肉牛脂肪沉积MiRNA的筛选及MiR-26a在不同部位中的表达分析

发布时间：2023-05-18 04:29

　　MicroRNA(miRNA)是一类由内源基因编码的长度约为20-24个核苷酸的非编码单链RNA分子,可以通过RNA诱导沉默复合体抑制靶基因的翻译或降解mRNA来调控蛋白的表达,越来越多的体内以及体外实验都证实了 miRNA在脂肪形成中起到非常重要的作用。本试验以延边黄牛为研究对象,采集60头在相同条件下育肥至30月龄的延边黄牛阉牛背最长肌组织,分别测定脂肪含量,并经数据统计分析,选出差异极显著的高脂肪延边黄牛10头、低脂肪延边黄牛10头,并根据大理石花纹图谱从中选取高脂肪组、低脂肪组各3头做miRNA-seq和RNA-seq,从而筛选了与脂肪沉积相关表达差异的miRNA并应用miRanda生物学软件预测其可能存在的靶基因,并对差异靶基因进行GO分析和KEGG分析,然后对测序结果进行了qRT-PCR验证,最后分析miRNA-26a在延边黄牛不同部位中表达的规律。进一步阐明miRNA在动物机体中肌内脂肪生长发育过程中起到的调控作用,为今后延边黄牛肉质性状的遗传机理和高档牛肉生产提供了理论基础。本研究主要结果如下:1、高低脂肪组背最长肌组织miRNA-seq结果表明:共有327个miRNA...

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【学位级别】：硕士

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摘要
Abstract
第一章 前言
    1.1 延边黄牛发展概况
    1.2 肌内脂肪
    1.3 miRNA简介
        1.3.1 miRNA的发现及其形成机制
        1.3.2 miRNA的研究方法
        1.3.3 miRNA的研究进展
    1.4 高通量测序在牛miRNA研究中的应用
第二章 高低脂肪组miRNA-seq筛选差异miRNA与靶基因预测
    2.1 试验材料
        2.1.1 试验动物
        2.1.2 样品采集
        2.1.3 试验分组
    2.2 试验方法
        2.2.1 肉质性状测定
        2.2.2 miRNA-Seq
    2.3 结果与分析
        2.3.1 测序数据
        2.3.2 延边黄牛高低脂肪组背最长肌差异表达miRNA的筛选
        2.3.3 差异表达miRNA的聚类分析结果
        2.3.4 差异表达miRNA的靶基因预测
        2.3.5 差异miRNA靶基因的GO分析和KEGG分析
    2.4 讨论
    2.5 本章小结
第三章 miRNA-seq结果的荧光定量PCR验证
    3.1 试验材料
        3.1.1 试验动物
        3.1.2 样品采集
    3.2 试验方法
        3.2.1 引物设计与合成
        3.2.2 miRNA提取与质检
        3.2.3 反转录
        3.2.4 qRT-PCR
        3.2.5 数据分析
    3.3 结果与分析
        3.3.1 miRNA提取结果
        3.3.2 差异表达miRNA的qRT-PCR验证
    3.4 讨论
    3.5 本章小结
第四章 miR-26a在延边黄牛不同部位中表达的规律分析
    4.1 试验材料
        4.1.1 试验样品
        4.1.2 样品采集
    4.2 试验方法
        4.2.1 miRNA提取与质检
        4.2.2 反转录
        4.2.3 qRT-PCR
        4.2.4 数据分析
    4.3 结果与分析
        4.3.1 miRNA提取结果
        4.3.2 miR-26a在高低脂肪组不同部位中的表达
    4.4 讨论
    4.5 本章小结
结论
参考文献
致谢



本文编号：3818677