA调控网络
5 结论
参考文献
致谢
攻读学位期间发表的学术论文



本文编号：3810504