牛miR-30-5p在骨骼肌中的表达与功能研究
本文关键词:牛miR-30-5p在骨骼肌中的表达与功能研究,由笔耕文化传播整理发布。
【摘要】:MicroRNAs(miRNAs)是一类长度只有22个左右核苷酸的单链非编码RNA。现已表明,miRNA在肌肉的生长发育过程中也发挥着关键性的作用。TargetScan预测MBNL基因家族为miR-30-5p靶基因。MBNL蛋白家族成员均为可变剪切调控因子,其中MBNL1能够使肌肉相关基因INSR的mRNA中exon11和Trim55的mRNA中的exon9在转录过程中不被切掉,而INSR被发现能够参与到与肌肉发育有关的信号通路中。MBNL1和MBNL3被报道在肌肉发育过程中具有重要的功能。本研究通过生物信息学的方法分析了miR-30-5p中的三个成员的在染色体上的位置及其相互间的保守性以及各自物种间的保守性。利用qPCR、Western Blot、siRNA干扰及双荧光素酶报告载体系统的方法分别研究了mi R-30-5p在牛心、肝、脾、肺、肾、骨骼肌和脂肪等组织中的表达谱、其在肌肉分化中的作用,验证了其与其靶基因MBNL之间的靶向关系、分析了MBNL1对肌肉分化的影响,探究了miR-30-5p对MBNL1下游基因INSR和Trim55基因可变剪切的影响。本研究的实验结果如下:(1)通过序列保守性分析,发现miR-30a-5p、miR-30b-5p和miR-30e-5p之间以及它们在人、小鼠和牛的物种间的保守性都很高;(2)胎牛、犊牛和成年牛不同组织(心、肝、脾、肺、肾、骨骼肌和脂肪)的表达谱分析结果显示,miR-30-5p在心、肺、肾和骨骼肌中表达量较高,且miR-30b-5p在胎牛、犊牛和成年牛之间的表达量有显著性的差异(p0.05),显示了miR-30-5p在肌肉发育过程中所具有的重要作用;(3)成功构建了mi R-30a-5p、miR-30b-5p和miR-30e-5p的pcDNA3.1(+)的过表达载体,成功构建了MBNL1、MBNL2和MBNL3的3’UTR片段的荧光素酶报告载体及其突变型载体;(4)在C2C12细胞中过表达miR-30-5p,发现肌肉分化标记分子MyoG和MHC的mRNA表达量显著下降(p0.05),Western Blot实验证明MyoG和MHC的蛋白表达量也得到抑制,标记分子的表达量被下调充分证明了,miR-30-5p能够抑制肌肉的分化;(5)双荧光素酶报告实验和Western Blot的实验结果证实了这一预测结果,即mi R-30a-5p和miR-30e-5p能够下调MBNL1、MBNL2和MBNL3基因的表达量(p0.05),mi R-30b-5p能够下调MBNL1和MBNL2的表达量(p0.05);(6)RNAi实验中,MyoG和MHC的mRNA(p0.05)和蛋白水平均被下调,证明了MBNL1能够促进肌肉的分化;(7)mi R-30-5p过表达载体转染C2C12细胞后,qPCR检测发现INSR的exon11和Trim55的exon9的表达量下降(p0.05),证明了该miR-30-5p能够促进INSR的成熟mRNA中exon11的缺失,促进Trim55成熟mRNA中exon9的缺失。综上所述,mi R-30-5p能够靶向下调MBNL的表达量,进而能够抑制肌肉的分化。
【关键词】:牛 miR-30-5p 肌肉分化 MBNL 可变剪切
【学位授予单位】:西北农林科技大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2016
【分类号】:S823
【目录】:
- 摘要6-8
- ABSTRACT8-13
- 文献综述13-25
- 第一章 骨骼肌发育概述13-19
- 1.1 骨骼肌的发育13
- 1.2 骨骼肌生长发育相关通路13-16
- 1.2.1 肌肉的肥大14
- 1.2.2 PI3K/Akt信号通路14
- 1.2.3 EPK信号通路14
- 1.2.4 mTOR-S6K信号通路14-16
- 1.3 骨骼肌的病理研究16
