广西外观正常猪群中博卡病毒检测及全基因遗传演化分析

发布时间：2023-06-04 01:23

　　为掌握广西外观正常猪群中博卡病毒(PBoV)的感染情况,本研究采用PCR方法对采自广西境内的274份1～2月龄保育猪血清、咽拭子和肛拭子样品进行检测。结果显示:3种样品的阳性率分别为1.9%(2/106)、83.3%(75/90)和82.1%(64/78),不同PBoV基因群的检出率分别为G3(47.4%,130/274)>G2(32.8%,90/274)>G1(20.1%,55/274),说明PBoVG3是广西PBoV流行的主要基因群;不同基因群的混合感染情况普遍存在,G2+G3二重感染率最高,为17.9%(49/274);从PBoV阳性样品中扩增获得8条PBoV全基因序列;8个毒株分别处于PBoVG1、PBoVG2和PBoVG3三个进化分支,PBoVG2和PBoVG3的6个毒株均包括与磷酸酯酶A2(PLA2)活性相关的保守氨基酸序列HDXXY和YXGXF。本研究结果为PBoV的进一步防控提供了数据信息和科学依据。

【文章页数】：10 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 样品采集
    1.2 主要试剂
    1.3 引物设计和合成
    1.4 病毒DNA提取
    1.5 PCR扩增
    1.6 测序和序列分析
    1.7 统计分析
2 结果
    2.1 不同规模猪场PBoV检测
    2.2 PBoV全基因组扩增与分析
    2.3 遗传进化分析
    2.4 同源性分析
    2.5 PLA2关键氨基酸序列分析
3 讨论



本文编号：3830411