基于LC-MS技术的患乳腺癌猫血清代谢组学分析

发布时间：2024-04-11 23:18

　　本试验旨在研究患乳腺癌猫与健康猫体内差异代谢物的变化情况,并探讨差异代谢物与猫乳腺癌发生之间的关系。本试验选取临床收集的经组织病理学确诊的猫乳腺癌血清样本6例作为试验组(T组),同时选取年龄相似,品种相同的健康猫血清6例作为对照组(C组)。运用超高效液相色谱质谱联用技术(liquid chromatography-mass spectrometry,LC-MS)对两组猫的血清样本进行检测,采用无监督的主成分分析(principal component analysis, PCA)、正交偏最小二乘法-判别分析(orthogonal projections to latent structures-discriminant analysis,OPLS-DA)及学生t检验(Student’s t-test)筛选出差异代谢物,然后再对筛选出的差异代谢物进行层次聚类分析(hierarchical clustering analysis,HCA),并进行差异代谢物的KEGG注释及差异代谢物的代谢通路分析。结果表明,在两组样本中共定性到159种差异代谢物。与C组相比,在T组中有49种差异代谢物出现下...

【文章页数】：9 页

【部分图文】：

图2差异代谢物筛选火山图

通过对筛选出的差异代谢物进行定性,共定性到159种差异代谢物,与C组相比,T组中有49种下调,110种上调。通过以上分析得到的差异代谢物,在生物学上往往具有结果和功能相似性/互补性,或者受同一代谢通路的正调控/负调控,表现为在不同试验组间具有相似或相反的表达特征。对这类特征进行H....

图3HCA热力图

代谢反应及其调控并不单独进行,往往会形成复杂的通路和网络,它们的相互影响和相互调控最终导致代谢组发生系统性的改变。KEGG数据库以基因和基因组的功能信息为基础,以代谢反应为线索,串联可能的代谢途径及对应的调控蛋白,以图解的方式展示细胞生理生化过程。将筛选出的全部差异代谢物对KEG....

图4差异代谢通路气泡图

表1猫乳腺肿癌关键差异代谢产物Table1Keydifferentialmetabolitesoffelinemammarycarcinomas差异代谢物DifferentialmetabolitesP值PvalueVIP值VIPvalueFold....

图55种标志性差异代谢物互作网络图

图4差异代谢通路气泡图表25种差异代谢产物代谢通路归属Table2Metabolicpathwaysof5differentialmetabolites差异代谢物DifferentialmetabolitesKEGGID代谢通路名称Metabolic....

本文编号：3951297