枯草期放牧东宝黑头羊瘤胃内环境参数及瘤胃细菌多样性分析

发布时间：2023-06-02 02:43

　　试验旨在研究枯草期放牧东宝黑头羊瘤胃内环境参数及瘤胃细菌多样性。采集枯草期牧草样品,测定常规营养成分含量,选取6只体重为(45.24±1.25)kg的2岁全年放牧的东宝黑头羊(公母各半),进行耳牌标记,在枯草期放牧前空腹经口腔采集瘤胃液,用于分析瘤胃内环境参数和瘤胃细菌多样性。结果表明,东宝黑头羊瘤胃液pH为6.65,氨态氮(NH3-N)浓度50.30 mg/L,乙酸/丙酸4.43;6个样本共获得290 868条高质量16S rDNA序列,479.67个分类操作单元(OTU),东宝黑头羊瘤胃细菌丰富度指数Ace指数、Chao1指数分别为523.31、533.79,α-多样性指数Shannon指数、Simpson指数分别为6.39、0.96;经物种注释,共有15个门23个纲29个目34个科87个属被鉴定。在门水平,拟杆菌门(Bacteroidetes,75.75%)、厚壁菌门(Firmicutes,15.62%)含量最多;在科水平,主要包括理研菌科(Rikenellaceae,45.89%)、普雷沃氏菌科(Prevotellaceae,19.18%);在属水平,理研菌科RC9肠道群(Ri...

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 试验地点及试验设计
    1.2 样品采集
        1.2.1 牧草采集
        1.2.2 瘤胃液采集
    1.3 样品测定
        1.3.1 牧草营养成分
        1.3.2 瘤胃内环境参数
        1.3.3 DNA提取及Mi Seq测序
    1.4 生物信息学分析
2 结果与分析
    2.1 瘤胃内环境参数
    2.2 OTU聚类和α-多样性分析
    2.3 菌群结构分析
3 小结与讨论



本文编号：3827509