- 1.4 骨骼肌发育相关基因MBNL研究进展16-19
- 第二章 MicroRNA (mi RNA)研究进展19-25
- 2.1 mi RNA的表达19
- 2.2 mi RNA的转录19-20
- 2.3 mi RNA的成熟20-21
- 2.4 RISC的装配21
- 2.5 mRNA的降解和蛋白质翻译过程的抑制21-22
- 2.6 mi RNA对肌肉发育的影响22
- 2.7 mi RNA的定量检测22-23
- 2.8 miR-30的研究进展23-24
- 本研究的目的意义24-25
- 实验部分25-65
- 第三章 miR305p表达谱的研究25-32
- 3.1 实验材料25
- 3.2 实验仪器与设备25
- 3.3 试剂及试剂盒25
- 3.4 实验方法25-26
- 3.4.1 miR305p的生物信息学分析25
- 3.4.2 miR305p在胎牛、犊牛和成年牛各组织中的表达25-26
- 3.5 结果与分析26-30
- 3.5.1 miR305p的生物信息学分析26-28
- 3.5.1.1 1miR-30-5pp在基因组组位置分析26-27
- 3.5.1.2 miR305p各成员间保守性分析27
- 3.5.1.3 miR305p物种间保守性分析27-28
- 3.5.2 miR305p的表达谱研究28-30
- 3.6 讨论30-31
- 3.7 小结31-32
- 第四章 miR305p对骨骼肌肌肉分化的影响32-40
- 4.1 实验材料32
- 4.2 实验仪器与设备32
- 4.3 试剂及试剂盒32
- 4.4 实验方法32-36
- 4.4.1 构建mi R305p过表达载体32-34
- 4.4.2 miR305p前体PCDNA3.1(+)载体构建34-35
- 4.4.3 miR305p对肌肉分化影响的研究35-36
- 4.5 结果与分析36-39
- 4.5.1 pre-miR305p过表达载体pcDNA3.1(+)的构建36-38
- 4.5.2 miR305p过表达载体表达成熟miRNA能力的检测38
- 4.5.3 miR305p对肌肉分化的影响38-39
- 4.6 讨论39
- 4.7 小结39-40
- 第五章 miR305p直接靶向MBNL40-61
- 5.1 实验材料40
- 5.2 实验仪器与设备40
- 5.3 试剂及试剂盒40
- 5.4 实验方法40-46
- 5.4.1 miR305p与MBNL表达量的相关关系40
- 5.4.2 双荧光素酶实验40-44
- 5.4.3 MBNL基因mRNA及蛋白的表达量:44-45
- 5.4.4 MBNL1促进肌肉分化45-46
- 5.5 结果与分析46-58
- 5.5.1 miR305p与MBNL表达量的相关关系46-49
- 5.5.2 MBNL 3’UTR的双荧光素酶报告载体的构建49-50
- 5.5.3 MBNL3’UTR突变型荧光报告载体载体构建50-52
- 5.5.4 miR305p直接靶向MBNL152-54
- 5.5.5 miR305p直接靶向MBNL254-56
- 5.5.6 miR305p直接靶向MBNL356-57
- 5.5.7 MBNL1促进肌肉分化57-58
- 5.6 讨论58-60
- 5.7 小结60-61
- 第六章 miR305p调节INSR和Trim55的可变剪切61-65
- 6.1 实验材料61
- 6.2 实验仪器与设备61
- 6.3 试剂及试剂盒61
- 6.4 实验方法61-62
- 6.4.1 细胞培养与转染61
- 6.4.2 定量检测INSR和Trim55的mRNA表达量61-62
- 6.5 结果与分析62-63
- 6.6 讨论63-64
- 6.7 小结64-65
- 结论与创新点65-66
- 结论65
- 创新点65-66
- 参考文献66-74
- 附录74-81
- 致谢81-82
- 作者简介82
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