版纳微型猪近交系PSP-I基因的克隆及生物信息学分析

发布时间：2024-11-02 02:38

　　 本研究旨在克隆版纳微型猪近交系(BMI)PSP-I基因并对其进行生物信息学分析。通过RT-PCR方法从15月龄BMI睾丸组织中克隆PSP-I基因,利用生物信息学方法分析其序列组成特征。结果表明:克隆的PSP-I基因mRNA序列长420 bp,其中CDS长241 bp,编码79个氨基酸,推测编码蛋白分子量为8.588 9 ku,理论等电点为8.64,酸性氨基酸(Asp+Glu)有8个,碱性氨基酸(Lys+Arg)有10个;PSP-I蛋白质属于稳定蛋白,为疏水蛋白,无跨膜信号肽位点,存在1个N-糖基化位点和8个潜在磷酸化位点;无规则卷曲是PSP-I蛋白的主要结构。

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【部分图文】：

将PSP-I基因进行扩增，特异性片段为420bp，经电泳检测，目的基因片段大小与预期片段大小一致（图1）。2.2PSP-I基因序列分析

PSP-I蛋白质不稳定指数为34.99，属于稳定蛋白；脂溶指数为90.00，总的亲水性平均系数（GrandAverageOfHydropathicity,GRAVY）为-0.241，具有疏水性。使用SignalP4.1对PSP-I蛋白进行预测，表明PSP-I蛋白没有信号....

图4PSP-I蛋白跨膜信号肽位点预测NetPhos2.0预测表明，PSP-I蛋白存在8个磷酸化位点，其中5个丝氨酸（Ser）磷酸化位点（A51、A52、A62、A67、A77）、0个苏氨酸（Thr）磷酸化位点、3个酪氨酸（Tyr）活性位点（A7、A24、A69）（图6）。

NetPhos2.0预测表明，PSP-I蛋白存在8个磷酸化位点，其中5个丝氨酸（Ser）磷酸化位点（A51、A52、A62、A67、A77）、0个苏氨酸（Thr）磷酸化位点、3个酪氨酸（Tyr）活性位点（A7、A24、A69）（图6）。用SOPMA方法预测的PSP-I蛋白的二级....

本文编号：4008890